Název: Tání dvoušroubovice DNA obsahující methylovaný CpG motiv
Překlad názvu: Melting of a methylated CpG-containing DNA double helix
Autoři: Bušková, Hana ; Římal, Václav (vedoucí práce) ; Hanyková, Lenka (oponent)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2018
Jazyk: eng
Abstrakt: [eng] [cze]
The melting of a DNA double helix into two single strands is a crucial process for life on Earth. Previous experimental data on the self-complementary sequence CTTm5 CGAAG containing 5-methylcytosine suggests that the melting of an oligonucleotide might be a three-state, rather than two-state process. To assess this, 1 H NMR spectra were measured at varied concentrations of the oligonucleotide in temperatures between 274 and 366 K. Through analysis of the chemical shifts of aromatic hydrogens undergoing fast chemical exchange, we have determined that the most likely intermediate state between a double helix and a single stranded random coil is a structure consisting of two oligonucleotide molecules rather than a structured single strand. Rozpad dvoušroubovice DNA na dvě samostatná vlákna je klíčovým procesem pro život na Zemi. Předchozí experimenty na selfkomplementární sekvenci CTTm5CGAAG, obsahující 5-methylcytosin, naznačují odchylky od dvoustavového tání duplexu. V této práci byla měřena 1H spektra jaderné magnetické rezo- nance tohoto oligonukleotidu při několika koncentracích v rozsahu teplot od 274 K do 366 K. Analýzou chemických posuvů aromatických vodíků podléhajících rychlé chemické výměně jsme dospěli k závěru, že nejpravděpodobnějším mezistavem při tání DNA je blíže neurčená struktura sestávající se ze dvou molekul oligonukleotidu.
Klíčová slova: 5-methylcytosin; DNA; NMR; 5-methylcytosine; DNA; NMR

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/100906

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-386826


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce