Název: Skrytá diverzita volně žijících trichomonád a jejich postavení v rámci skupiny Parabasalia
Překlad názvu: Cryptic diversity of free-living trichomonads and their phylogenetic position within Parabasalia
Autoři: Céza, Vít ; Čepička, Ivan (vedoucí práce) ; Hampl, Vladimír (oponent)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2011
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Trichomonády (Parabasalia) jsou skupinou anaerobních jednobuněčných eukaryot. V současné době jsou řazeny do říše Excavata, přičemž toto zařazení bylo provedeno pouze na základě molekulárních analýz. Mezi trichomonády patří přes 400 převážně endobiotických druhů, z nichž zhruba 80 % žije v termitech. Volně žijících trichomonád bylo zatím popsáno pouhých šest druhů (Pseudotrichomonas keilini, Ditrichomonas honigbergii, Monotricho- monas carabina, Honigbergiella sp., Tetratrichomonas undula a Lacusteria cypriaca) tvoří- cích čtyři nezávislé fylogenetické linie. Z toho nám se podařilo popsat nový rod a druh Lacusteria cypriaca. Všechny tyto linie jsou sekundárně volně žijící, to znamená, že se v rámci trichomonád vyvinuly ze svých endobiotických předků. Podařilo se nám také publikovat první dvě sekvence příslušející druhu Pseudotrichomonas keilini, morfologicky popsaného již v roce 1935. Na základě našich dat jsme přesunuli Pseudotrichomonas keilini ze skupiny Honigbergiellidae do čeledi Trichomonadidae (řád Trichomonadida). Vedle těchto již publikovaných výsledků jsme získali dalších sedm nových kmenů volně žijících trichomonád (GOU23, CK, GR8, LAGOS2M, VAV1A1, E2NT, LAGOS2D), ze všech těchto kmenů jsme získali sekvenci genu pro SSU rRNA a provedli fylogenetickou analýzu. Tyto kmeny se rozpadly do... Trichomonads (Parabasalia) are anaerobic microeukaryotes classified in the supergroup Excavata. Inclusion of parabasalids within Excavata is exclusively based on the molecular- phylogenetic evidence. Over 400 species of parabasalids have been described so far, and the vast majority of them are endobiotic. In contrast, only few species of free-living parabasalids forming four independent lineages have been described (Pseudotrichomonas keilini, Ditrichomonas honigbergii, Monotrichomonas carabina, Honigbergiella sp., Tetratrichomonas undula, and Lacusteria cypriaca). Lacusteria cypriaca is a new species and genus described in our recent paper. In this paper we published the first two sequences of SSU rDNA from Pseudotrichomonas keilini as well. All of these lineages are likely secondarily free-living, and they developed from endobiotic ancestors. In addition to the already published Lacusteria cypriaca and Pseudotrichomonas keilini strains, we have recently obtained seven another isolates of free-living trichomonads (LAGOS2D, E2NT, CK, LAGOS2M, GR8, GOU23 LIVADIAN, and VAV1A1); from all of these isolates we sequenced SSU rDNA and performed phylogenetic analyses. These isolates split into four independent evolutionary lineages, which indicate that free-living parabasalids are more diversed and...
Klíčová slova: Diverzita; Excavata; fylogeneze; Lacusteria; linie; Parabasalia; SSU rDNA; volně žijící trichomonády; Diversity; Excavata; free-living trichomonads; Lacusteria; lineage; Parabasalia; phylogeny; SSU rDNA

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/33123

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-297599


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce