|
Processing of image sequences from fundus camera
Klimeš, Filip ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
The aim of my master's thesis was to propose a method of retinal sequence analysis which will evaluate the quality of each frame. In the theoretical part, I will also deal with the properties of retinal sequences and the way of registering the images of the fundus camera. In the practical part the method of evaluating image quality is implemented. This algorithm is tested on real retinal sequences and its success is assessed. This work also evaluates the impact of proposed method on the registration of retinal images.
|
| |
|
Extrakce krevního řečiště z Fundus snímku lidského oka.
Pinkava, Marek ; Říha, Kamil (oponent) ; Minář, Jiří (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá zpracováním snímků sítnice lidského oka. Zrak je nejdůležitější lidský smysl a jeho poškození má pro člověka velmi vážné důsledky. Automatické zpracování snímků sítnice lidského oka zvyšuje efektivitu lékařských vyšetření a zrychluje diagnostiku onemocnění. Sítnice vykazuje unikátní vlastosti u každého jedince, a proto ji lze také využít pro identifikaci osob. V~práci je stručně rozebrána struktura a vlastnosti jednotlivých částí oka, zejména sítnice, a jejich možná onemocnění, jako je diabetická retinopatie, glaukom či věkem podmíněná makulární degenerace. Následně je v práci popsána reprezentace a vlastnosti digitálního obrazu. Poté se práce věnuje vybraným segmentačním metodám obrazů, a to prahování, detekcím hran a technikám segmentace založených na přizpůsobené filtraci. Výstupem práce je aplikace, ve které je implementováno několik segmentačních metod, pro extrakci krevního řečiště. U každé této metody lze nastavit parametry segmentace pro zajištění kvalitní extrakce krevního řečiště snímků různé kvality.
|
| |
|
Optic disc segmentation in retinal images
Vymazal, Bronislav ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
The goal of this thesis is to propose a compact algorithm for localizing, segmenting and tracking the optic disk in fundus images. For localizing the optic disk a new technique based on fast radial symmetry transform was used. The segmentation is based on the Chan-Vese model but is also extended about multi feature space and implemented in its localized version that helped to deal with image inhomogeneity. The optical flow approach base on lucas-kanade algorithm is used for tracking of the optic disk through the image sequences. The algorithms are evaluated on two different fundus image databases with different characteristics. First is high resolution databases containing 45 images and the second is noisy low resolution database containing 33 images provided separately for each color plane. The results are then compared to a gold standard reference values.
|
| |
|
Detekce bifurkací cévního řečiště na sítnici
Baše, Michal ; Zoltán, Szabó (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá detekcí bifurkací cévního systému sítnice a jeho vlastnostmi. Je zde vysvětlen princip snímání fotografií sítnice pomocí fundus kamery, optické koherentní tomografie (CLO) a skenovací laserové oftalmoskopie (SLO). Jsou zde uvedeny vlastnosti obrazů získaných fundus kamerou. V práci je uvedeno několik účinných prahovacích metod a vysvětleny nejdůležitější morfologické operace, jak s binárnímí, tak i s šedotónovými obrazy. Detekované bifurkace pak jsou využity pro registraci snímků metodou kvadratické transformace pomocí nalezených korespondujících bifurkací.
|
|
Multimodální registrace obrazů sítnice
Štohanzlová, Petra ; CSc, Tomáš Suk, (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá možnostmi registrace retinálních snímků z různých modalit, konkrétně optické koherentní tomografie (OCT), skenovací laserové oftalmoskopie (SLO) a fundus kamery. V první fázi práce je zájem soustředěn na registraci obrazu SLO na fundus snímek, což slouží k vymezení oblasti zájmu pro následnou registraci dat z OCT. Závěrečná fáze slouží k nalezení správné pozice B-skenů ve fundus snímku. Na základě prostudování různých registračních metod byl pro registraci v obou případech použit postup využívající výpočet korelačního koeficientu. Pro nalezení optimálních parametrů registrace je použito prohledávání celého prostoru parametrů. V dílčích částech práce pak je vytvořen algoritmus pro vyrovnání OCT B-skenů s následnou detekcí cév a také jednoduchý algoritmus pro detekci cév z fundus snímku. Pro zpřehlednění registrace bylo vytvořeno grafické uživatelské rozhraní, které umožňuje načtení vstupních obrazů a přehledné zobrazení výsledku v několika možných formách.
|
|
Lícování snímků sítnice pomocí metody fázové korelace
Šikula, Viktor ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá lícováním snímků sítnice pomocí metody fázové korelace. Jsou zde popsány vlastnosti obrazů sítnice a způsob jejich snímání. V práci je vysvětlen postup pro zjištění měřítka, rotace a posunu mezi dvěma obrazy sítnice metodou fázové korelace. K lícování jsou použity snímky z fundus kamery a skenovací laserové oftalmoskopie (SLO). V práci je popsáno vyhledávání korespondujících značek pomocí fázové korelace a registrace kvadratickou transformací. Výsledky registrace jsou objektivně i subjektivně vyhodnoceny.
|
|
Automatic detection of neural fibers losses
Václavek, Martin ; Jiřík, Radovan (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
This work is focused on detection of loss in nerve fibre layer on colour pictures of retina, witch are makes by fundus camera. It describe every simple objects of retina, optic nerve head, macula lutea and vascular bed. It detect optic nerve head and his near area, witch is general for detection of breakdownds. It use several metodes of picture adjusting for picture elaboration and objects detection (segmentation, thresholding, enhancement, hough transformation ). The detection of loss in nerve fibre layer is based on comparing of statistic parameters ( average, standart deviation, skewness coefficient and kurtosis coefficient histogram, entropy ) in choosed areas with and withou destruction of nerve layers. Vascular bed have badwatsh on results, cause of this we using hand choosing of essay.
|