Název: Preference synonymních kodonů v mitochondriálním genomu
Překlad názvu: Synonymous codon usage bias in mitochondrial genomes
Autoři: Urbanová, Hedvika ; Cicková, Pavlína (oponent) ; Maděránková, Denisa (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2018
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Tato bakalářská práce se zabývá preferencí synonymních kodonů v mitochondriálním genomu. Jsou zde teoreticky rozebrány základní pojmy z oblastí bioinformatiky a genetiky. Kodonová preference je představena spolu s parametry, které ji charakterizují. Praktická část bakalářské práce se zabývá návrhem funkcí pro výpočet parametrů kodonové preference. Mezi naprogramovanými parametry je relativní četnost synonymních kodonů, relativní adaptační index, kodonový adaptační index a homozygotnost kodonů. Dále je provedena analýza kodonové preference u mitochondriálního genomu Homo sapiens. This Bachelors thesis deals with synonymous codon usage bias in mitochondrial genomes. This thesis covers basic terms of bioinformatics and genetics. Codon usage bias is introduced together with parameters that characterize it. Practical part of the thesis is dealing with programs that are designed to calculate parameters of codon usage bias. Programs that are described in this thesis are relative synonymous codon usage, relative adaptation index, codon adaptation index, homozygosity of codons, and effective number of codons. Synonymous codon usage bias in mitochondrial genome of Homo sapiens is analysed.
Klíčová slova: efektivní počet kodonů; homozygotnost kodonů; kodonový adaptační index; mitochondriální DNA; Preference kodonů; relativní adaptační index; relativní četnost synonymních kodonů; codon adaptation index; Codon bias; effective number of codons; homozygosity of codons; mitochondrial DNA; relative adaptation index; relative synonymous codon usage

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/82752

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-378817


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce