Název:
Vliv peptidů odvozených od transmembránových domén proteinů na membrány
Překlad názvu:
The effect of peptides derived from protein transmembrane domains on membranes
Autoři:
Olšinová, Marie ; Cebecauer, Marek (vedoucí práce) ; Obšil, Tomáš (oponent) ; Vácha, Robert (oponent) Typ dokumentu: Disertační práce
Rok:
2018
Jazyk:
eng
Abstrakt: [eng][cze] Rich structure of cell membranes raises broad number of questions regarding the mechanisms driving and regulating processes taking place on membranes. The thesis presents four articles investigating organization of lipid membranes and peptide-lipid interactions. The experiments were performed on model lipid membranes. These simplified systems that partially mimic cell membranes enable to study protein-lipid interactions at the molecular level and membrane physico-chemical properties in a controlled way. Advanced fluorescence techniques such as FCS, TDFS, FLIM and anisotropy were used for the system characterization. First publication describes newly designed fluorescence dyes based on boron dipyrromethene structure, the so- called molecular rotors, which are reported to be viscosity-sensitive probes. Detailed analysis of fluorescence lifetime of excited state of the molecular rotors inserted into lipid membranes showed diverse incorporation of dyes into membranes and their reorientation in membranes of different rigidity. The second part investigates existence of lipid nanodomains in membranes caused by the presence of a cross-linker. Even though standard fluorescence microscopy techniques do not allow direct visualization of the nanodomains, we were able to detect these structures by employment of...Složitá struktura buněčných membrán vyvolává mnoho otázek týkajících se mechanismu procesů relevantních pro správnou funkci membrán. Dizertační práce představuje čtyři články zabývající se organizací lipidových membrán a interakcemi mezi lipidy a peptidy. Experimenty byly prováděny na modelových lipidových membránách. Tyto zjednodušené systémy napodobující buněčné membrány umožňují studium protein-lipidových interakcí na molekulární úrovni a studium fyzikálně-chemických vlastností membrán kontrolovaným způsobem. Pro charakterizaci systému byly použity pokročilé fluorescenční techniky jako FCS, TDFS, FLIM a anizotropie. První publikace popisuje nově navržené fluorescenční značky založené na struktuře boron dipyrromethenu, tzv. molekulární rotory, které jsou využívány jako sondy pro měření viskozity. Podrobná analýza doby života excitovaného stavu molekulárních rotorů zanořených do lipidových membrán ukázala na různou inkorporaci jednolivých značek do membrány a na změnu orientace fluoroforů v membránách o různé rigiditě. Druhá část práce se zabývá studiem vzniku lipidových nanodomén v membráně v přítomnosti cross-linkeru. Přestože standardní fluorescenční mikroskopické techniky neumožňují přímou vizualizaci nanodomén, jejich existenci jsme byli schopni detekovat pomocí FCCS a FLIM-FRET technikami....