Název: Interakce proteinů Prp22 a Prp45 ve spliceosomu pučící kvasinky
Překlad názvu: The interaction of Prp22 and Prp45 proteins in budding yeast spliceosome
Autoři: Senohrábková, Lenka ; Půta, František (vedoucí práce) ; Malcová, Ivana (oponent)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2010
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Protein Prp22 je DEAH box RNA helikáza, která má dvě funkce v sestřihu pre-mRNA: účastní se druhé transesterifikační reakce (ATP independentní funkce) a uvolňuje maturovanou mRNA ze spliceosomu (ATP dependentní funkce). Prp45p, kvasinkový ortholog lidského transkripčního koregulátoru SNW/SKIP, je esenciální sestřihový faktor, přítomný ve spliceosomu po celou dobu sestřihové reakce. Mutanta prp45(1-169) geneticky interaguje s některými alelami NTC komplexu a sestřihovými faktory druhého kroku, včetně PRP22. Jedním z výsledků této práce je zjištění, že mutanty prp22(-158T) a prp22(-327A), které jsou synteticky letální s mutací prp45(1-169), mají kvůli mutaci v upstream regulační oblasti sníženou hladinu proteinu Prp22. Mutanty prp22(-158T), prp22(300PPI) a prp22(-327A) ovlivňují sestřih pre-mRNA s mutací v 5'ss v závislosti na sekvenci druhého exonu. N-terminální mutanty prp22(∆301) a prp22(∆350) jsou synteticky letální s prp45(1-169). Syntetická letalita je možná způsobena snížením efektivity vazby Prp22p do spliceosomů na úroveň, která není pro buňky již viabilní. Protein Prp22 is a DEAH box RNA helicase, which plays two distinct roles in pre-mRNA splicing: it participates in second transesterification step (ATP independent function) and it releases mature mRNA from the spliceosome (ATP dependent function). Prp45p, yeast ortholog of the human transcription co-regulator SNW/SKIP, is an essential splicing factor, it is included in spliceosome throughout the splicing reaction. Mutant prp45(1-169) genetically interacts with some alleles of NTC complex and second step splicing factors, one of them is also gene PRP22. Here we present, that mutants prp22(-158T) and prp22(-327A), which are synthetically lethal with prp45(1-169), express lower amount of Prp22p due to the mutation in upstream regulation region. Mutants prp22(-158T), prp22(300PPI) and prp22(-327A) affect splicing of pre-mRNA with mutation in 5'ss with respect to sequence of the second exon. N-terminal mutants prp22(∆301) and prp22(∆350) are synthetically lethal with prp45(1-169). Synthetic lethality is possibly caused by lower efficiency of Prp22 recruitment to the spliceosomes, which is no more viable for cells.
Klíčová slova: PRP22; PRP45; sestřih pre-mRNA; pre-mRNA splicing; PRP22; PRP45

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/32070

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-296547


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce