Original title: Souvis genetické informace sekvencí DNA s infekčním onemocněním netopýrů
Translated title: Consequences of an infectious disease on genetic information in DNA sequences in bats
Authors: Nováková, Markéta ; Martínková, Natália (advisor) ; Lučan, Radek (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2015
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
White­nose syndrome is an emerging fungal disease of bats causing massive die­offs in North American populations. The fungus causes lesions on bat skin, mainly on noses, ears and wing membranes. The infection by the fungus is accompanied by serious disruption of metabolism and hibernation physiology that is lethal to bats in North America. European bats seem to survive the disease in greater numbers. Since the fungus is probably of European origin, this study assumes that bats in Europe have developed inheritable defence mechanisms to the disease. The infection by the fungus serves as a strong selective pressure. We tested sequences of 7 genes for signs of positive selection using maximum likelihood approach. We detected past positive selection in the gene for transglutaminase 1. Syndrom bílého nosu je plísňové onemocnění netopýrů způsobující masivní úhyny v severoamerických populacích. Infekční plíseň způsobuje léze na kůži netopýrů, převážně na čenichu, uších a létacích blánách. Infekce plísní je doprovázena vážným narušením metabolismu netopýrů a hibernační fyziologie, které jsou smrtelné pro netopýry v Severní Americe. Evropští netopýři nemoc přežívají ve větším počtu. Protože je plíseň pravděpodobně evropského původu, tato studie předpokládá, že u evropských netopýrů se vyvinuly dědičné obranné mechanismy proti syndromu bílého nosu. Infekce plísní způsobující onemocnění představuje silný selekční tlak, v praktické části jsem proto u 7 genů hledala známky pozitivní selekce pomocí metody maximální věrohodnosti. Zjistila jsem vliv pozitivní selekce u genu pro transglutaminázu 1.
Keywords: positive selection; Pseudogymnoascus destructans; white-nose syndrome; pozitivní selekce; Pseudogymnoascus destructans; syndrom bílého nosu

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/69802

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-338930


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses