|
|
Mechanisms of membrane protein quality control in the endoplasmic reticulum
Jirout, Matěj ; Stříšovský, Kvido (vedoucí práce) ; Bařinka, Cyril (oponent)
Integrální membránové proteiny (IMP) procházejí rozsáhlou kontrolou kvality (QC) v endoplazmatickém retikulu (ER), aby se udržela proteostáza a integrita proteomu ER. Ribosomální kontrola kvality proteinů asociovaná s ER (ER-ribosome-associated protein quality control; ER-RQC) reaguje na zastavení ribozomů během translokace a pomáhá uvolnit ucpaný translokon. Degradace proteinů asociovaná s ER (ER-associated degradation; ERAD) cílí špatně sbalené IMP k proteasomální degradaci. IMP odolné vůči ERAD jsou degradovány pomocí různých ER-fagických drah, souhrně označovaných jako ELRAD (ER-to-lysosome associated degradation). Koordinaci těchto mechanismů zajišťuje odpověď na špatně sbalené proteiny (unfolded protein response, UPR), ačkoli receptory UPR nejsou s největší pravděpodobností aktivovány aberantními IMP, protože všechny tyto mechanismy fungují i jako mechanismy kontroly kvality ER-luminárních proteinů.
|
|
|
Stanovení účinných látek a případných degradačních produktů v historickém vzorku přípravku Algena z roku 1981
Bauerová, Markéta ; Nesměrák, Karel (vedoucí práce) ; Kozlík, Petr (oponent)
Tableta Algena bylo léčivo volně dostupné na trhu v druhé polovině dvacátého století v Československu. Algena byla užívána především protibolestem.Tableta obsahuje čtyřiúčinné látky: aminofenazon,aprobarbital, fenacetin a kofein. Cílem této práce bylo analyzovat účinné látky v historické tabletě Algeny z roku 1981, stanovit jejich koncentrace a případné rozkladné produkty. Aby byly tyto cíle splněny, bylo třeba vyvinout a optimalizovat RP-HPLC metodu s UV detekcí. Dále byla použita HPLC-MS, která měla sloužit k odhalení případných degradačních produktů. Separace probíhala na koloně XBridge® BEH C18 (150×3,0 mm; 2,5 µm), byla použita binární gradientová eluce, kdy první složkou byl 0,1% roztok octové kyseliny ve vodě, druhou složkou byl methanol. Stanovené obsahy účinných látek (vzhledem k deklarovanému obsahu výrobcem) byly: amino- fenazon 97,0 %, aprobarbital 89,2 %, fenacetin 96,0 % a kofein 93,2 %. Hmotnostní detekcí nebyly prokázány žádné degradační produkty stanovovaných látek. Klíčová slova: Algena, aminofenazon, aprobarbital, degradace, fenacetin, kofein, RP-HPLC
|
|
|
Charakterizace proteinů, jejichž degradace je nezbytně nutná pro správný průběh embryonální genomové aktivace u savců
Svobodová, Nika ; Toralová, Tereza (vedoucí práce) ; Krejčová, Tereza (oponent)
Raný embryonální vývoj je řízen maternálními mRNAa proteiny, které byly nasyntetizovány během oogeneze. Klíčovým obdobím pro preimplantační vývoj je přechod od maternální kontroly vývoje k embryonální. Tento proces, známý spíše pod anglickým názvem maternal-to-zygotic transition (MZT), vyžaduje koordinovanou degradaci nahromaděných maternálních mRNA a proteinů a následnou aktivaci embryonálního genomu (EGA). Maternální mRNA jsou z embrya postupně odstraněny, degradace maternálních proteinů však zatím není příliš dobře objasněna. U savců je známo pouze několik málo proteinů, jejichž degradace je nezbytná pro správný průběh EGA. Aktivace embryonálního genomu velmi úzce souvisí s reorganizací struktury chromatinu. Spuštění genové exprese vyžaduje rozvolnění chromatinu v oblasti genu a také přítomnost příslušných transkripčních faktorů. Maternální proteiny, které je nutné degradovat pro správný průběh EGA u savců, se podílejí právě na regulaci struktury chromatinu a translokaci potřebných faktorů. Cílem této bakalářské práce je charakterizovat vybrané proteiny (PIASy, CBX5, TAB1 a H1FOO) a popsat úlohu, kterou hrají během přechodu od maternální k embryonální kontrole vývoje. Zatímco PIASy, CBX5 a H1FOO je nutné degradovat pro rozvolnění struktury chromatinu umožňující spuštění embryonální genové...
|
|
|
Vliv polutantů a kvality betonu na trvanlivost a životnost železobetonových konstrukcí
Mazán, Tomáš ; Láník, Jaromír (oponent) ; Hrabová, Kristýna (vedoucí práce)
Diplomová práca popisuje vplyvy agresívneho prostredia na konštrukcie v infraštruktúre, ktoré sú vystavené nepriaznivým vplyvom. Teoretická časť práce sa zaoberá klasifikáciou jednotlivých agresívnych prostredí a chemizmom, pomocou ktorého spôsobujú degradáciu betónu a konštrukcie. Podstatná časť je venovaná spolupôsobeniu degradačných mechanizmov, teda synergickému efektu. Praktická časť popisuje postup experimentu, použité skúšobné metódy a experiment, ktorým práca overí teoretické myšlienky. Na základe teoretických podkladov je v práci vypracovaný model, ktorý simuluje pôsobenie prostredia. Prevedenie experimentu spočíva v simulácií agresívneho prostredia a zisťovanie ich vplyvu na skúmané vlastnosti. Po získaní výsledkov zo skúšok v praktickej časti sú následné vyhodnotené riziká, ktoré môžu znižovať trvanlivosť konštrukcie s ohľadom na jednotlivé fáze životného cyklu stavby. Ďalej sú vyhodnotené riziká, ktoré majú závažný vplyv na trvanlivosť a po usporiadaní sú navrhnuté opatrenia. Záver práce sa venuje dosiahnutým výsledkom celého experimentu a vyhodnocuje ako dosiahnuť zníženie nepriaznivých vplyvov v rôznych fázach životného cyklu stavby.
|
|
|
Laboratorní zkoušky degradace vybraných sedimentárních hornin v důsledku jejich saturace vodou
Nagyová, Noémi ; Havlíček, Jaroslav (oponent) ; Chalmovský, Juraj (vedoucí práce)
Práce se zabývá laboratorními testy vybraných sedimentárních hornin, je tvořena ze dvou částí, teoretické a praktické. V první části je popsán proces „slaking“, při kterém se geomateriály rozpadají při opakovaných cyklech nasycení a vysušení. Následně jsou popsány typy „slakingu“, možné hlavní příčiny způsobující degradaci a jednotlivé metody pro měření tohoto jevu. V praktické části byly provedeny zkoušky jednoosé stlačitelnosti a zrnitostní rozbory. Zkoušky stlačitelnosti byly do předepsaného napětí prováděny standardním způsobem. V následujícím kroku zatížení bylo přistoupeno k saturaci vzorku při udržování konstantního zatížení a hodnoty objemové změny byly nepřetržitě měřeny. Po ustálení hodnot bylo v zatěžování pokračováno a po zbytek zkoušky byl vzorek udržován ponořený pod vodní hladinou. V rámci navrženého testovacího programu byl zhodnocen vliv napětí při saturaci, doba saturace, počáteční číslo pórovitosti a rozměry vzorků. Granulometrické rozbory byly provedeny před a po zkouškách stlačitelnosti. Bylo tak možné určit změnu struktury projevující rozpadem částic v důsledku „slaking“ efektu.
|
|
|
Microscopic and spectroscopic analysis of elementary 2D materials
Jeřábek, František ; Procházka, Pavel (oponent) ; Kolíbal, Miroslav (vedoucí práce)
This work presents an atomic-level mapping of the structures formed upon deposition of phosphorus on a Cu(111) single-crystal under ultra-high vacuum conditions. A comprehensive overview of the current advancements in the synthesis of black and blue phosphorene is provided, encompassing both experimental preparation techniques and predictions of degradation processes. The analysis employs atomically-resolved scanning tunneling microscopy and spectroscopy to examine three distinct structures characterized by varying levels of phosphorus coverage. Remarkably, this investigation succeeds in identifying a large-scale single-layer blue phosphorene. Furthermore, an in-situ examination of the stability of these structures is conducted, revealing the rapid degradation of blue phosphorene even within an ultra-high vacuum environment.
|
|
|
Effect of enzymes on the degradation of thermosensitive copolymers for controlled release of drugs
Dávidíková, Anna Mária ; Michlovská, Lenka (oponent) ; Vojtová, Lucy (vedoucí práce)
Thermosensitive hydrogels used for drug delivery systems are of great interest these days. They serve as a drug vehicle that transport drugs to a target place and then they serve as a drug depot in the body. Hydrogels can be tuned to be able to encapsulate various drugs, to be sensitive to various external stimuli, or to degrade slower (maintain the drug longer in the body). To tune hydrogels, we need to know their degradation process and their behaviour in different degradation media; thus, we can predict how they will behave. In this proposed thesis, the degradations of various thermosensitive hydrogel solutions were studied in different degradation media. The theoretical part of this work provides a short review of thermosensitive hydrogels, their characterisation, properties, use for drug delivery systems, and degradation. Firstly, a triblock thermosensitive copolymer PLGA-PEG-PLGA that consists of poly(D,L-lactic acid-co-glycolic acid)-b-poly(ethylene glycol)-b-poly(D,L-lactic acid-co-glycolic acid) was synthesized via living ring-opening polymerization under an inert atmosphere and characterized via proton nuclear magnetic resonance spectroscopy and gel permeation chromatography. This copolymer was further used for hydrogel water solutions in 10, 15 and 20 wt. % concentrations. Hydrogel samples prepared at 37 were degraded in various media (UPW (ultrapure water), NaCl, PBS (phosphate-buffered saline), and PBS with enzyme) in the incubator for 30 days. The sample removal was set for 1, 2, 3, 7, 9, 14, 16, 21, 23 and 30 days except for the enzyme solution where we expected quick degradation. Degraded hydrogels were analysed via gel permeation chromatography and degradation media via liquid chromatography with mass spectroscopy. Gravimetric analysis and measurement of pH over time were also part of the hydrogel behaviour study. The last aim of this work was to evaluate the collected data and see whether the used enzyme affected the PLGA-PEG-PLGA hydrolytic degradation kinetics. The results proved a minor acceleration in the degradation by the enzyme. These results will serve as a foundation for further degradation studies.
|
|
|
Study on biodegradation of synthetic biobased polyesters
Guziurová, Pavlína ; Sedláček, Petr (oponent) ; Obruča, Stanislav (vedoucí práce)
This thesis investigates the degradation characteristics of polyester polymers (PBS with incorporated dilinoleic succinate in different %wt.) in simulated body fluids, revealing minor changes in properties. Bacterial degradation was also investigated and analysis shows more significant differences in Gel Permeation Chromatography (GPC) and scanning electron microscope (SEM) results. While abiotic degradation predominates, bacterial environments lead to higher degradation levels than simulated body fluids, suggesting potential applications in packaging or agriculture. However, lower sensitivity to abiotic degradation opens new possibilities for further research into exploring bacterial and enzymatic degradation mechanisms for environmentally sustainable alternatives across industries.
|
|
|
Zjišťování klimatických vlivů na degradaci různých typů fotovoltaických článků
Peroutka, Tomáš ; Jandová, Kristýna (oponent) ; Vaněk, Jiří (vedoucí práce)
V této práci je pojednáváno o fotovoltaických článcích. Jsou zde rozebrány i základní pojmy zdroje záření pro sluneční články. Obsahem je nahlédnutí do problematiky polovodičů a historie a vývoj FV článků. Nemalá část se zaobírá možnou degradací fotovoltaických článků. V jedné z kapitol je snaha přiblížit některé druhy fotovoltaických článků a popis výroby těchto modulů. Praktická část se zaobírá samotnou degradací fotovoltaických modulů a jeho vyhodnocením.Následně se srovnává s udávanými hodnotami od výrobce.
|
|
|
Degradace solárních panelů
Poledník, Tomáš ; Křivík, Petr (oponent) ; Vaněk, Jiří (vedoucí práce)
Bakalářská práce byla zaměřena na konstrukční technologii solárních modulů a problematiku indukované degradace vlivem potenciálu. Specifikuje klíčovou problematiku a možné prvky ovlivňující působení prostředí vzhledem k možným příčinám vzniku degradace. Obsahuje popis měření polykrystalických a monokrystalických technologií odolných vůči svodovému potenciálu. Dále bylo provedeno měření na vybraných testovacích kusech, které byly postihnuty degradací výkonu.
|
host ::
RSS.