|
|
Úloha helikáz UAP56 a URH49 při virové infekci
Nováková, Veronika ; Šroller, Vojtěch (vedoucí práce) ; Šmahel, Michal (oponent)
Helikázy jsou proteiny s katalytickou schopností odvíjení dvouřetězcových nukleových kyselin. Významnou skupinou jsou helikázy s motivem DEAD, do nichž se řadí helikázy UAP56 a nověji objevená URH49. Jedná se o orthology a sdílí některé funkce. Obě helikázy se účastní sestřihu pre-mRNA a podílí se na transportu mRNA z jádra do cytoplazmy. Mírné odlišnosti obou helikáz mohou způsobovat odlišnou afinitu k různým mRNA. Nadprodukce helikázy URH49 byla zaznamenána v mnoha rakovinných tkáních, a proto bylo navrženo, že by mohla fungovat jako potenciální biomarker nepříznivých prognóz nádorových onemocnění. Asociace helikáz UAP56 a URH49 s jaderným exportem vedla k výzkumu jejich role při infekci buněk viry, které se replikují v jádře. Ukázalo se, že helikázy UAP56 a URH49 podporují replikaci virů několika způsoby. Buď se účastní transportu virových RNA do cytoplazmy a napomáhají tak k translaci pro virus důležitých proteinů či hrají roli v jejich enkapsidaci. Dále napomáhají rekrutování exportního komplexu, který je za normálních okolností závislý na tvorbě sestřihového aparátu, k virovým transkriptům bez intronů. U helikázy URH49 byla dále popsána aktivita vedoucí k potlačení jaderného exportu protivirových transkriptů. Klíčová slova: helikázy, DEAD-box, URH49, DDX39A, UAP56, DDX39B, životní cyklus viru
|
|
|
Helikáza DHX9 a její role ve virových infekcích
Kertisová, Anna ; Horníková, Lenka (vedoucí práce) ; Saláková, Martina (oponent)
Helikázy jsou proteiny, které zajišťují odvíjení vláken víceřetězcových konformací nukleových kyselin. DHX9 je zástupcem helikáz s DExD/H motivem. Jako substrát rozeznává molekuly RNA, DNA a hybridní struktury. V jádře eukaryotických buněk se DHX9 účastní vytváření replikační vidličky či působí v komplexu transkripčních faktorů a propojuje jiné proteiny s RNA polymerázou II. Následně DHX9 reguluje posttranskripční úpravy RNA. Po přechodu do cytoplasmy napomáhá správnému průběhu translace strukturovaných mRNA. Vzhledem k tomu, že se DHX9 účastní procesů spojených s nukleovými kyselinami, je zkoumána její úloha v životním cyklu virů. Zároveň je součástí antivirových signalizačních drah buňky. DHX9 poskytuje výhodu RNA virům a retrovirům v jejich replikačním cyklu různými způsoby. Signifikantní je vazba DHX9 na sekundární struktury virových RNA a jejich případná remodelace, která vede k podpoře virové replikace, transkripce i translace. Oproti tomu DNA viry využívají DHX9 k regulaci hostitelské exprese a minimalizaci její antivirové funkce. Pochopení vztahů hostitelských proteinů a virů může vést do budoucna k efektivnějšímu cílení terapeutických preparátů proti virovým infekcím. Klíčová slova: helikázy, DExD/H-box motiv, DHX9, viry, životní cyklus viru
|
|
|
Analýza životního cyklu BK viru
Bakardjieva - Mihaylova, Violeta ; Drda Morávková, Alena (vedoucí práce) ; Mindlová, Martina (oponent)
Polyomaviry jsou malé neobalené DNA viry, jejichž replikace probíhá v buněčném jádře. I přes svoji malou genomovou velikost mohou tyto viry způsobit výrazné změny v hostitelské buňce, jednou z nejvýznamnějších je nádorová transformace. Většina studií lidských patogenů z této čeledi je středem zájmu klinických výzkumů, které však neposkytují dostatek informací o jednotlivých událostech životního cyklu virů. Tato práce se hlavně zabývá přesným určením doby kdy dochází ke vzniku jednotlivých virových produktů a vytvořením časového sledu událostí během infekce v přirozených buňkách, které jsou cílem pro BKV v lidském organizmu. Bylo zjištěno, že časový průběh životní cyklus BKV se velice podobá těm pro modelové polyomaviry MPyV a SV40 a v permisivních buňkách trvá přibližně 40 - 50 hodin.
|
host ::
RSS.