Original title: Aminophenyl- and nirophenyl-labeled DNA. Synthesis by polymerase incorporation of nucleoside triphosphates and electrochemical properties
Translated title: DNA značená aminofenylem a nitrofenylem. Syntéza pomocí enzymatické inkorporace modifikovaných nukleosid trifosfátů, studium elektrochemických vlastností takto značené DNA
Authors: Cahová, Hana ; Havran, Luděk ; Horáková Brázdilová, Petra ; Pivoňková, Hana ; Fojta, Miroslav ; Hocek, Michal
Document type: Papers
Conference/Event: Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components /14./, Český Krumlov (CZ), 2008-06-08 / 2008-06-13
Year: 2008
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
We employed single step aqueous phase Suzuki-Miyaura cross-coupling reactions of halogenated 2'-deoxynucleoside 5'-triphosphates with 3-aminophenyl and 3-nitrophenylboronic acid for synthesis of modified nucleoside triphosphates (dNTPs). These dNTPs were then enzymatically incorporated into DNA in Primer extension experiment (PEX). Electrochemical detection using square-wave voltammetry of single-strand modified oligonucleotides (ONs) bearing 3-aminophenyl and 3-nitrophenyl tag demonstated excellent utilization in labeling of DNA. V této práci jsme využili jednokrokové Suzuki-Miyaura cross-coupling reakce halogenovaných 2'-deoxynukleosid 5'-trifosfátů s 3-aminofenyl a 3-nitrofenylboronovými kyselinami pro syntézu modifikovaných nukleosid trifosfátů (dNTPs). Ty byly následně enzymaticky inkorporovány do DNA v primer extension experimentu (PEX, extenze primeru). Elektrochemická detekce využívající měření cyklické voltametrie jednovlaknové modifikované DNA s navázanými 3-aminofenylovými a 3-nitrofenylovými skupinami se ukázala být velmi vhodnou a přínosnou v oblasti značení DNA.
Keywords: DNA modification; electrochemical labeling of DNA; nucleosides triphosphates
Project no.: CEZ:AV0Z40550506 (CEP), CEZ:AV0Z50040507 (CEP), LC512 (CEP), LC06035 (CEP), GA203/05/0043 (CEP)
Funding provider: GA MŠk, GA MŠk, GA ČR
Host item entry: Chemistry of Nucleic Acid Components, ISBN 978-80-86241-29-6

Institution: Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS ČR (web)
Document availability information: Fulltext is available at the institute of the Academy of Sciences.
Original record: http://hdl.handle.net/11104/0161923

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-38954


The record appears in these collections:
Research > Institutes ASCR > Institute of Organic Chemistry and Biochemistry
Conference materials > Papers