Název:
Komparační analýza genomických dat pomocí grafické reprezentace
Překlad názvu:
Similarity/dissimilarity analysis of genomic data on the basis of graphical representation
Autoři:
Těthal, Jiří ; Provazník, Ivo (oponent) ; Maděránková, Denisa (vedoucí práce) Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2011
Jazyk:
cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze][eng]
Práce se zabývá identifikací druhů živočichů pomocí denzity nukleotidů mitochondriálního genu CO1. V první části práce jsou teoreticky shrnuty informace o DNA barcodingu a buněčné organele mitochondrii, která s touto metodou úzce souvisí. Druhá část se již prakticky zabývá porovnáváním různých sekvencí s využitím denzity jejich nukleotidů. K tomuto účelu byl vytvořen program, který využívá dvě funkce, přičemž první ze zadaných sekvencí nukleotidů vypočítá jejich denzitu a druhá dokáže tyto denzity porovnat distanční metodou.
The work deals with the identification of species of animal through the density of nucleotids of mitochondrial gene CO1. In the first part the theory summarized information about DNA barcoding and the mitochondria, cellular organel that with this method is closely related. The second part deals with virtually comparing different sequences using the density of nucleotides. For this it was created program, which uses two functions, the first of the specified nucleotide sequence calculates the density and one can compare the density by distance methods.
Klíčová slova:
BOLD; CBOL; dendrogram; denzita DNA; distance; DNA barcoding; druh; fasta; gen CO1; genom; iBOL; mitochondrie; mitochondriální DNA; PCR; BOLD; CBOL; dendrogram; density of DNA; distance; DNA barcoding; fasta; gene CO1; genome; iBOL; mitochondria; mitochondrial DNA; PCR; species
Instituce: Vysoké učení technické v Brně
(web)
Informace o dostupnosti dokumentu:
Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT. Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/1940