Název:
Studium epigenetických změn u hematologických malignit
Překlad názvu:
DNA methylation changes in patients with acute myeloid leukemia
Autoři:
Hájková, Hana ; Haškovec, Cedrick (vedoucí práce) ; Hejnar, Jiří (oponent) ; Reiniš, Milan (oponent) Typ dokumentu: Disertační práce
Rok:
2015
Jazyk:
eng
Abstrakt: [eng][cze] DNA methylation is a well-established epigenetic mechanism regulating gene expression. It has essential functions in cells under physiological as well as pathological conditions. In acute myeloid leukemia (AML), aberrant DNA methylation has been confirmed in the pathogenesis and progression of the disease. Changes in DNA methylation of promoters, or other regions, are studied primarily with respect to pathways that are involved in tumor transformation and DNA methylation impact on prognosis. Clinical importance of DNA methylation has been confirmed by a number of recent publications. According to the Cancer Genome Atlas (TCGA) Research Network, mutations of genes involved in DNA methylation are found in 44% of AML patients at diagnosis. However, the impact of these mutations on specific DNA methylation and gene expression remains controversial. We examined 79 AML patients at diagnosis for DNA methylation of 12 selected genes (CDKN2B, CALCA, CDH1, ESR1, SOCS1, MYOD1, DAPK1, TIMP3, ICAM1, TERT, CTNNA1, EGR1) - some of them proved as tumor suppressor genes and 24 HOX genes, and in parallel for mutations in DNMT3A. We observed lower levels of DNA methylation (P<0.0001) as well as lower numbers of concurrently hypermethylated genes (P<0.0001) in patients with DNMT3A mutations. Our study of the impact of...Metylace DNA je epigenetický mechanismus, který se významnou měrou podílí na regulaci genové exprese. Nezastupitelnou roli hraje při fyziologických, ale i patologických buněčných procesech. U akutní myeloidní leukémie (AML) má aberantní metylace DNA důležitou úlohu v patogenezi a progresi onemocnění. Pozměněná úroveň metylace DNA v promotorových a dalších oblastech je zkoumána především s ohledem na objasnění signálních drah zapojených v nádorové transformaci a její význam pro prognózu pacienta. Klinická důležitost metylace DNA byla potvrzena řadou nedávných publikací. Podle dat iniciativy Cancer Genome Atlas (TCGA) se u 44% pacientů s AML při diagnóze nacházejí mutace v genech přímo zapojených do regulace metylace DNA. Nicméně vliv těchto mutací na komplexní změny metylace DNA i genové exprese zůstává nejednoznačný. Vyšetřili jsme metylaci DNA u 12 vybraných genů (CDKN2B, CALCA, CDH1, ESR1, SOCS1, MYOD1, DAPK1, TIMP3, ICAM1, TERT, CTNNA1, EGR1) - některé z nich byly potvrzeny jako tumor supresorové geny a 24 HOX genů společně s mutacemi v genu DNMT3A u 79 pacientů s AML při diagnóze. U pacientů s mutacemi v genu DNMT3A jsme našli nižší úroveň metylace DNA (P<0.0001) i nižší počet současně hypermetylovaných genů (P<0.0001). Dále jsme objevili spojitost mezi vyšší úrovní metylace a lepší prognózou....
host ::
