Original title: Izolace DNA z probiotických výrobků s využitím pevných nosičů
Translated title: Isolation of DNA from probitic products using solid carriers
Authors: Bonczek, Ondřej ; Horák, Daniel (referee) ; Rittich, Bohuslav (advisor)
Document type: Master’s theses
Year: 2011
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta chemická
Abstract: [cze] [eng]
Mikrobiální DNA byla izolována z hrubých lyzátů buněk rodu Lactobacillus a z probiotických výrobků. Bylo využito reverzibilní adsorpce DNA na neporézní magnetické částice poly(2-hydroxyethyl methacrylát-co-glycidyl methacrylát) - P(HEMA-co-GMA) pokryté karboxylovými skupinami a nanočástice manganatého Perovskitu, pokrytého silikagelem. DNA byla adsorbována na povrch částic v prostředí 16% PEG 6000 a 2M NaCl. Adsorbovaná DNA byla z částic uvolněna v nízkoiontovém TE pufru (pH= 8,0). Kvalita a koncentrace izolované DNA byla ověřena spektrofotometricky a amplifikací v PCR. Vzorky DNA izolované magnetickými částicemi a metodou fenolové extrakce (kontrola) byly amplifikovány v PCR. DNA izolovaná z hrubých lyzátů buněk probiotických výrobků byla kvantifikována s využitím kvantitativní PCR v reálném čase. Microbial DNA was isolated from lysed cells of Lactobacillus genus in probiotic products. Reversible adsorption DNA on the surface of carboxyl coated nonporous poly(2-hydroxyethyl methacrylate-co-glycidyl methacrylate) (P(HEMA-co-GMA)) magnetic particles and silicagel coated manganase Perovskite nanoparticles. DNA was adsorbed on the surface of the particles in the presence of 16 % poly(ethylenglycol) (PEG 6000) and 2 M sodium chloride (NaCl) concentrations. The adsorbed DNA was released from particles by low ionic strength TE buffer (pH= 8.0). The quality of isolated DNA was checked by spectrofotometric measurement and PCR amplification. DNA samples isolated using magnetic particles and phenol extraction method (control method) were PCR-ready. The DNA isolated from lysed cells of probiotic products was quantificated in real-time qPCR.
Keywords: DNA isolation; genus Lactobacillus; magnetic particles; PCR; probiotic products; real-time qPCR; izolace DNA; kvantitativní PCR v reálném čase; magnetické částice; PCR; probiotické výrobky; rod Lactobacillus

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/3110

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-216691


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Master’s theses