Název: Klasifikace bakterií z numerických reprezentací genomu
Překlad názvu: Bacterial species delineation based on parameters derived from numerical representations of genome
Autoři: Oweis, Kamil ; Jugas, Robin (oponent) ; Maděránková, Denisa (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2019
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Moderní metody zpracování genomických dat přinášejí kvalitní výsledky, avšak velmi často jsou vykoupeny časovou náročností. A právě proto se tato práce zabývá numerickými metodami zpracování bakteriálního genomu, které by mohly být vhodnou alternativou pro současné metody, a to jak po stránce kvality, tak po stránce výpočetní náročnosti. V práci jsou postupně představeny současné metody pro zpracování genomů in silico a navrženy vhodné numerické reprezentace pro celogenomovou analýzu. Některé z těchto metod jsou naprogramovány a jsou využity v diplomové práci, kde jsou testovány různé matematické a statistické metody, které by mohly vést k úspěšnému druhovému rozlišení bakterií podle numerických reprezentací jejich genomů. Modern methods of processing genomic data yield good results, however they are often redeemed by time consummation. This is mainly the reason why this thesis deals with numerical methods of bacterial genome processing which could be a suitable alternative for current methods, both in terms of quality and computational demands. This thesis presents the current methods used for processing of genomes in silico and proposes suitable numerical presentations for the whole genome analysis. Some of these methods are programmed and used for processing further in this diploma thesis. In it, various mathematical and statistical methods are being tested, ones that could lead to successful species delineation of bacteria by numerical presentations of their genomes.
Klíčová slova: bakterie; genom; metody delineace in silico; Numerické reprezentace bakteriálních genomů; vymezení druhů; bacteria; delineation methods in silico; genome; Numerical representations of bacterial genome; species delineation

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/177637

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-400973


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce