Název: Genotypizace bakterií na základě teploty tání oligonukleotidů
Překlad názvu: Bacterial genotyping based on the oligonucleotide melting temperature
Autoři: Šandová, Hana ; Škutková, Helena (oponent) ; Nykrýnová, Markéta (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2020
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Tato bakalářská práce se zabývá genotypizačními metodami, které využívají teplotu tání oligonukleotidů. V teoretické části je popsána DNA, je vysvětlen pojem typizace a jsou zde popsány laboratorní i výpočetní metody genotypizace. V praktické části byly v programovacím prostředí MATLAB navrženy funkce pro výpočet teploty tání ze sekvence a pro jejich spuštění bylo vytvořeno grafické uživatelské prostředí. Dále byla zpracovávána reálná data změřená pro 52 izolátů bakterie Klebsiella pneumoniae poskytnutá FN Brno. Byly porovnávány laboratorně určené teploty tání s teoretickými výpočty. Nakonec bylo zjišťováno, zda je možná klasifikace bakterií shlukovacími metodami na základě teoreticky vypočtených teplot tání oligonukleotidů. This bachelor’s thesis deals with genotyping based on the oligonucleotide melting temperatures. In the theoretical part, DNA, typing, experimental and theoretical genotyping methods are described. The practical part of the thesis deals with a program that is designed to calculate the melting temperatures of sequences based on different methods, and the graphical user interface was created. In the following part, the measured melting temperatures of bacterial isolates of Klebsiella pneumoniae are compared to the theoretically calculated melting temperatures. In the last part of the thesis, the possibility of genotyping using cluster analysis based on the theoretical melting temperatures is explored.
Klíčová slova: DNA; genotypizace; mini-multilokusová sekvenční typizace; Teplota tání; vysokorozlišovací analýza křivek tání; DNA; genotyping; High Resolution Melting analysis; Melting temperature; minim typing

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/190321

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-413469


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce