Název: Charakterizace PTEN domény vybraných forminů II. třídy Arabidopsis
Překlad názvu: Characterization of the PTEN domain of selected Arabidopsis class II formins
Autoři: Přerostová, Sylva ; Cvrčková, Fatima (vedoucí práce) ; Havelková, Lenka (oponent)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2011
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Forminy jsou proteiny usnadňující tvorbu aktinových vláken. Ovlivňují strukturu cytoskeletu a účastní se cytokineze i směrovaného růstu. U Arabidopsis thaliana existují 2 třídy forminů, které obsahují FH1 a FH2 (Formin homology 1 a 2) doménu. Forminy třídy I mají většinou na N konci transmembránovou doménu, díky které mohou interagovat s membránami. Některé forminy třídy II obsahují PTEN doménu (Phosphatase and tensin homolog) odvozenou ze sekvence PTEN proteinů, která zřejmě ztratila funkci fosfatázy. Předpokládá se, že je schopná vazby na membránu, a to přes fosfatázovou část nebo přes C2 doménu. Tato práce byla zaměřena na formin AtFH13 z třídy II u Arabidopsis thaliana a na jeho PTEN doménu. Byly zjišťovány rozdíly mezi mutanty a kontrolou v délce kořenů u semenáčků a ve velikosti semen a semenných obalů. Na délce kořenů byl sledován také vliv dexametazonu na AtFH13. PTEN doména forminu byla pomnožena z cDNA, zaklonována do vektoru a sfúzována s YFP. Značený protein byl metodou tranzientní exprese vizualizován v pokožkových buňkách listů Nicotiana benthamiana. Mezi rostlinami mutantními v genu AtFH13 a kontrolou nebyl ve vybraných parametrech pozorován výrazný rozdíl. Dexametazon neměl na délku kořenů mutantních rostlin vliv. Semikvantitativní RT-PCR bylo prokázáno, že dexametazon nemá větší vliv ani na... Formins are proteins facilitating formation of actin filaments. They affect structure of cytoskeleton and participate in cytokinesis and tip growth. There are 2 classes of formins in Arabidopsis thaliana, which include FH1 and FH2 (Formin Homology 1 and 2) domain. Formins of the class I have usually a transmembrane domain on N-terminus. Due to this fact they can interact with membranes. Some formins from the class II include PTEN domain (Phosphatase and Tensin Homolog) derived from sequences of PTEN proteins which has lost the function of phosphatase. It is assumed this domain can bind on a membrane via the phosphatase section or C2 domain. This thesis was focused on the formin AtFH13 from the class II in Arabidopsis thaliana and on its PTEN domain. There were analyzed differences between mutants and wild-types in length of roots in seedlings and in size of seeds and seed coats, and observed the effect of dexamethasone on the length of roots on AtFH13. PTEN domain of the formin was isolated from cDNA, cloned to a vector and fused with YFP. The tagged protein was visualized by the method of transient expression in epidermal cells in the leaves of Nicotiana benthamiana. No big differences were observed between plants mutant in the gene AtFH13 and wild-type in choice parameters. Dexamethasone did't influence...
Klíčová slova: aktin; alternativní sestřih; fosfatidylinozitol-(3,4,5)-trisfosfát; GST fúze; huseníček rolní; mikrotubuly; Yellow fluorescent protein; actin; alternative splicing; GST phusion; microtubules; phosphatidylinositol-(3,4,5)-triphosphate; Yellow Fuorescent Protein

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/48485

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-312771


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce