|
Molekulární typizace izolátů z komplexu Arthroderma benhamiae, původce epidemické zoonotické dermatofytózy v Evropě
Čmoková, Adéla ; Hubka, Vít (vedoucí práce) ; Hrabák, Jaroslav (oponent)
Před několika lety byl druh Arthroderma benhamiae mezi klinickými mykology téměř neznámý, přesto dnes působí v České republice kolem 40 % dermatofytických infekcí přenesených ze zvířat na člověka. Rezervoárem druhu jsou především morčata a další hlodavci. Podobná situace je i v dalších státech střední a západní Evropy. Příčina výrazného nárůstu v incidenci infekcí zatím nebyla zjištěna, stejně jako nebyly navrženy dostatečně variabilní molekulární markery, které by tuto příčinu pomohly odhalit. Pro potřeby studie byly vybrány izoláty (n=268) z případů lidských i zvířecích dermatofytóz z ČR, Německa, Belgie, Švýcarska, Itálie, Japonska a USA. K odhalení vnitrodruhové variability bylo navrženo deset variabilních mikrosatelitních markerů a byla provedena sekvenční analýza dvou genetických lokusů (oblast ITS rDNA a gen gpdh). Studován byl také fenotyp kmenů na úrovni mikro- a makromorfologie, a růstové parametry kmenů při několika teplotách a na několika kultivačních médiích. Určeny byly i párovací typy jednotlivých izolátů a provedeny křížící pokusy mezi geneticky příbuznými i vzdálenými kmeny. Sekvenční analýza odhalila celkem 6 různých genotypů (SG1-SG6) mezi kmeny druhu A. benhamiae, většina (99%) kmenů patřila do 3 hlavních subpopulací: americko-evropské (SG1), evropské (SG2) a evropsko-japonské...
|
|
Epidemiologická charakteristika pediatrické populace idiopatických střevních zánětů
Schwarz, Jan ; Sýkora, Josef (vedoucí práce) ; Škvor, Jaroslav (oponent) ; Volf, Vladimír (oponent)
S rozvojem průmyslové revoluce, a s ní související změnou životního stylu, dochází i k postupnému nárůstu incidence idiopatických střevních zánětů (IBD). Chronické střevní záněty se tak stávají významnou skupinou autoimunitních chorob, jejichž incidence a prevalence celosvětově významně stoupá. Sledování incidence dětských IBD může přispět k identifikaci klinicky významných rizikových faktorů. Přesná etiologie a patofyziologie IBD není známa; jde o komplexní souhru intestinální dysbiózy, dysfunkce epitelu, aktivace imunitního systému a vlivů zevního prostředí u geneticky vnímavého jedince. Epidemiologická data poukazují na velmi významný vliv faktorů zevního prostření. Rozvoj IBD je spojován především s faktory, které ovlivňují mikrobiom a imunitní systém jedince. Mezi nejvýznamnější rizikové faktory patří strava, která uplatňuje své imunomodulační vlastnosti od novorozeneckého období do dospělosti. Primárním cílem této práce je prospektivně sledovat incidenci pediatrických IBD v Plzeňském kraji (PLK), získaná data analyzovat a porovnat s dostupnými daty z ČR i ze světa. Aby se minimalizovalo riziko neúplnosti dat, byla vytvořena aplikace, která je prospektivně získává z interní počítačové klinické databáze pomocí datového formuláře. Pro shrnutí charakteristik celé populace byla použita standardní...
|
| |
|
Bariérový ošetřovatelský režim u pacientů s infekčním onemocněním na standardním lůžkovém oddělení
Vanclová, Barbora ; Trojánek, Milan (vedoucí práce) ; Neugebauer, Jan (oponent)
Bakalářská práce s názvem "Bariérový ošetřovatelský režim u pacientů s infekčním onemocněním na standardním lůžkovém oddělení" se zabývá znalostmi nelékařského zdravotnického personálu v problematice bariérové ošetřovatelské péče a bariérových izolačních režimů, jejich následným aplikováním v praxi na jednotlivých standardních odděleních a případnými způsoby, které by zvýšily motivaci tohoto personálu k dodržování bariérových opatření. Cíle: Cílem této práce je zjistit, zda zdravotnický personál při péči o nemocné s infekčním onemocněním dodržuje bariérová opatření a jaké má v této problematice znalosti, případně z jakého důvodu opatření nedodržuje a jaká by byla případná motivace k jejich dodržování. Metody: Výzkum byl proveden formou dotazníkového šetření, které bylo provedeno ve 4 nemocnicích, a to v MMN a.s., Oblastní nemocnici Jičín a.s., Oblastní nemocnici Trutnov a.s. a Oblastní nemocnici Náchod a.s. Dotazník obsahoval celkem 23 otázek, z nichž bylo 6 otázek otevřených a 17 otázek výběrových. Pro následnou analýzu se nakonec podařilo získat 69 plně vyplněných dotazníků. Výsledky: Po statistickém zpracování dat bylo zjištěno, že znalosti nelékařského zdravotnického personálu v této problematice nejsou zcela vyhovující, a tudíž často nedochází ani ke správnému využívání bariérových režimů....
|
|
Epidemiologické modelování šíření nemoci Covid-19
Motlíčková, Klára ; Ředina, Richard (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá matematickým kompartmentovým modelováním pandemie COVID-19. Jsou zde přiblíženy základní epidemiologické modely a uvedeno šest studií, které se zabývají chováním viru SARS-CoV-2 za různých podmínek. Na modelu SIR je proveden odhad parametrů, výpočetně pro první a čtvrtou vlnu epidemie, dále pomocí algoritmu v prostředí MATLAB provedena optimalizace pro všechny vlny epidemie v ČR a také pro čtvrtou vlnu epidemie na modelu SEIR. Pro model SIR je také modelován vliv protiepidemických opatření.
|
|
One Health approach to understand emerging zoonotic pathogens in the Trichophyton benhamiae complex
Čmoková, Adéla ; Hubka, Vít (vedoucí práce) ; Buchta, Vladimír (oponent) ; Gené, Josepa (oponent)
Komplex druhů Trichophyton benhamiae zahrnuje několik zoonotických patogenů, které vědeckou komunitu stále více znepokojují kvůli svému epidemickému šíření mezi domácími zvířaty a jejich majiteli. Zvláštní obavy vzbuzuje náhlé objevení a rychlé šíření kmenů se žlutým fenotypem druhu T. benhamiae v Evropě. U patogenů z tohoto komplexu byla zjištěna značná genetická a fenotypová variabilita, avšak druhové hranice a hostitelské spektrum nebyly dosud jasně objasněny. Abychom prozkoumali rozmanitost, epidemiologii a taxonomii komplexu T. benhamiae, vytvořili jsme s kolegy mezinárodní mezioborový tým a uplatnili holistický "One Health" přístup. Shromáždili jsme rozsáhlý set kmenů z několika kontinentů spolu se souvisejícími údaji o hostitelích, klinickém obrazu a lokalitě. Vzhledem k vysoké míře klonality u běžně používaných DNA markerů jsem vyvinula nové typizační schéma založené na deseti mikrosatelitních a čtyřech sekvenčních markerech. Pro zjištění druhových hranic v komplexu T. benhamiae jsme využili polyfázický přístup, ve kterém jsme zohlednili data z fylogenetických, a populačně-genetických, fenotypových a fyziologických analýz spolu s charakterizací příslušnosti k jedné ze dvou křížících idiomorf a s ekologickými údaji. Díky našemu přístupu se nám podařilo uvnitř komplexu popsat čtyři nové...
|
|
Kampaně na eradikaci vybraných infekčních chorob ve Vietnamu s ohledem na socio-ekonomický a politický vývoj
Ostřanská, Simona
Tématem bakalářské práce je politický a socio-ekonomický vývoj Vietnamu a jeho působení na epidemiologickou situaci. V první části práce jsou popsány hlavní determinanty politického a socio-ekonomického vývoje a jejich vliv na epidemiologický a demografický vývoj Vietnamu. V této části je dále popsáno regionální a etnické členění. Navazuje část zabývající se epidemiologickým přechodem a obdobím uvedení reforem Đổi Mới a jejich dopadem na zdravotnictví. Hlavní část je poté zaměřena na epidemiologickou situaci po sjednocení Vietnamu a analýzu eliminace tuberkulózy a spalniček, kde jsou detailněji rozebrány implementované kampaně a překážky procesu eliminace. Na základě této části je vybráno téma pro poslední kapitolu, které se týká nerovnosti ve společnosti a problematice etnických menšin.
|
|
Infekční nemoci a problematika sanitace na příkladu vybraných regionů Indie
Krupicová, Vendula
Bakalářská práce se zabývá infekčními onemocněními a nedostatečnou sanitací v Indii. V práci je popsán epidemiologický i demografický vývoj, na což navazují konkrétní případy onemocnění v Indii a dále s tím související sanitační situace. Teoretická část je rozdělena na obecný přehled teorií a dále pak na zařazení Indie v rámci epidemiologie. Třetí část se zabývá sanitační situací v zemi a porovná přístup k hygieně mezi venkovem a městem, zmíní důsledky špatné hygieny a na závěr vyhodnotí některá vládní opatření jako řešení sanitační situace. Ve čtvrté části jsou zmíněné dvě případové studie, které podrobněji upřesní situaci ve vybraných regionech Indie. Praktická část se zabývá rozhovory s odborníky, jež prováděli výzkum ve státě Džhárkhand a odbornicemi, jež porovnaly situaci v ČR a Indii. Diskuse a závěr obsahují shrnutí, naplnění cílů práce a podněty pro budoucí doplnění.
|
|
Demografický a epidemiologický vývoj ve středoasijských republikách bývalého SSSR po jeho rozpadu
Vymlátilová, Natálie
Bakalářská práce se zabývá analýzou demografického a epidemiologického vývoje ve středoasijských republikách v kontextu vlády SSSR a jejího rozpadu se zaměřením na situaci nejchudších zemí regionu, Kyrgyzstánu a Tádžikistánu, a s ní spojené zdravotní výzvy. Region středoasijských republik v době přítomnosti Sovětského svazu prošel řadou reforem ať už v oblasti politiky, ekonomiky, či společnosti, doprovázených vlivem na demografickou a epidemiologickou situaci regionu. Pád sovětského režimu způsobil dočasné porušení doposud relativně stabilního demografického a pozitivního epidemiologického vývoje, přičemž se v roce 1991 region ocitl před výzvou vzrůstající incidence několika onemocnění a s ní spojenou problematikou morbidity a mortality. Cílem práce je determinovat demografickou a epidemiologickou situaci panující v zemích Střední Asie po rozpadu SSSR za pomoci vybraných ukazatelů a analyzovat vývoj zdravotnictví, zdravotnických politik a programů implementovaných vládami a mezinárodními organizacemi a jejich výsledky v zemích Kyrgyzstánu a Tádžikistánu v kontextu vývoje od pádu SSSR.
|
|
Roztroušená skleróza - klinické a paraklinické markery pro sledování aktivity nemoci a faktory ovlivňující její průběh
Šťastná, Dominika ; Horáková, Dana (vedoucí práce) ; Libertínová, Jana (oponent) ; Taláb, Radomír (oponent)
Roztroušená skleróza (RS) je chronické neurologické onemocnění, které bez léčby vede u většiny pacientů v průběhu let až dekád k závažné invaliditě. Nemoc zatím neumíme vyléčit, máme ale stále více důkazů, že včasné zahájení protizánětlivé terapie a ovlivnění přidružených komorbidit má na její průběh zásadní vliv. K vyhodnocení faktorů ovlivňujících průběh RS a monitoraci terapeutických prostředků v reálné klinické praxi mají nezastupitelný přínos pacientské registry. Cílem této práce bylo v první řadě vyhodnotit na základě dat Českého celostátního registru pacientů s RS (ReMuS) trendy ve vedení terapie mezi lety 2013 a 2021. Následně práce reaguje prostřednictvím dat registru na nástup pandemie covidu-19 a věnuje se této problematice v kontextu RS. Podíl pacientů v ReMuS léčených vysoce účinnou chorobu modifikující terapií (HE-DMT) se zvýšil v letech 2013 až 2021 z 16,2 % na 37,1 % a podíl terapeuticky-naivních pacientů zahajujících HE-DMT z 2,1 % na 18,5 %. Co se infekce covid-19 týče, na základě dat 958 pacientů s RS a anamnézou covidu-19 jsme určili, že vyšší body mass index, vyšší věk, recentní léčba vysokými dávkami glukokortikoidů a anti-CD20 terapie jsou nezávislými proměnnými asociovanými s pneumonií. Dále jsme analyzovali 1661 očkovaných pacientů s RS bez anamnézy covidu-19 a 495...
|