|
Aplikace pro zarovnávání částí DNA
Kašpárek, Tomáš ; Žák, Jakub (oponent) ; Rozman, Jaroslav (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá metodami zarovnání sekvenci DNA se zaměřením na rychlost prováděného úkonu a jeho optimálnost. Výsledkem práce je několik programů, které předvádějí zarovnávací algoritmy a jejich verze programované za použití knihoven OpenCL, které jsou optimalizované na rychlost výpočtu. Text této práce seznamuje čtenáře s problematikou zarovnání DNA a jejím významem v biologii. Dále jsou zde prezentovány algoritmy pro zarovnání DNA a možnosti jejich paralelizace za použití knihoven pro paralelní zpracování dat jako jsou CUDA či OpenCL.
|
|
Automatická tvorba slovníků z překladových textů
Sumbalová, Lenka ; Kouřil, Jan (oponent) ; Smrž, Pavel (vedoucí práce)
Cílem této bakalářské práce bylo vytvořit systém pro automatickou tvorbu slovníků z překladových testů. Je popsána implementace systému, který generuje česko-anglický slovník ze zarovnaného paralelního korpusu a shrnut výsledek práce. Dále je analyzován paralelní korpus CzEng, který byl použit jako zdroj dat pro slovníky a vysvětleny teoretické pojmy související s touto problematikou.
|
|
Automatická tvorba paralelního korpusu z titulků k filmům
Straňák, Marek ; Černocký, Jan (oponent) ; Smrž, Pavel (vedoucí práce)
Táto práca sa zaoberá tvorbou paralelného korpusu, ktorého zdrojom sú filmové titulky. Konkrétne sa jedná o zarovnanie českých a anglických viet s využitím slovníkov a morfologických analyzátorov, prípadne zarovnanie titulkov v iných jazykoch na základe časovania jednotlivých komentárov. Práca taktiež pojednáva o obecnej problematike paralelných korpusov.
|
|
Paralelní korpusový manažer
Kouřil, Jan ; Dytrych, Jaroslav (oponent) ; Smrž, Pavel (vedoucí práce)
Cílem diplomové práce bylo implementovat paralelní korpusový manažer, který umí zarovnat paralelní cizojazyčné texty a vložit je do korpusu, kde jsou poskytnuty další funkce pro jejich zpracování. Program poskytuje možnosti automatického zarovnání paralelních textů a jejich interaktivní úpravy. Tyto zarovnané texty se následně vkládají do korpusu. Program umí spravovat několik korpusů, paralelní korpus je identifikován vždy dvojicí jazyků. V korpusu je potom možno vyhledávat podle několika kategorií, zobrazovat a editovat jednotlivé výběry, lemmatizovat a morfologicky značkovat dané texty, provádět různá třídění výběrů, importovat a exportovat data, různými způsoby upravovat korpus pro další snadnou navigaci a přidávat další významy do spravovaných slovníků. Jednotlivé kapitoly popisují úvod ke korpusové problematice, teorii zarovnání paralelních textů, morfologické značkování textu a lemmatizaci, externí nástroje v programu použité, nejčastější formáty titulků a implementační řešení jednotlivých problémů.
|
|
Předpovídání struktury proteinů
Tuček, Jaroslav ; Martínek, Tomáš (oponent) ; Burgetová, Ivana (vedoucí práce)
Práce popisuje prostorovou strukturu molekul bílkovin a databází uchovávajících representace této struktury, či její hierarchické klasifikace. Je poskytnut přehled současných metod výpočetní predikce struktury bílkovin, přičemž největší pozornost je soustředěna na komparativní modelování. Tato metoda je rovněž v základní podobě implementována a na závěr její implementace analyzována.
|
| |
| |
| |
|
Posouzení vybraných ukazatelů společnosti pomocí časových řad
Všianský, Martin ; Hejmalová, Helena (oponent) ; Doubravský, Karel (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá společností Authentica, s.r.o. Pro tuto společnost je v práci zpracováno několik finančních ukazatelů pomocí analýzy časových řad v průběhu posledních 9 let. Cílem práce je využití statistických metod pro zhodnocení finančního zdraví společnosti a následně návrhy na zlepšení zjištěné ekonomické situace. Práce se skládá ze tří částí. V teoretické části je uvedena teorie potřebná pro statistické zpracování časových řad. V praktické části je nejdříve představena společnost Authentica, s.r.o. a následně jsou statistické metody z teorie aplikovány pomocí formuláře vytvořeného v programu Visual Basic na konkrétní data z výročních zpráv. Dále je pomocí časových řad určena predikce vývoje na následující dva roky pro zvolené ukazatele. Poslední částí práce jsou návrhy na řešení zjištěných problémů.
|
|
Grafická reprezentace genomických a proteomických sekvencí
Pražák, Ondřej ; Kolářová, Jana (oponent) ; Maděránková, Denisa (vedoucí práce)
Úprava sekvencí DNA a jejich vhodné zobrazení je důležitou součástí analýzy, porovnání a dalšího zpracování. Úkolem této práce je seznámení s vlastnostmi genomických a proteomických sekvencí a nalezení metod pro jejich zobrazení. Z důvodu velkého množství postupů a jejich dělení, je v této práci uvedeno pouze několik zástupců. Všechny metody popsané v textu jsou dle zadání naprogramovány v prostředí Matlab. Pomocí krátkých sekvencí DNA několika živočichů jsou vyzkoušeny a porovnány s originálním výzkumem. Některé metody obsahují, vedle grafického zobrazení, i příklad dalšího zpracování, převážně podobnostní analýza. Závěrem práce je porovnání výsledků analýzy a vybrat nejvhodnější metodu.
|