|
|
Spektroskopické studium klíčových biomolekulárních interakcí pro terapeutické aplikace modifikovaných oligonukleotidů
Kříž, Martin
Název práce: Spektroskopické studium klíčových biomolekulárních interakcí pro terapeutické aplikace modifikovaných oligonukleotidů Autor: Martin Kříž Katedra / Ústav: Fyzikální ústav UK Vedoucí disertační práce: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc., Fyzikální ústav UK Abstrakt: Disertační práce je zaměřena na studium biomolekulárních interakcí, které mají zásadní význam pro terapeutické použití modifikovaných oligonukleotidů. Byly studovány jednak interakce nukleových kyselin, konkrétně hybridní DNA:RNA duplexy s plně komplementárními sekvencemi, ale i DNA:RNA duplexy s centrálním mismatchem. Byl vytvořen molekulární model, pomocí kterého byl studován vliv pěti různých chemických modifikací v DNA vlákně na jeho vazební schopnosti. Strukturní změny byly charakterizovány pomocí Ramanovy spektroskopie za použití přesných diferenčních i dvojitých diferenčních spekter. Tyto údaje byly doplněny o termodynamické parametry získané z křivek tání pomocí UV absorpční spektroskopie. Dále byly pomocí Ramanovy spektroskopie studovány změny v konformaci proteinu Ribonukleázy L, ke kterým dochází po navázání ligandu, kterým je v tomto případě buď přirozený nebo modifikovaný krátký oligonukleotid. Měření s Ribonukleázou L byla prováděna za pomocí speciální experimentální techniky - DCDR spektroskopie. Klíčová slova:...
|
|
|
Diversita, fylogeneze a ekologie zástupců čeledi Geastraceae
Zehnálek, Petr ; Koukol, Ondřej (vedoucí práce) ; Kříž, Martin (oponent)
Čeleď Geastraceae je kosmopolitně rozšířenou skupinou hub se saprotrofním způsobem výživy. Její zástupci nesou základní rysy již neexistující třídy Gasteromycetes. Plodnice s angiokarpní morfologií se vyznačují dobře vyvinutými obaly plodnic s velmi odlišnými funkcemi. Častý a pro čeleď typický je i hvězdovitý tvar plodnice. Tato bakalářská práce se zabývá čeledí Geastraceae a klade si za cíl podat základní přehled o současné úrovni poznání této skupiny hub. Jedná se o skupinu se zaznamenanou ze všech kontinentů kromě Antarktidy. Zástupci čeledi Geastraceae jsou nalézáni na různých lesních i nelesních stanovištích a jedná se o saprotrofní druhy. Zástupci této čeledi jsou charakterističtí svou morfologií, k níž se váže řada speciálních termínů, a proto bude podrobně rozebrána. Cílem je také zrekapitulovat historický vývoj postavení čeledi Geastraceae v rámci systému stopkovýtrusných hub. Nedávné molekulárně fylogenetické studie přinesli překvapující poznatky o vnitřní taxonomii čeledi Geastraceae a příslušnost několika rodů do čeledi Geastraceae byla zpochybněna.
|
|
|
Spektroskopické studium klíčových biomolekulárních interakcí pro terapeutické aplikace modifikovaných oligonukleotidů
Kříž, Martin ; Štěpánek, Josef (vedoucí práce) ; Bednárová, Lucie (oponent) ; Mašek, Vlastimil (oponent)
Název práce: Spektroskopické studium klíčových biomolekulárních interakcí pro terapeutické aplikace modifikovaných oligonukleotidů Autor: Martin Kříž Katedra / Ústav: Fyzikální ústav UK Vedoucí disertační práce: Prof. RNDr. Josef Štěpánek, CSc., Fyzikální ústav UK Abstrakt: Disertační práce je zaměřena na studium biomolekulárních interakcí, které mají zásadní význam pro terapeutické použití modifikovaných oligonukleotidů. Byly studovány jednak interakce nukleových kyselin, konkrétně hybridní DNA:RNA duplexy s plně komplementárními sekvencemi, ale i DNA:RNA duplexy s centrálním mismatchem. Byl vytvořen molekulární model, pomocí kterého byl studován vliv pěti různých chemických modifikací v DNA vlákně na jeho vazební schopnosti. Strukturní změny byly charakterizovány pomocí Ramanovy spektroskopie za použití přesných diferenčních i dvojitých diferenčních spekter. Tyto údaje byly doplněny o termodynamické parametry získané z křivek tání pomocí UV absorpční spektroskopie. Dále byly pomocí Ramanovy spektroskopie studovány změny v konformaci proteinu Ribonukleázy L, ke kterým dochází po navázání ligandu, kterým je v tomto případě buď přirozený nebo modifikovaný krátký oligonukleotid. Měření s Ribonukleázou L byla prováděna za pomocí speciální experimentální techniky - DCDR spektroskopie. Klíčová slova:...
|
|
|
Nové diagnostické metody v dermatologii: neinvazivní diagnostika nemelanomových nádorů kůže
Kříž, Martin ; Arenberger, Petr (vedoucí práce) ; Pavel, Stanislav (oponent) ; Vašků, Vladimír (oponent)
Nemelanomové kožní nádory jsou vůbec nejběžnější rakovinou v populaci se světlým typem kůže. U pacientů s nemelanžovým kožním nádorem nebo aktinickou keratózou se stále častěji používají metody neinvazivní terapie, což přináší poptávku po vývoji nových neinvazivních vyšetřovacích metod. Cílem této práce je shrnout nová a aktuální data (state-of-art) v metodách diagnostiky nemelanomových kožních nádorů a aktinických keratóz. Do různých vědeckých internetových vyhledávačů byla zadána klíčová slova v anglickém jazyce týkající se diagnostiky nemelanomových kožních nádorů a aktinických keratóz. Klinické studie byly uspořádány podle typu diagnostické metody a jejich závěry byly porovnány na základě senzitivity, specifity a pozitivní prediktivní hodnoty. Vlastní pozorování se zaměřila na dvě z literatury nejperspektivnější neinvazivní metody - vysokofrekvenční ultrazvuk a bispektrální fluorescenční diagnostiku. Výsledky zpracovaných studií i vlastních pozorování porovnávají diagnostickou přesnost nových diagnostických technologií. Ukazuje se, že moderní neinvazivní zobrazovací technologie poskytují nové a doplňující údaje v diagnostice nemelanomových kožních nádorů a aktinických keratóz. Vysokofrekvenční ultrazvuk ukazuje vysoký potenciál při využití v každodenní klinické praxi při diagnostice nemelanomových...
|
|
| |
|
| |
|
|
Jazyk a styl čínské propagandy
Kříž, Martin ; Lomová, Olga (vedoucí práce) ; Sehnal, David (oponent)
Na základě provedených rozborů textů jsem určil některé typické znaky jazyka totalitní moci, které se objevují v jazyce agitátorů Komunistické strany Číny. Některé z nich odpovídají charakteristikám, kterými se vyznačuje LTI a jazyk komunistické propagandy ČSSR a SSSR a kterými se ve svých analýzách zabývali Victor Klemperer a Petr Fidelius. Jiné prvky jazyka propagandy Komunistické strany Číny jsou jedinečné a odrážejí hlavně kulturní odlišnosti. Největším tématem textů podrobených analýze byla Komunistická strana Číny a její úloha. V tomto směru se autoři textů občas dostali i k významu socialismu. V počátcích Čínské lidové republiky se kladl velký důraz na úlohu komunistické strany při založení republiky. Straně patřil v tomto směru všechen dík, neboť ta jediná se zasloužila o osvobození čínského lidu, sjednocení země a založení republiky. Strana byla odpovědná i za budoucnost lidu, neboť lid vedla a stanovovala cíle, které měly zem dovést ke světlým zítřkům. Ve spojení s počátky Čínské lidové republiky se také v textech objevil první, čistě čínský termín ,.demokratická diktatura lidu'' respektive "lidovědemokratická diktatura" (renmin minzhu zhuanzhenK Á !0 fl! i:' i")Jfr). Autorem nebyl nikdo jiný než "Velký kormidelník" Mao Zedong. V tomto případě jsem došel k závěru, že se jedná o změnu významu na...
|
|
|
Relaxované vyvažování binárních vyhledávacích stromů
Kříž, Martin ; Koubek, Václav (oponent) ; Koubková, Alena (vedoucí práce)
Na rozdíl od klasických vyvážených binárních vyhledávacích stromů, kdy proces vyvažování následuje bezprostředně po každém vložení nebo ubrání prvku, relaxované vyvažování umožňuje oddělit tyto fáze a provést vyvažování odděleně. Má význam například při paralelním přístupu k datům, kdy je možné vyvažování odložit na dobu, kdy je systém málo zatížen požadavky uživatelů. Další výraznou výhodou popsaných typů relaxovaného vyvažování je to, že pri paralelním přístupu k datům potřebují držet pouze konstatní počet zámku při modifikujících operacích a umožnují tak více modifikujících operací současně ve stromu. Cílem této práce je experimentálne porovnat klasickou a relaxovanou variantu AVL stromu v několika různých scénárích v paralelním prostředí podle počtu porovnání, počtu a typu rotací a podle spotřebovaného času.
|
|
|
Čínský ekonomický systém: tržní ekonomika či státní kapitalismus?
Bejkovský, Jan ; Jiránková, Martina (vedoucí práce) ; Stuchlíková, Zuzana (oponent) ; Fárek, Jiří (oponent) ; Kříž, Martin (oponent)
Práce se zabývá podstatou čínského ekonomického systému. V první kapitole se nejprve zaměřuje na světovou ekonomiku a snaží se o definování hlavních ekonomických systémů v ní převládajících, tj. anglosaského, kontinentálního a asijského rozvojového systému. Oproti těmto systémům jako tržním ekonomikám práce porovnává a definuje systém státního kapitalismu a jeho hlavní prvky. V další části je práce zaměřena na historické přístupy Číňanů k ekonomické governance země a pokouší se o definování historických přístupů, které jsou dodnes v čínské ekonomice relevantní. Třetí kapitola práce analyzuje čínský ekonomický systém a úlohu státu v něm; zkoumá rovněž přístup státu k vlastnictví státních podniků a celkový rozsah státního vlastnictví v čínské ekonomice mimo jiné na základě tzv. klíčových odvětví. Závěrečná kapitola pak zkoumá různé druhy státních podpor domácím, často státním, podnikům v Číně. Jako příklad kapitola využívá případovou studii na automobilový průmysl.
|
|
|
Návrh na zdanění příjmů legislativně neošetřeného podnikání v ČR
Kříž, Martin ; Cabala, Martin (oponent) ; Kopřiva, Jan (vedoucí práce)
Bakalářská práce obsahuje dvě části, teoretickou a praktickou. V teoretické části se práce zabývá stručně historií prostituce, jejím vývojem jak v evropském měřítku, tak i na území dnešní České republiky a také současným stavem právně-daňové úpravy prostituce u nás. Praktická část práce je zaměřena na srovnání dané problematiky s jinými evropskými zeměmi, současně navrhuje, jak by mohla v budoucnu nová úprava vypadat či jak by měla být ta stará zdokonalena.
|
host ::
RSS.