|
|
Vyhledávání příbuzných proteinů s modifikovanou funkcí
Hon, Jiří ; Bendl, Jaroslav (oponent) ; Martínek, Tomáš (vedoucí práce)
Proteinové inženýrství je dynamicky se rozvíjecí obor s velkým množstvím potenciálních aplikací v praxi. Úspěch v tomto oboru je však podmíněn co nejlepším využitím všech dostupných informací o proteinech, k čemuž se využívá množství bioinformatických nástrojů a analýz. Cílem této práce je vytvoření nového nástroje na podporu proteinového inženýrství, který by umožnil vyhledávání příbuzných proteinů s modifikovanou funkcí ve stále rostoucích proteinových databázích. Návrh tohoto nástroje je koncipován jako spojení řady existujících bioinformatických analýz a umožní identifikovat příbuzné proteiny se stejným typem enzymatické funkce, avšak s mírně modifikovanými vlastnostmi, především z hlediska selektivity, reakční rychlosti a stability.
|
|
|
Computational Methods for Annotation Analysis of Genetic Variations
Fülöp, Tibor ; Bendl, Jaroslav (oponent) ; Martínek, Tomáš (vedoucí práce)
Analysis and interpretation of DNA variations is very crucial for research trying to solve genetic background of heritability, diseases and other traits. This thesis briefly introduces the field of molecular biology and basic principles of genetics, discusses genetic variation annotation methods, genome-wide association studies and enrichment analysis methods with their implementation algorithms. As a part of this thesis, we introduce a novel web tool called Varanto that can be used to annotate, visualize and analyse genetic variations. It can be used to perform hypergeometric test based annotation enrichment analysis for a set of genetic variations. Varanto includes a web based user interface developed using Shiny web application framework for R. Varanto's performance and functionality is tested and showcased by performance benchmarks and by analysing and interpreting data from previously published genome-wide association studies.
|
|
| |
|
|
Zavěšení kol sportovního automobilu
Martínek, Tomáš ; Beran, Martin (oponent) ; Zháňal, Lubor (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá návrhem zavěšení přední a zadní nápravy jednosedadlového sportovního vozu. Po teoretickém úvodu do problematiky následuje návrh a optimalizace geometrických parametrů náprav. Další část je zaměřena na výpočty odpružení vozidla a na sestrojení řízení. Na závěr jsou uvedena konstrukční řešení jednotlivých dílů.
|
|
|
Návrh programu pro tvorbu a řešení příkladů z prostého tahu/tlaku prutů a jejich soustav
Martínek, Tomáš ; Kubík, Petr (oponent) ; Polzer, Stanislav (vedoucí práce)
Hlavním cílem této práce je vypracování programu, který bude řešit úlohy z oblasti prostého tahu/tlaku prutů a prutových soustav v rozsahu bakalářského studia. Práce se sestává ze dvou programů, vypracovaných ve vývojovém prostředí Borland Delphi. Programy umožňují uživateli definovat prut (prutovou soustavu) na základě geometrických parametrů a vazeb, určí míru statické neurčitosti, provedou potřebné výpočty a v případě potřeby určí deformační podmínku (program pro řešení prutu). Písemná část práce slouží jako manuál k přiloženým programům.
|
|
| |
|
|
Vliv přijetí eura na německou ekonomiku
Martinek, Tomáš ; Pavlík, Zdeněk (vedoucí práce) ; Kopecký, Jan (oponent)
Abstrakt Euro, jakožto společná měna je jedním z největších a nejambicióznějších projektů v dějinách měnové integrace. Cílem práce je analyzovat vliv přijetí eura na německou ekonomiku. V první kapitole se práce zabývá historií a vznikem eurozóny. Popisuje počátky měnové integrace od prvních myšlenek až po současnost. Druhá část práce je pak věnovaná samotné analýze. Předmětem zkoumání jsou makroekonomické ukazatele. Cílem analýzy je zjistit jak a zdali vůbec euro ovlivnilo německou ekonomiku. Záměrem je objektivně posoudit, které části ekonomiky postihla společná měna pozitivně a které negativně.
|
|
|
Podnikatelský plán startup jdinapiknik.cz
Martinek, Tomáš
Tato bakalářská práce zpracovává návrh podnikatelského plánu pro začínající podnikatelský subjekt. V teoretické části jsou popsány jednotlivé části vybraného typu podnikatelského plánu. Vlastní práce vytváří podnikatelský plán a definuje rizikové oblasti spolu s návrhy na jejich minimalizace. Výsledek práce vyhodnocuje tento podnikatelský plán jako realizovatelný.
|
|
|
Numerical simulation of videokymographic images from the results of the finite element model
Švancara, P. ; Horáček, Jaromír ; Martínek, T. ; Švec, J. G.
The study presents a two-dimensional (2D) finite element (FE) model of the fluid-structure-acoustic interaction during flow induced self-oscillation of the human vocal folds. The FE model combines the FE models of the vocal folds, the trachea and the simplified human vocal tract shaped for phonation of vowel [a:]. The fluid-structure interaction is solved using explicit coupling scheme with separated solvers for structure and fluid domain. The developed FE model comprises large deformations of the vocal-fold tissue, vocal-fold contact, fluid-structure interaction, morphing the fluid mesh according to the vocal-fold motion (Arbitrary Lagrangian-Eulerian approach), solution of unsteady viscous compressible airflow described by the Navier-Stokes equations and airflow separation during the glottis closure. The effect of lamina propria thickness and material properties on simulated videokymographic (VKG) images of vocal-fold vibrations are analyzed. Such variation of the lamina propria properties can be caused by certain vocal-fold pathologies such as Reinke's edema. The developed FE model can be used to study relations among pathological changes in vocal folds tissue, the resulting VKG images and the produced sound spectra.
|
|
|
Finanční analýza společnosti Zentiva N.V.
Švehlová, Hana ; Cimický, Jan (vedoucí práce) ; Martinek, Tomáš (oponent)
Cílem této bakalářské práce je vypracování finanční analýzy konkrétní společnosti -- Zentiva N.V. -- za období 2003 až 2007. V rámci metodologické části jsou představeny základní metody finanční analýzy, které jsou následně v praktické části aplikovány k posouzení finančního zdraví společnosti.
|
host ::
RSS.