Název:
Interaktivní prostředí pro analýzu dat z průtokové cytometrie
Překlad názvu:
Interactive environment for flow-cytometry data analysis
Autoři:
Molnárová, Soňa ; Kratochvíl, Miroslav (vedoucí práce) ; Pacovský, Jan (oponent) Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2020
Jazyk:
eng
Abstrakt: Pr·toková cytometrie je metoda pro měření chemických vlastností jed- notlivých buněk v roztoku, s aplikacemi v biologickém a klinickém výzkumu. Nedávny pokrok technologií pr·tokové cytometrie umožňuje mimořádně snadně vyrobit větší soubory dat, které popisují další zajímavé jevy, které vytváří nové výzvy pro zpracování dat a softwaru pro analýzu. Tato práce popisuje a implementuje prototyp softwaru, který zjednodušuje zpracování dat im- plementací interaktivního pipeline editoru pro analýzu, který je navržen tak, aby efektivně zpracovával obrovské soubory dat. Funkcionalita soft- waru je demonstrována implementací nejnovějšího algoritmu analýzy dat a porovnáním efektivity zdroj· s typickým nástrojem pro analýzu v pro- gramu R. Budoucí využití softwaru biology a lékaři je usnadněno poskytnutím jednoduchého rozhraní pro přidávání nových algoritm·, čímž se rozšiřuje funkčnost. 1
Klíčová slova:
bioinformatika; průtoková cytometrie; shlukování; vizualizace; bioinformatics; clustering; flow cytometry; visualisations