Original title:
Evoluční modely pro vyhodnocení příbuznosti organismů
Translated title:
Evolutionary models for evaluation of organisms relationship
Authors:
Gregorová, Kateřina ; Maděránková, Denisa (referee) ; Škutková, Helena (advisor) Document type: Bachelor's theses
Year:
2015
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Práce je zaměřená na studium a popis evolučních modelů pro vyhodnocení evoluční vzdálenosti DNA sekvencí a proteinových sekvencí v aminokyselinové a kodónové reprezentaci. V rámci této práce byl vytvořen program, který vyhodnocuje genetickou vzdálenost sekvencí DNA a proteinů za použití některých evolučních modelů. Program vypočítá genetické vzdálenosti porovnávaných sekvencí a na jejich základě vykreslí fylogenetický strom. Takto lze relativně snadno a rychle vyhodnotit příbuznost organismů. Pro snadné ovládání je součástí vyhodnocovacího programu také grafické uživatelské rozhraní (GUI).
The work is focused on the study and description of evolutionary models for the evaluation of the evolutionary distances of DNA sequences and protein sequences in the amino acids and the codon representation. In the framework of this work was created a program that evaluates the genetic distance between DNA sequences and protein sequences for the use of some evolutionary models. The program calculates the genetic distance of the compared sequences and on the basis thereof renders the phylogenetic tree. This can be relatively easily and quickly evaluate the affinity of the organisms. For easy operation is part of the evaluation program also graphical user interface (GUI).
Keywords:
evolution; method; mutations; phylogenetic tree; protein sequences; substitution; substitution model; the distribution; the evolutionary model; evoluce; evoluční model; fylogenetický strom; metoda; mutace; proteinová sekvence; rozdělení; substituce; substituční model
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/40701