Název:
Hodnocení migrace značených buněk v tkáni
Překlad názvu:
Classification of marked cells migration in tissue
Autoři:
Solař, Jan ; Skopalík, Josef (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce) Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2016
Jazyk:
cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze][eng]
Tato diplomová práce se zabývá rozborem moderních detekčních metod vizualizace, sledování a kvantifikace buněk v 3D prostoru. První část práce se zabývá optickými metodami detekce buněk. Je zde detailní rozbor problematiky fluorescenčního značení buněk a jejich detekce na konfokálním mikroskopu. Je zde popis vyvinutého algoritmu pro kvantifikaci celého buněčného objemu z mikroskopického obrazu. Díky tomu se porovnal signál fluorescence buněk v čase a podle jejich tvaru. Dále došlo k optimalizaci vizualizace vyvinutých tkáňových fantomů. Porovnaly se možnosti detekce buněk v těchto fantomech pomocí konfokální mikroskopie a OCT. Byl rovněž implementován algoritmus pro kvantifikaci buněk z OCT obrazů. Kromě konfokálního mikroskopu a OCT se buňky rovněž analyzovaly dalšími metodami. V poslední části je konkluze výsledků a srovnání jednotlivých použitých metod.
This diploma thesis deals with analysing of modern methods for cell detection, visualization and quantification in 3D space. The first section deals with optical methods for cells detection. There is detailed discussion about cell labeling and detection on confocal microscopy. There is also description about developed algorithm for whole cell volume quantification from microscopy images. This could made a comparsion of fluorescence signal according to time of cell labeling and according to cell shapes. There was also optimalization of handmade tissue phantoms visualization. It could be compared a possibilities of cell detections in these phantoms by confocal microscopy and OCT. It was also implemented algorithm for quantification of cells from OCT images. Besides confocal microscopy and OCT cells are also analyzed by other methods. The last part is the Conclusion of results and comparison of used methods.
Klíčová slova:
detekce buněk; fluorescence; Konfokální mikroskop; kvantifikace; migrace buněk; OCT; cell detection; cell migration; Confocal microscopy; fluorescence; OCT; quantification
Instituce: Vysoké učení technické v Brně
(web)
Informace o dostupnosti dokumentu:
Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT. Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/59737