Original title: Automatizace výpočtů genotypových dat
Translated title: Automation of genotype data calculations
Authors: Vybíhal, Adam ; Richter, Miloslav (referee) ; Štohl, Radek (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2021
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Cílem této práce je automatizace práce s programy pro zkoumání struktur populací pomocí genotypových dat. Konkrétně jsou popsány vlastnosti čtyř programů, Structure, Structure Harvester, CLUMPP a distruct. V rámci práce je pak navržen proces automatizace práce s těmito programy. Na bázi tohoto návrhu je následně vytvořena aplikace na platformě .NET, která uživateli usnadňuje práci se zmíněnými programy. Navržená aplikace poskytuje uživateli grafické rozhraní pro nahrávání vstupních souborů, zadávání potřebných parametrů, nastavení automatizovaného spouštění jednotlivých programů a zobrazení jejich výsledků. The goal of this paper is to automate work with programs for the study of population structure using genotype data. Specifically, we describe properties of four programs for this use, Structure, Structure Harvester, CLUMPP and distruct. There's proposed a process of automation of work with these programs within the paper. Based on proposed process, an application is then created on the .NET platform, which allows you to work with mentioned software. This application provides a graphical user interface for creating input files, entering the necessary parameters, setting up automatic execution of individual programs and displaying their results.
Keywords: CLUMPP; distruct; genotype data; population structure; Structure; Structure Harvester; CLUMPP; distruct; genotypová data; Structure; Structure Harvester; struktura populace

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/198047

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-443464


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses