Original title: Analýza genetické variability v sekvenačních datech treponemálních kmenů
Translated title: Analysis of genetic variability in sequencing data of Treponema strains
Authors: Bartoň, Vojtěch ; Škutková, Helena (referee) ; Maděránková, Denisa (advisor)
Document type: Master’s theses
Year: 2018
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Tato diplomová práce se zabývá metodami určení genetické variability v sekvenačních datech. Sekvenovaným organismem je několik kmenů bakterie Treponema pallidum. Bakterie byly osekvenovány na platformě Illumina. Navrhujeme postup určení variabilních míst v resekvenovaných genomech a jejich následné zkoumání v rámci jednoho genomu, tak i porovnání napříč všemi zpracovávanými genomy. This diploma thesis is dealing with methods of identification genetic variability in sequencing data. The resarch is targeted to bacterial strains of Treponema pallidum. The sequencing was performed by Illumina platform. There is a proposition of method to identificate variable spots in resequenced genomes and their analysis and comparation across all processed genomes.
Keywords: bioinformatics; genetic variability; heterogeneity; sequencing; Treponema pallidum; bioinformatika; genetická variabilita; heterogenita; sekvenace; Treponema pallidum

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/82050

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-378144


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Master’s theses