Home > Conference materials > Papers > Aminophenyl- and nirophenyl-labeled DNA. Synthesis by polymerase incorporation of nucleoside triphosphates and electrochemical properties
Original title:
Aminophenyl- and nirophenyl-labeled DNA. Synthesis by polymerase incorporation of nucleoside triphosphates and electrochemical properties
Translated title:
DNA značená aminofenylem a nitrofenylem. Syntéza pomocí enzymatické inkorporace modifikovaných nukleosid trifosfátů, studium elektrochemických vlastností takto značené DNA
Authors:
Cahová, Hana ; Havran, Luděk ; Horáková Brázdilová, Petra ; Pivoňková, Hana ; Fojta, Miroslav ; Hocek, Michal Document type: Papers Conference/Event: Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components /14./, Český Krumlov (CZ), 2008-06-08 / 2008-06-13
Year:
2008
Language:
eng Abstract:
[eng][cze] We employed single step aqueous phase Suzuki-Miyaura cross-coupling reactions of halogenated 2'-deoxynucleoside 5'-triphosphates with 3-aminophenyl and 3-nitrophenylboronic acid for synthesis of modified nucleoside triphosphates (dNTPs). These dNTPs were then enzymatically incorporated into DNA in Primer extension experiment (PEX). Electrochemical detection using square-wave voltammetry of single-strand modified oligonucleotides (ONs) bearing 3-aminophenyl and 3-nitrophenyl tag demonstated excellent utilization in labeling of DNA.V této práci jsme využili jednokrokové Suzuki-Miyaura cross-coupling reakce halogenovaných 2'-deoxynukleosid 5'-trifosfátů s 3-aminofenyl a 3-nitrofenylboronovými kyselinami pro syntézu modifikovaných nukleosid trifosfátů (dNTPs). Ty byly následně enzymaticky inkorporovány do DNA v primer extension experimentu (PEX, extenze primeru). Elektrochemická detekce využívající měření cyklické voltametrie jednovlaknové modifikované DNA s navázanými 3-aminofenylovými a 3-nitrofenylovými skupinami se ukázala být velmi vhodnou a přínosnou v oblasti značení DNA.
Keywords:
DNA modification; electrochemical labeling of DNA; nucleosides triphosphates Project no.: CEZ:AV0Z40550506 (CEP), CEZ:AV0Z50040507 (CEP), LC512 (CEP), LC06035 (CEP), GA203/05/0043 (CEP) Funding provider: GA MŠk, GA MŠk, GA ČR Host item entry: Chemistry of Nucleic Acid Components, ISBN 978-80-86241-29-6
Institution: Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS ČR
(web)
Document availability information: Fulltext is available at the institute of the Academy of Sciences. Original record: http://hdl.handle.net/11104/0161923