Original title: Basic phylogenetic methods
Translated title: Základní fylogenetické metody
Authors: Vallo, Peter
Document type: Papers
Conference/Event: International Summer School on Computational Biology /4./, Brno (CZ), 2008-05-29 / 2008-05-31
Year: 2008
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
This volume comprises contributions of a team of lecturers, who held their speeches at a course for undergraduate students on computational biology. The particular topic of phylogenetic methods is briefly introduced, covering basics of DNA sequence evolution and tree nomenclature. Methods of tree reconstructions are further explained; both general tree searching algorithms and particular reconstruction methods i.e. distance, parsimony, likelihood and Bayesian approaches. Tento svazek zahrnuje příspěvky týmu autorů, kteří přednášeli na kurzu výpočetní biologie pro pregraduální studenty. Téma fylogenetických metod je stručne uvedeno, pokrývajíc základy evoluce sekvencí DNA a názvosloví stromů. Dále jsou vysvětlovány metody rekonstrukce stromů; jak obecné algoritmy pro hledání stromů, tak i jednotlivé metody rekonstrukce t.j. distanční, parsimonický, věrohodnostní a Bayesiánský přístup.
Keywords: Bayesian analysis; distance methods; maximum likelihood; maximum parsimony; molecular phylogeny
Project no.: CEZ:AV0Z60930519 (CEP)
Host item entry: Proceedings of the 4th International Summer School on Computational Biology, ISBN 978-80-210-4793-8

Institution: Institute of Vertebrate Biology AS ČR (web)
Document availability information: Fulltext is available at the institute of the Academy of Sciences.
Original record: http://hdl.handle.net/11104/0169130

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-39808


The record appears in these collections:
Research > Institutes ASCR > Institute of Vertebrate Biology
Conference materials > Papers