Original title:
Klasifikace organismů na základě nukleotidových četností
Translated title:
Classification of organisms using nucleotides frequencies
Authors:
Kremličková, Lenka ; Maděránková, Denisa (referee) ; Škutková, Helena (advisor) Document type: Bachelor's theses
Year:
2015
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Tato bakalářská práce se zabývá klasifikací organismů na základě nukleotidové četnosti. Cílem práce je seznámit se s problematikou vyhodnocení příbuznosti organismů na základě podobnosti DNA sekvencí, navrhnout a realizovat v programovém prostředí Matlab algoritmus pro klasifikaci organismů na základě klasické fylogenetické metody, základních i pokročilých numerických metod a tyto metody mezi sebou porovnat.
This thesis deals with the classification of organisms based on the nucleotide frequency. Goal is to get acquainted with the problems of evaluating similarity of organisms on the basis of similarity of DNA sequences to design and implement in Matlab algorithm to classify organisms based on classical phylogenetic methods, basic and advanced numerical methods, and these compare methods with each other.
Keywords:
classification of organisms; DNA; numerical methods; Phylogenetics; sequence alignments; DNA; Fylogenetika; klasifikace organismů; numerické metody; zarovnání sekvencí
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/40728