|
DNA vaccination
Plachý, Jiří
We have evalueted the protective activity of v-src-derived DNA vaccines against growth of v-src-induced tumors in congenic chicken lines.
|
|
Úloha genu ATM u karcinomu prsu
Soukupová, Jana ; Pohlreich, Petr (vedoucí práce) ; Souček, Pavel (oponent) ; Foretová, Lenka (oponent)
Incidence zhoubných nádorů prsu má v České republice z dlouhodobého hlediska zvyšující se tendenci. Vývoj nádoru je výsledkem kumulace genových alterací. Postiženy jsou geny, které se podílejí na regulaci (pozitivní i negativní) buněčného růstu a dělení. Dědičné karcinomy představují asi 5-10% všech karcinomů prsu a jsou v 60-80% případů způsobeny dědičnou mutací v hlavních predispozičních genech BRCA1 a BRCA2. V patogenezi karcinomu prsu se uplatňují i další geny s nižší penetrancí, mezi něž je řazen také gen ATM. Jedná se o tumorsupresorový gen, jehož produkt je důležitý pro opravu dvouřetězcových zlomů DNA. Cílem této práce bylo zjistit frekvenci mutací v genu ATM u dědičného karcinomu prsu v naší populaci a dále určit, do jaké míry je tento gen alterován u sporadického karcinomu prsu. To zahrnovalo navržení a optimalizaci metod pro detekci mutací, analýzu výpadků alel a metylace promotorové oblasti genu ATM. Závěrem lze říci, že gen ATM má pravděpodobně význam při vzniku dědičného karcinomu prsu u minoritní části vysoce rizikových pacientek v naší populaci, ale četnost mutací je oproti BRCA1/2 významně nižší a vzhledem k velikosti genu v současné době preventivní screening tohoto genu neprovádíme. Máme zavedenu mutační analýza genu ATM a dosud jako jediní v ČR nabízíme molekulární diagnostiku pacientům...
|
|
Emergent properties of the G1/S network
Dražková, Jana ; Tomášek, Petr (oponent) ; Palumbo,, Pasquale (vedoucí práce)
In this thesis we deal with the cell cycle of the yeast Saccharomyces cerevisiae. We are interested in its G1 to S transition, and our main goal is to determine the cell size at the onset of its DNA replication. At first, we study a recent mathematical model describing the mechanisms leading to the S phase, we provide its detailed description and present the dynamics of some significant protein and protein complexes. Further, we take a closer look at the probabilistic model for firing of DNA replication origins. We newly consider the influence of DNA replication spreading among neighboring origins, and we analyze its consequences. We also provide a sensitivity analysis of the critical cell size with respect to rate constants of G1 to S transition model.
|
|
Účinky xenobiotik na oxidační stres, metabolizmus lipidů, integritu DNA a životaschopnost lidských buněk a rybích spermií in vitro
LINHARTOVÁ, Pavla
Znečišťování vodního prostředí anorganickými a organickými chemikáliemi je jedním z hlavních faktorů představujících vážnou hrozbu v přežití vodních organismů včetně ryb. Proto hodnocení rizik a přínosů týkajících se konzumace ryb je v současné době intenzivně diskutované téma veřejného zdraví. Spermie téměř všech druhů ryb se před oplodněním uvolňují do vodního prostředí, kde mohou být přímo vystaveny různým sloučeninám, jako jsou například cizorodé látky zahrnující též toxické kovy. Kromě toho i samotná expozice dospělých jedinců různým škodlivinám by mohla ovlivnit kvalitu rybích gamet, jejímž následkem bude snížená oplozovací schopnost a oplodnění samotné. Mimo jiné výhody konzumace ryb jsou dobře známé, a to nejen jako bohatého zdroje bílkovin a dalších nezbytných živin, ale rovněž i mnoha zdravotních výhod. Věda a výzkum v posledních několika desetiletích ukázaly, že živiny, zejména n-3 mastné kyseliny (MK), vyskytující se u ryb a mořských plodů, jsou prospěšné pro funkci srdce a nezbytné pro vývoj mozku. Celá práce byla založena na hodnocení dvou rozdílných typů modelových buněk. Za prvé lidské jaterní buňky (Hep G2, ATCC), které byly použity jako nástroj pro studium cytotoxicity kadmia (Cd2+) in vitro formou simulace po požití kontaminované ryby a následné změny ve složení mastných kyselin a fosfolipidových tříd. Za druhé byly pro studium účinků potenciálně nebezpečných xenobiotik vyskytujících se ve volných vodách použity jako in vitro model spermie jednoho ohroženého druhu ryby, jesetera malého (Acipenser ruthenus). Spermie jesetera malého byly vystaveny po dobu 2 hod při 4 °C koncentracím xenobiotik vyskytujících se v životním prostředí. Jmenovitě u DQ (0-150
|
| |
| |
|
Genetické aspekty zadní polymorfní dystrofie rohovky
Lišková, Petra ; Filipec, Martin (vedoucí práce) ; Čejková, Jitka (oponent) ; Slavčev, Antonij (oponent)
Zadní polymorfní dystrofie rohovky (posterior polymorphous corneal dystrophy; PPCD) je v odborné literatuře považována za relativně vzácné autozomálně dominantní onemocnění postihující rohovkový endotel a Descemetovu membránu. V České republice se však jedná o jednu z nejčastěji diagnostikových rohovkových dystrofií. Cílem dizertační práce bylo zpracování výskytu PPCD na území České republiky a studium její etiopatogeneze se zaměřením na charakterizaci molekulárně genetických mechanismů vedoucích k tomuto onemocnění. Celkem jsme identifikovali 20 PPCD rodin se dvěma nebo více postiženými členy. Onemocnění bylo potvrzeno u 104 jedinců, u 82 z nich byl proveden odběr venózní krve a izolace DNA. Druhá část projektu byla zaměřena na zjištění oblasti, ve které se nalézá gen pro PPCD. Ve dvou největších českých rodinách jsme pomocí vazebné analýzy vymezili PPCD lokus do 2.7 cM oblasti mezi ohraničující markery D20S48 a D20S139 na chromozomu 20p11.2. Tím byl vyloučen gen VSX1, považovaný částí odborné veřejnosti za gen podmiňující vznik PPCD u některých z pacientů. Ve zjištěné oblasti mapování jsme vybrali pět kandidátních genů a pomocí přímého sekvenování kódujících oblastí provedli jejich screening u dvou probandek. Žádnou potenciálně patogenní mutaci jsme neidentifikovali. Dosáhli jsme zúžení PPCD lokusu na 20....
|
|
Detekce mutace genu VPS13B zodpovědné za syndrom uvězněných neutrofilů u vybraných plemen psů využívaných pro asistenční aktivity
Zemanová, Lucie ; Vejl, Pavel (vedoucí práce) ; Melounová, Martina (oponent)
Tato bakalářská práce na téma Detekce mutace genu VPS13B zodpovědné za syndrom uvězněných neutrofilů u vybraných plemen psů využívaných pro asistenční aktivity začíná literární rešerší dané problematiky a následně pokračuje experimentální částí, která byla provedena na katedře genetiky a šlechtění.
V literární rešerši je majoritní část zaměřena na Syndrom uvězněných neutrofilů a na Cohenův syndrom. Oba tyto syndromy jsou způsobeny mutací stejného genu a z tohoto důvodu je pes vhodným genetickým modelem pro výzkum lidského onemocnění. Z literární rešerše je jednoznačné, že Syndrom uvězněných neutrofilů je autozomálně recesivní onemocnění a je způsobeno deleční mutací 4 bází (GTTT) na 13. chromozomu v exonu 19. Tato mutace se objevuje pouze u plemene border kolie. Syndrom uvězněných neutrofilů způsobuje velmi závažné poruchy jedinců, pro které je ve většině případů toto onemocnění letální. Pokud jedinci s touto mutací přežijí první týdny života, žijí pouze velmi krátký a nekvalitní život. Trpí průjmy, horečkami, zvracením a také mají typické fretkoidní protažené tlamy.
Experimentální část je zaměřena na izolaci DNA z bukálních stěrů jedinců plemen border kolie, zlatý retrívr, labradorský retrívr a Nova Scotia duck tolling retrívr, vytvoření PCR markerů a následnou sekvenaci získaných PCR amplikonů.
Výsledky experimentální části potvrdily hypotézy, že kauzální mutace je ovlivněna plemennou příslušností a lze ji snadno identifikovat sekvenací PCR amplikonů.
|
| |
|
Vliv epigallokatechin gallátu, kyseliny elagové a kurkuminu na cytotoxický účinek mutagenů
Tlučhořová, Drahomíra ; Hochmann, Jiří (vedoucí práce) ; Polívková, Zdeňka (oponent)
Přírodní fenolické látky, epigallokatechin gallát (EGCG), kyselina elagová a kurkumin již v mnohých studiích in vivo a in vitro prokázaly své antioxidační, antimutagenní a antikancerogenní vlastnosti. Pomocí alkalické verze kometového testu jsme zjišťovali, dokáží-li tyto látky ovlivnit poškození DNA buněk AA8 a HepG2 způsobené 2-amino-3-methylimidazo [4,5-f] chinolinem (IQ), N-nitroso-N-methylmočovinou (MNU) a UVC zářením. Výsledky měly doložit, zda je kometový test vhodnou metodou k testování antimutagenů. Dále nás zajímalo, jestli látky, které dokáží zmírnit účinky mutagenů, budou mít stejný efekt i na jejich cytotoxicitu. Jako referenční mutgeny jsme kromě MNU a UVC záření zvolili i peroxid vodíku. Kurkumin sice během kometového testu nedokázal dostatečně ochránit DNA před poškozením vyvolaným MNU. Kyselina elagová však účinně snižovala mutagenitu MNU. EGCG snižoval poškození DNA indukované IQ a UVC zářením. U buněk ovlivněných MNU měl EGCG vliv nejen na indukci, ale i na opravu poškození DNA. K testování cytotoxicity jsme si vybrali již jen EGCG, protože prokazoval největší antimutagenní účinky. U buněk ošetřených peroxidem vodíku EGCG zvyšoval počet vytvořených kolonií, pravděpodobně díky svým antioxidačním vlastnostem. Inkubace s EGCG však již nedokázala snížit cytotoxicitu MNU a UVC a počet...
|
host ::
