Original title: Důležité role hemu: signál pro hem-detekující proteiny a detekční místo v plyn-detekujících proteinech
Translated title: Important roles of heme as a signal and a gas-sensing site: heme-sensing and gas-sensing proteins
Authors: Fojtíková, Veronika ; Martínková, Markéta (advisor) ; Hudeček, Jiří (referee)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2012
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Hem-obsahující senzorové proteiny jsou hemoproteiny, které jsou rozděleny do dvou skupin: hem-detekující a plyn-detekující proteiny. Funkce hem-detekujících proteinů je ovlivněna koncentrací hemu v okolí proteinu. Prostřednictvím navázání hemu k hem-detekujícímu proteinu (nebo naopak disociace hemu z hem-detekujícího proteinu) jsou ovlivněny mnohé fyziologické procesy v organismu, jako například regulace enzymové aktivity nebo interakce proteinu s DNA a další funkce, které jsou nezbytné pro přežití buněk. Plyn-detekující proteiny obsahují pevně vázanou molekulu hemu, ke které jsou vázány molekuly plynu (např. kyslík, oxid uhelnatý nebo oxid dusnatý) v závislosti na koncentraci molekul plynu. Navázání molekuly plynu k plyn-detekujícímu proteinu, aktivuje mechanismus, jehož prostřednictvím dochází k ovlivnění fyziologických procesů v organismu, jako například regulace enzymové aktivity nebo interakce proteinu s DNA. V této bakalářské práci jsou shrnuty dosavadní zjištěné poznatky o těchto hemoproteinech, publikované v odborných časopisech. Experimentální část této bakalářské práce se zabývá konkrétním modelovým hem-obsahujícím senzorovým proteinem. Je jím histidin kinasa s globinovou strukturou senzorové domény, izolovaná z mikroorganismu Anaeromyxobacter sp., kmen Fw 109-5 (AfGcHK). Náplní experimentální... Heme-containing sensor proteins are heme proteins, which are divided into two groups: heme-sensing and gas-sensing proteins. The function of heme-sensing proteins is affected by heme availability. Association (or dissociation) of heme moiety of heme-sensing protein regulates various physiological functions, including protein kinase activity, transcription and other important functions essential for cell survival. In gas-sensing proteins, heme acts as the sensing site for binding of gaseous molecules (including O2, NO and CO) and indirectly regulates physiological functions, including protein kinase activity, transcription and other important functions essential for cell survival. The recent studies on heme-containing senzor proteins published in scientific journals are summarized in this thesis. The experimental part of this thesis focused on the specific heme-containing sensor protein - a globin-coupled histidine kinase from Anaeromyxobacter sp. strain Fw 109-5 (AfGcHK). The aim of this thesis was to amplified and isolate plasmid carrying gen for AfGcHK. Consequently the protein was expressed in E.coli BL-21(DE3) and the protein was isolated. Based on the results, the isolation process was optimized. Moreover, the purified preparation of isolated AfGcHK was prepared in more than 99% of homogeneity....
Keywords: gas-sensing proteins; globin-coupled histidine kinase from Anaeromyxobacter sp. strain Fw 109-5 (AfGcHK); heme; heme-containing sensor proteins; heme-sensing proteins; plasmid isolation; protein expression; exprese proteinu; hem; hem-detekující proteiny; hem-obsahující senzorové proteiny; histidin kinasa s globinovou strukturou senzorové domény; izolace plasmidu; izolovaná z mikroorganismu Anaeromyxobacter sp; kmen Fw 109-5 (AfGcHK); plyn-detekující proteiny

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/45630

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-309919


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses