|
|
Izolace DNA z probiotických výrobků s využitím pevných nosičů
Bonczek, Ondřej ; Horák, Daniel (oponent) ; Rittich, Bohuslav (vedoucí práce)
Mikrobiální DNA byla izolována z hrubých lyzátů buněk rodu Lactobacillus a z probiotických výrobků. Bylo využito reverzibilní adsorpce DNA na neporézní magnetické částice poly(2-hydroxyethyl methacrylát-co-glycidyl methacrylát) - P(HEMA-co-GMA) pokryté karboxylovými skupinami a nanočástice manganatého Perovskitu, pokrytého silikagelem. DNA byla adsorbována na povrch částic v prostředí 16% PEG 6000 a 2M NaCl. Adsorbovaná DNA byla z částic uvolněna v nízkoiontovém TE pufru (pH= 8,0). Kvalita a koncentrace izolované DNA byla ověřena spektrofotometricky a amplifikací v PCR. Vzorky DNA izolované magnetickými částicemi a metodou fenolové extrakce (kontrola) byly amplifikovány v PCR. DNA izolovaná z hrubých lyzátů buněk probiotických výrobků byla kvantifikována s využitím kvantitativní PCR v reálném čase.
|
|
|
Molekulárně-biologická podstata hypodoncií
Bonczek, Ondřej
Vývoj zubů (odontogeneze) je komplikovaný a dynamický proces, kterého se zúčastňuje celá řada proteinů. Vzájemnými interakcemi mezi sebou vytváří spletitou signální síť. Narušením potřebné rovnováhy může vzniknout nevratná ageneze zubů (hypodoncie). Tato vrozená absence jednoho nebo několika zubů může mít genetickou příčinu a/nebo ji mohou způsobit faktory vnějšího prostředí (léky, trauma atd.). V literatuře jsou nejčastěji zmiňovány geny pro PAX9, MSX1, AXIN2, EDA, EDAR a WNT10a. Tato práce se ve svém úvodu zabývá odontogenezí po biologické a molekulární stránce a ve své výsledkové části popisuje zjištěné mutace a polymorfizmy vybraných genů na souborech pacientů a kontrolních osob české populace. Úseky genů byly studovány technikami molekulární biologie - kapilárním sekvenováním a sekvenováním nové generace (NGS). Z výsledků této studie vyplývá, že nejčastěji chybějícími zuby u souboru pacientů byly třetí moláry v obou čelistech, následovaly druhé premoláry v dolní a horní čelisti a laterální řezáky v horní čelisti. Mezi nejvýznamnější výsledky genetické analýzy patří objevení mutace g.9527G>T v sestřihové oblasti genu pro PAX9 a g.8177G>T v genu pro MSX1, která vede ke vzniku stop kodonu. Obě heterozygotní substituce byly identifikovány u probandů trpících oligodoncií, kterýmžto názvem se...
|
|
|
Molekulárně-biologická podstata hypodoncií
Bonczek, Ondřej
Vývoj zubů (odontogeneze) je komplikovaný a dynamický proces, kterého se zúčastňuje celá řada proteinů. Vzájemnými interakcemi mezi sebou vytváří spletitou signální síť. Narušením potřebné rovnováhy může vzniknout nevratná ageneze zubů (hypodoncie). Tato vrozená absence jednoho nebo několika zubů může mít genetickou příčinu a/nebo ji mohou způsobit faktory vnějšího prostředí (léky, trauma atd.). V literatuře jsou nejčastěji zmiňovány geny pro PAX9, MSX1, AXIN2, EDA, EDAR a WNT10a. Tato práce se ve svém úvodu zabývá odontogenezí po biologické a molekulární stránce a ve své výsledkové části popisuje zjištěné mutace a polymorfizmy vybraných genů na souborech pacientů a kontrolních osob české populace. Úseky genů byly studovány technikami molekulární biologie - kapilárním sekvenováním a sekvenováním nové generace (NGS). Z výsledků této studie vyplývá, že nejčastěji chybějícími zuby u souboru pacientů byly třetí moláry v obou čelistech, následovaly druhé premoláry v dolní a horní čelisti a laterální řezáky v horní čelisti. Mezi nejvýznamnější výsledky genetické analýzy patří objevení mutace g.9527G>T v sestřihové oblasti genu pro PAX9 a g.8177G>T v genu pro MSX1, která vede ke vzniku stop kodonu. Obě heterozygotní substituce byly identifikovány u probandů trpících oligodoncií, kterýmžto názvem se...
|
|
|
Izolace DNA z probiotických výrobků s využitím pevných nosičů
Bonczek, Ondřej ; Horák, Daniel (oponent) ; Rittich, Bohuslav (vedoucí práce)
Mikrobiální DNA byla izolována z hrubých lyzátů buněk rodu Lactobacillus a z probiotických výrobků. Bylo využito reverzibilní adsorpce DNA na neporézní magnetické částice poly(2-hydroxyethyl methacrylát-co-glycidyl methacrylát) - P(HEMA-co-GMA) pokryté karboxylovými skupinami a nanočástice manganatého Perovskitu, pokrytého silikagelem. DNA byla adsorbována na povrch částic v prostředí 16% PEG 6000 a 2M NaCl. Adsorbovaná DNA byla z částic uvolněna v nízkoiontovém TE pufru (pH= 8,0). Kvalita a koncentrace izolované DNA byla ověřena spektrofotometricky a amplifikací v PCR. Vzorky DNA izolované magnetickými částicemi a metodou fenolové extrakce (kontrola) byly amplifikovány v PCR. DNA izolovaná z hrubých lyzátů buněk probiotických výrobků byla kvantifikována s využitím kvantitativní PCR v reálném čase.
|
host ::
RSS.