| |
|
Experimental Investigation of selected supramolecular systems by NMR spectroscopy
Šoltésová, Mária ; Lang, Jan (vedoucí práce) ; Kříž, Jaroslav (oponent)
The thesis describes investigation of two selected supramolecular systems by means of NMR spectroscopy and hydrodynamic calculations. The first system studied was inclusion complex of cryptophane-C with chloroform. Initially, the kinetics of complexation was determined. The measurements of longitudinal relaxation and heteronuclear Overhauser enhancement on carbon-13 nuclei revealed very large motional coupling between the host and the molecular guest bound inside the cavity. Hydrogen bonded clusters of ethanol in a non-polar solvent were the second system addressed. The diffusion coeffcients of ethanol were measured in a broad temperature range (180 - 330 K) by means of NMR spectroscopy. The average cluster sizes dependent upon experimental conditions were determined. At low temperature (around 180 K), the cluster sizes vary from hexamer (0.16 M sample) to octamer or larger structures (1.4 M sample). On the other hand, the average cluster size at ambient temperature corresponds to trimer (1.4 M), pure monomer occurs in the less concentrated sample above 308 K. Experimental results for monomer are in excellent agreement with the calculated values.
|
|
Využití Ramanovy optické aktivity při studiu konformace strukturně významných skupin v peptidech a proteinech
Kubáňová, Markéta ; Baumruk, Vladimír (vedoucí práce) ; Kapitán, Josef (oponent)
Ramanova optická aktivita (ROA) je moderní spektroskopická metoda, kterou lze s úspěchem aplikovat na celou řadu chirálních vzorků, od malých organických molekul až po komplexní biomolekulární systémy. K důležitým aplikacím ROA patří studium struktury peptidů a proteinů v roztoku. Cílem diplomové práce bylo nalézt a ověřit vztah mezi trojrozměrnou strukturou a Ramanovou optickou aktivitou disulfidové a amidové skupiny v peptidech. V ROA spektrech poly(Pro-Gly-Pro), oxytocinu a hinge peptidu s navázanou antigenní sekvencí byly nalezeny charakteristické znaky konformace polyprolin II (levotočivého 31-helixu). U modelových cyklodextrinových struktur přemostěných disulfidovými můstky byl v ROA spektrech pozorován signál v oblasti S-S a C-S valenčních vibrací. V ROA spektru oxytocinu (peptid s jedním S-S můstkem) byl nalezen pozitivní ROA signál v oblasti S-S valenčních vibrací, který je podle teoretických výpočtů na modelových disulfidech indikátorem kladného dihedrálního úhelu C-S-S-C. Tento výsledek je ve shodě s krystalovou strukturou. Zabývali jsme se také rozšířením měření ROA spekter do oblasti valenčních vodíkových vibrací (2500-3200 cm-1).
|
|
Studium chirálních aspektů biotransformace léčiv instrumentálními analytickými metodami
Holmanová, Veronika ; Nobilis, Milan (vedoucí práce) ; Kovaříková, Petra (oponent)
Univerzita Karlova v Praze Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a kontroly léčiv Kandidát: Bc. Veronika Holmanová Školitel: Doc. PharmDr. Milan Nobilis, CSc. Název diplomové práce: Studium chirálních aspektů biotransformace léčiv instrumentálními analytickými metodami Byla vyvinuta nová chirální chromatografická metoda pro zhodnocení stereospecifity lidských a potkaních cytosolických karbonylreduktas a mikrosomálních oxidas zapojených do biotransformace nabumetonu. Vzniklá LLE-HPLC-PDA metoda umožňovala extrakci, separaci a UV detekci prochirálního nabumetonu a jeho metabolitů I.fáze biotransformace, včetně enantiomerů dvou chirálních produktů karbonylové redukce. Jako vnitřní standard sloužil methylester naproxenu. Pro liquid-liquid extrakci byl použit diethylether. Dostatečnou separaci 9 analytů zajišťovala za isokratických podmínek mobilní fáze o složení MeOH 1M NaClO4 pH 3 (75:25, v/v) ve spojení s Chiralcel OD-R 250mm×4.6 mm kolonou. Při průtoku 0,5 ml/min trvala jedna analýza 60 min. Efluent z kolony byl monitorován photodiode-array detektorem (zaznamenávající celé spektrum nebo vybrané vlnové délky - 225 a 265 nm). Výsledky biotransformace nabumetonu in vitro s cytosolickými a mikrosomálními frakcemi hepatocytů byly porovnány u dvou živočišných druhů (potkan,...
|
|
Využití chirálních stacionárních fází na bázi teikoplaninu a teikoplanin aglykonu pro enantioseparaci FMOC- derivatizovaných aminokyselin.
Repko, Pavel ; Bosáková, Zuzana (vedoucí práce) ; Tesařová, Eva (oponent)
V této práci byla vyvíjena a následně optimalizována enantioselektivní HPLC metoda s UV a fluorimetrickou detekcí pro chirální sparaci čtyř aminokyselin (D/L- alanin, D/L-valin, D/L-leucin, D/L-isoleucin) v nativní a zejména derivatizované podobě s důrazem na enantioseparaci D-analogů. Retenční a enantioseparační chování studovaných analytů bylo sledováno na třech chirálních stacionárních fázích založených na bázi teikoplaninu (Chirobiotic T, Chirobiotic T2) a teikoplanin aglykonu (Chirobiotic TAG). Na koloně Chirobiotic T byly provedeny enantioseparace nederivatizovaných aminokyselin za UV detekce při 205 nm v mobilní fázi methanol/voda v různém objemovém poměru a bylo dosaženo úplného rozlišení L- a D-forem až na základní linii avšak s velmi nízkou citlivostí detekce. Pro její zvýšení byla provedena derivatizace aminokyselin pomocí 9-fluorenylmethylchloromravenčanu (FMOC-Cl). Průběh derivatizačního postupu byl sledován na koloně Chirobiotic T s fluorimetrickou detekcí (λEx = 254 nm, λEm = 314 nm) v pufrované mobilní fázi methanol/0,5% triethylamoniumoctanový (TEAA) pufr, pH 6,0 40/60 (v/v). Z hlediska derivatizace se jako nejvhodnější jevil objemový poměr 1/1 D/L-aminokyselina/derivatizační činidlo s desetinásobně vyšší koncentrací derivatizačního činidla. Pro studium retenčního a enantioseparačního...
|
|
Studium enantioseparace vybraných substituovaných binaftylů
Loukotková, Lucie
SHRNUTÍ V posledních desetiletích dvacátého století se podařilo objevit mnoho stereoselektivních reakcí, díky kterým jsme schopni synteticky připravit čisté enantiomery řady látek, majících široké využití v nejrůznějších oblastech lidského života. Mezi významné katalyzátory asymetrických reakcí patří deriváty binaftylu. Binaftyly se vyznačují pozoruhodnými vlastnostmi chirálního rozpoznávání pramenícími z jejich chirality a prostorového uspořádání. Většina molekul 1,1'-binaftylu je C2 symetrická se dvěma identickými substitučními skupinami, které bývají často umístěny v polohách 2 a 2'. Chiralita derivátů 1,1'- binaftylu je dána stéricky bráněnou rotací atomů nebo skupin atomů kolem jednoduché vazby binaftylového skeletonu. Cyklodextriny (CD) a polysacharidy jsou přírodní oligomery a polymery, jejichž základními stavebními jednotkami jsou glukosové jednotky. CD a polysacharidy a jejich deriváty byly s úspěchem použity jako chirální stacionární fáze (CSP) pro enantioselektivní separace velkého počtu strukturně odlišných látek. Mezi CSP na bázi polysacharidů vyniká tris(3,5-dimethylfenylkarbamát) celulosy. Kromě přírodních polymerních chirálních selektorů mohou poskytnout srovnatelné separační podmínky zcela syntetické polymery. Nedávno byly připraveny tři nové syntetické polymerní CSP založené na...
|
|
Studium interakcí podílejících se na mechanizmu separace v chromatografických separačních systémech
Kalíková, Květa
Předkládaná práce kombinuje teoretické přístupy směřující k objasnění separačních systémů a interakčních mechanizmů s aplikacemi pro konkrétní analytické účely. HPLC se řadí mezi nejčastěji používané separační metody. Volba vhodného separačního systému se často provádí empiricky, na základě zkušeností experimentátora, podle informací získaných z literatury, s využitím některých optimalizačních programů nebo čistě postupem pokus-omyl. Pro výběr optimálních separačních podmínek, tj. výběr vhodné stacionární fáze a mobilní fáze je však nutné hlubší poznání interakčních a retenčních mechanizmů. Jedním z možných semiempirických postupů charakterizace separačních systémů je metoda lineárních vztahů volných energií (LFER - Linear Free Energy Relationship). Proces optimalizace separace může velmi zkomplikovat výskyt systémových píků. Existují případy, kdy je daná systémová zóna detekovatelná a ve výsledném chromatogramu se objeví více píků než odpovídá počtu analyzovaných látek anebo systémová zóna "interaguje" se zónou analytu a nastává tzv. rezonance. Porozumění jevům probíhajícím v chromatografických separačních systémech má zásadní vliv jak na optimalizaci separačních podmínek tak na správnou interpretaci analytických dat, a tudíž výsledky analýzy. Model LFER byl použit k porovnání tří chirálních...
|
| |
|
Resumovaná chirální poruchová teorie a studium Kl4 rozpadů
Motloch, Pavel ; Novotný, Jiří (vedoucí práce) ; Kampf, Karol (oponent)
V isospinové limitě jsme v resumované chirální poruchové teorii vypočítali form- faktory F a G rozpadů Kl4 do řádu O(p4 ). Odvodili jsme výrazy pro reparametrizaci nízkoenergetických konstant L1 - L3 pomocí experimentálních pozorovatelných a tyto jsme použili k získání hodnot nízkoenergetických konstant z nejnovějších ex- perimentálních dat. Poté jsme odhadli teoretickou chybu výsledku a vyšetřovali závislost na parametrech X, Z spontánního narušení chirální SU(3)×SU(3) syme- trie a poměru kvarkových hmot. Dále diskutujeme konvergenci formfaktorů v resumovanné chirální poruchové teorii a naznačujeme, že přidání σ jako explic- itního stupně volnosti do chirální poruchové teorie by mohlo výrazně vylepšit konvergenci chirálních řad. 1
|
|
Molekulární rozeznávání v plynné fázi: chirální rozeznávání
Vinklová, Nicole ; Roithová, Jana (vedoucí práce) ; Bednář, Petr (oponent)
Tato práce se zabývá molekulárním rozeznáváním chirálních sloučenin v plynné fázi. Jako detekční metoda byla použita tandemová hmotnostní spektrometrie. Hlavní sledované sloučeniny byly MacMillanovy organokatalyzátory a prolin s různou chiralitou. Byly provedeny 3 experimenty. Hledání prahových hodnot vazebných energií v komplexech prolinu s aminy, kde se testovaly komplexy s 2-aminobutanem a 2-aminohexanem různé chirality. Studium stability trimerních komplexů (Cu2+ a chirálních ligandů), které bylo prováděno při dvou kolizních energiích. Zde byl pozorován největší chirální efekt. A měření rychlostních konstant, kde se sledovaly disociační a výměnné reakce komplexů. Klíčová slova: hmotnostní spektrometrie, kinetická metoda, chirální sloučeniny, chirální rozeznávání, prolin, organokatalýza
|
host ::
