Original title: Charakterisace transportních systémů pro kation draslíku v kvasince Zygosaccharomyces rouxii
Translated title: Characterisation of potassium cation transport systems in the yeast Zygosaccharomyces rouxii
Authors: Stříbný, Jiří ; Hodek, Petr (advisor) ; Schierová, Michaela (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2011
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Charakterizace transportních systémů pro kation draslíku v kvasince Zygosaccharomyces rouxii Draselné ionty jsou nezbytně důležité pro všechny buňky včetně kvasinek, protože se tyto ionty účastní mnoha fyziologických procesů. Vnitrobuněčná koncentrace K+ v kvasinkách je obvykle mezi 200 - 300 mM, zatímco v okolním prostředí se pohybuje od milimolárních až k mikromolárním koncentracím. Aby mohli buňky kvasinek přežít v prostředí s nízkou koncentrací draselných iontů, využívají různé účinné systémy pro transport K+ , t.j. Trk, Hak a K+ -ATPasy. Nedávné zveřejnění celkové sekvence genomu osmotolerantní kvasinky Zygosaccharomyces rouxii umožnilo vyhledat homologní sekvence k již známým transportérům pro příjem K+ jiných kvasinek. V genomu Z. rouxii byl nalezen gen, který by mohl dle podobnosti s genem TRK1 kvasinky Saccharomyces cerevisiae kódovat transportér K+ . K charakterizaci transportních vlastností a fyziologických rolí produktu identifikovaného genu, nazvaného ZrTRK1, byly použity tři přístupy. Prvním z nich bylo využití nástrojů bioinformtiky k analýze sekvence, fylogenetického srovnání, atd. Druhý přístup zahrnoval klonování genu ZrTRK1 do vektorů, následnou expresi v mutantním kmenu S. cerevisiae postradajícím vlastní systémy Trk1 a Trk2, charakterisaci fenotypu transformovaných buněk a... Characterization of potassium cation transport systems in the yeast Zygosaccharomyces rouxii Potassium has become absolutely necessary cation for living cells, including yeasts, because it plays several important roles in physiological processes. Intracellular concentration of K+ in yeasts is usually between 200 mM and 300 mM, while the external K+ concentration is ranging from molar to micromolar. To adapt to environments with low K+ content, yeast cells employ various K+ high-affinity uptake systems, e.g. Trk, Hak and K+ -ATPase, that provide cells with the sufficient amount of potassium. The recent release of the complete sequence of the osmotolerant yeast Zygosaccharomyces rouxii genome allowed us to search homologues of the known yeast potassium uptake systems. We have found just one gene encoding a putative potassium transporter homologous to the S. cerevisie TRK1. For the characterisation of transport properties and physiological roles of the product of this gene, named ZrTRK1, three approaches have been used. First, the IT tools serve to analyse sequence characteristics, phylogenetic relationships etc. The second approach involves cloning of the gene and its expression in a S. cerevisiae mutant strain lacking its own two Trk systems, characterisation of transformants' growth phenotypes and...
Keywords: phenotypic analysis; potassium cations transport; TRK; yeast; Zygosaccharomyces rouxii; analýza fenotypu; kvasinky; transport draselných kationtů; TRK; Zygosaccharomyces rouxii

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/33160

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-297636


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses