Název:
Homologsearch: R Package For Identifying Homologous Sequences Between Model And Non-Model Organisms
Autoři:
Musilová, Jana Typ dokumentu: Příspěvky z konference
Jazyk:
eng
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt:
In this paper, I present the R package HomologSearch. The package serves for searching similarities between two sequences (protein or nucleotide) in a fasta format. The evaluation is computed using the BLAST algorithm and output is a table of homologous locus tags and genes (if available). The HomologSearch is available in the GitHub repository under the name ‘Jana- Mus/HomologSearch’ and can be installed as a library into the R language.
Klíčová slova:
R package; sequence homology; sequence similarity Zdrojový dokument: Proceedings I of the 26st Conference STUDENT EEICT 2020: General papers, ISBN 978-80-214-5867-3
Instituce: Vysoké učení technické v Brně
(web)
Informace o dostupnosti dokumentu:
Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT. Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/200587