|
|
Synthesis of novel 5,6-disubstituted derivatives of uracil as potential drugs
Vu, Lien Phuong ; Kučerová, Marta (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Vu Lien Phuong Školitelé: PharmDr. Marta Kučerová, Ph.D. Tanja Bruun, M.Sc. (Pharm.) Prof. Jari Yli-Kauhaluoma Název diplomové práce: Synthesis of novel 5,6-disubstituted derivatives of uracil as potential drugs (Syntéza nových 5,6-disubstituovaných derivátů uracilu jako potenciálních léčiv) V této diplomové práci je uracil použit jako základní struktura především kvůli svým mnoha popsaným biologickým aktivitám jako je aktivita protinádorová, antivirová, antibiotická, hypoglykemická, diuretická a další. Hlavním cílem bylo připravit nové 5,6- disubstituované deriváty uracilu jako potenciální biologicky aktivní látky. 2,4,6-Trichlorpyrimidin byl použit k přípravě 6-chloruracilu, který byl kondenzován s fenoly nebo aniliny za vzniku příslušných 6-fenoxyuracilů a 6- phenylaminouracilů. Tyto meziprodukty pak byly použity k substituci v poloze 5 za účelem získání konečných produktů. Pro tento poslední - velmi obtížný krok byla použita různá alkylační a acylační činidla jako např. Vilsmeierovo činidlo, alkylchloridy, chloracetylchlorid, ethyl- chloroxoacetát a ethyl-bromacetát. Ethyl-bromacetát byl nejefektivnější a byly z něj připraveny čtyři nové 5,6- disubstituované deriváty uracilu....
|
|
|
Synthesis of isoprenoid naringenin derivatives
Kernal, Jakub ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Demuth, Jiří (oponent)
4 Abstrakt Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát Jakub Kernal Konzultant Hubert Chapuis, Ph.D. Název diplomové práce , intenzivního výzkumu pro své antibakteriální, antimykotické a cytotoxické - v této práci (Fig. 1) cí hydroxylové skupiny flavonoidu v poloze 4 , nebo esterifikací hydroxylových skupin na obou kruzích flavonoidu A -uhlík na kruhu A flavonoidu. Fig. 1. Modifikace molekuly naringeninu esterifikace (modrá) nebo tvroba vazby uhlík-uhlík .
|
|
|
The electrochemical reduction of the nitro group in a flow reactor
Jankových, Miroslav ; Kučera, Radim (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutickej chémie a farmaceutickej analýzy Študent: Miroslav Jankových Školiteľ: doc. PharmDr. Radim Kučera, PhD. Konzultant: PharmDr. Tomáš Holas, PhD. Názov diplomovej práce: Elektrochemická redukcia nitroskupiny v prietokovom reaktore Diplomová práca sa zaoberá spojením elektro-organickej a prietokovej chémie, kedy naším zámerom bola redukcia aromatickej nitroskupiny na aromatickú aminoskupinu. Spojením týchto dvoch prístupov vzniká zaujímavá kombinácia enviromentálne čistej a menej náročnej výroby aktívnych farmaceutických látok. Zámerom bolo zistiť, či reakcia prebieha a následne nájsť optimálne podmienky pre našu reakciu. Uskutočnili sme sériu rôznych experimentov, kde sme sledovali vplyv rôznych parametrov ako prietoková rýchlosť, napätie, prúd, elektrolyt. Tieto parametre sme rôzne kombinovali a pozorovali, aký majú vplyv na priebeh reakcie. Výsledkom práce sú predovšetkým základné informácie o vplyve vyššie spomenutých faktorov na reakciu. Zo série experimentov vyplynulo, že najlepšie podmienky sú prietoková rýchlosť 0,1 ml.min-1 , napätie 0,8 - 2,0 V a prúd 100 - 150 mA, elektrolyt NH4Cl, kedy bola dosiahnutá konverzia vyše 96 %.
|
|
|
Studium fotodynamické inaktivace prionů ftalocyaniny.
Kostelanská, Marie ; Holada, Karel (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent) ; Kolářová, Hana (oponent)
Transmisivní spongiformní encefalopatie neboli prionové choroby jsou smrtelná neurodegenerativní onemocnění postihující savce. U postižených jedinců se v CNS hromadí ložiska patologického prionového proteinu (PrPTSE ), která jsou příčinou smrti. Priony vykazují afinitu k různým povrchům a odolnost ke konvenčním sterilizačním procedurám. To zvyšuje riziko nosokomiálního přenosu prostřednictvím chirurgických nástrojů použitých při lékařských zákrocích na jedincích v subklinickém stádiu prionového onemocnění. V disertační práci posuzujeme použitelnost metody fotodynamické inaktivace (PDI) pro dekontaminace prionů. PDI byla iniciována deriváty ftalocyaninu (Pc): AlPcOH(SO3)2, SiPc(OH)2(SO3)1-3 nebo ZnPc(SO3)1-3 pro dekontaminace prionů. Světlem aktivované Pc generují reaktivní formy kyslíku, zejména singletní kyslík (O2(1 ∆g)), který jsme detekovali pomocí jodidové metody, inhibičního testu s NaN3 a oxidační degradací kyseliny močové. PDI v suspenzi infekčního mozkového homogenátu vedla k eliminaci signálu PrPres (fragment PrPTSE rezistentní proteináze K) pod detekční limit western blotu při nanomolární koncentraci AlPcOH(SO3)2. Úplná eliminace signálu PrPres byla doprovázena 20% redukcí koncentrace proteinů mozkového homogenátu, nedocházelo k fragmentaci ani agregaci proteinů. PDI indukovaná deriváty...
|
|
|
Construction of modified DNAs with selected reactive or protective groups
Vaníková, Zuzana ; Hocek, Michal (vedoucí práce) ; Křen, Vladimír (oponent) ; Zimčík, Petr (oponent)
Tato dizertační práce je zaměřená na syntézu DNA modifikované pomocí fotolabilních 2-nitrobenzylových chránících skupin a jejich aplikace v procesu regulace genové exprese. V první části mojí disertační práce je popsaná syntéza 2'-deoxyribonucleozid trifosfátu chráněných fotolabilními chránicími skupinami a jejich fotolýza na odchráněné hydroxymethylové trifosfáty. Všechny připraveny nukleosid trifosfáty byly dobrými substráty pro jejich enzymatickou inkorporaci do DNA. Syntetizovaný 5-(2-nitrobenzyloxy)methyl-2'- deoxyuridin-5'-monofosfát (dUNBMP) a DNA s jednou 5-(2-nitrobenzyloxy)methyl- modifikaci v sekvenci byli použity v podrobné studii kinetiky fotolytických reakcí. V druhé časti disertační práce byla připravena série modifikovaných DNA se specifickou sekvenci pomoci PEX a/nebo PCR. Štěpení modifikované DNA bylo studováno v přítomnosti vybraných restrikčních endonukleáz (RE). Ve všech případech byla DNA modifikovaná nitrobenzylovými skupinami úplně rezistentní vůči štěpení RE. V případě hydroxymethylové DNA s pozitivním štěpením pomoci RE, byly studovaný podmínky ochránění 2-nitrobenzylových zbytku na DNA, tedy 2-nitrobenzylové skupiny se jeví jako využitelné, bioortogonální přechodní chránění DNA proti štěpení restrikčními endonukleázami. V závěrečné časti, byly syntetizované...
|
|
|
Synthesis and study of azaphthalocyanine quenchers of fluorescence
Kántor, Michal ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Kučerová, Marta (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra: Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Michal Kántor Školiteľ: prof. PharmDr. Petr Zimčík, Ph.D. Konzultant: Mgr. Jiří Demuth Názov práce: Syntéza a hodnotenie zhášačov fluorescencie zo skupiny azaftalocyanínov Nesymetrické dialkylamino substituované azaftalocyaníny (AzaPcs) majú unikátne fotofyzikálne vlastnosti - absorpciu svetla medzi 300 a 700nm, skoro nulovú vlastnú fluorescenciu a schopnosť zhášať fluorescenciu ďalších zlúčenín. Tieto vlastnosti robia z AzaPcs vhodných kandidátov na univerzálne ,,dark quenchers", ktoré môžu byť využité v real time PCR. V tejto práci som sa zameral na hodnotenie rozdielov v zhášaní sond značených v rozdielnych pozíciách oligodeoxynukleotidového (ODN) reťazca. Boli pripravené dva zhášače z rôznymi substituentmi vhodnými k väzbe na rozdielne miesta ODN (viď Obr.). Nasledujúc syntézu zhášačov, boli pripravené tri rôzne sondy- jedna so zhášačom v strede ODN (Obr. A), druhá so zhášačom na konci ODN (Obr. B), tretia so zhášačom v strede a na konci ODN (Obr. C). Všetky pripravené sondy boli čistené na systéme HPLC a následne bola zmeraná a porovnaná efektivita zhášania týchto sond.
|
|
|
Deriváty kombinující fragment pyrazinamidu a 4-aminosalicylové kyseliny jako antimykobakteriální sloučeniny
Šlechta, Petr ; Zitko, Jan (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Řešitel: Petr Šlechta Vedoucí diplomové práce: doc. PharmDr. Jan Zitko, Ph.D. Konzultant: MSc. Ghada Basem Bouz, Ph.D. Název diplomové práce: Deriváty kombinující fragment pyrazinamidu a 4-aminosalicylové kyseliny jako antimykobakteriální sloučeniny Podle Světové zdravotnické organizace (WHO) je tuberkulóza (TB) celosvětově hlavní příčinou úmrtí na infekční onemocnění způsobené jedním infekčním agens a počet případů s lékově rezistentní TB se neustále zvyšuje. Tyto faktory vytvářejí urgentní potřebu vývoje nových, účinnějších antituberkulotik. Z těchto důvodů v této práci prezentujeme design, syntézu a antimikrobiální zhodnocení série hybridních sloučenin, kombinujících různé deriváty pyrazinamidu a p-aminosalicylové kyseliny, jako potencionálních antituberkulotických léčiv. Sloučeniny byly připraveny reakcí různých derivátů pyrazin-2-karboxylové kyseliny, po její aktivaci 1,1'-karbonyldiimidazolem s p-aminosalicylovou kyselinou v prostředí dimethylsulfoxidu jako rozpouštědla. Získané sloučeniny byly testovány in vitro pro zjištění jejich antimykobakteriální aktivity proti M. tuberculosis H37Rv, M. tuberculosis H37Ra a čtyřem dalším mykobakteriálním kmenům. Připravené sloučeniny byly dále...
|
|
|
Studium bariérových lipidů v kůži a kožních modelech
Sochorová, Michaela ; Vávrová, Kateřina (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent) ; Salavec, Miloslav (oponent)
1 Abstrakt Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra organické a bioorganické chemie Kandidát: Mgr. Michaela Sochorová Školitel: prof. PharmDr. Kateřina Vávrová, Ph.D. Název disertační práce: Studium bariérových lipidů v kůži a kožních modelech Jako "bariérové" označujeme lipidy nacházející se v nejsvrchnější vrstvě epidermis - stratum corneum (SC). Jedná se o přibližně ekvimolární směs ceramidů (Cer), volných mastných kyselin (MK) a cholesterolu (Chol). Tato směs je jedinečná svým složením i strukturou a zajišťuje bariéru, která chrání organismus před negativními vlivy vnějšího prostředí a současně brání nadměrným ztrátám vody a reguluje tak homeostázu organismu. Narušení kožní bariéry, včetně pozměněného složení a organizace bariérových lipidů, bylo popsáno u řady onemocnění postihujících kůži, jako je atopická dermatitida, psoriáza či rakovinná onemocnění kůže. Studium a terapie těchto onemocnění jsou limitovány jejich komplexní patofyziologií a nedostatkem biologického materiálu (lidské tkáně). Kožní modely tak představují vhodnou alternativu a užitečný nástroj pro studium kožních onemocnění. Modely využívané ve studiu kožní bariéry se liší svojí jednoduchostí/složitostí, způsobem přípravy a tudíž i druhem informací, které mohou poskytnout. Jednoduchým modelem mezibuněčné...
|
|
|
Ovlivnění pKa rozpoznávací části azaftalocyaninových sensorů
Čermáková, Veronika ; Zimčík, Petr (vedoucí práce) ; Zitko, Jan (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Autor: Veronika Čermáková Školitel: doc. PharmDr. Petr Zimčík, Ph.D. Název diplomové práce: Ovlivnění pKa rozpoznávací části azaftalocyaninových senzorů Azaftalocyaniny (AzaPc) jsou makrocyklické sloučeniny obsahující rozsáhlý systém konjugovaných dvojných vazeb, který jim uděluje schopnost absorbovat světlo v červené oblasti spektra. Jsou charakterizovány intenzivní červenou fluorescencí jako jednou z možných cest deaktivace excitovaných stavů po absorpci fotonu. Fluorescence AzaPc substituovaných fenolickou skupinou na periferii může být vypnuta/zapnuta v závislosti na pH okolního prostředí a pKa fenolické skupiny. V zásaditém prostředí se molekula nachází ve formě fenolátu a podstupuje tzv. intramolekulární přenos náboje mezi fenolátem, který slouží jako donor, a elektrondeficitním makrocyklickým jádrem, které slouží jako akceptor. Výsledkem je zhášení fluorescence. Přepínání mezi ON/OFF stavy u fenol-substituovaných AzaPc je závislé na koncentraci protonů, a proto mohou být tyto látky využity k monitorování pH. Cílem této práce byla syntéza derivátů fenol-substituovaných AzaPc, jejichž pKa fenolické skupiny je modulováno vhodnou substitucí v ortho pozici. Syntéza začala přípravou...
|
|
|
Studium bariérových lipidů v kůži a kožních modelech
Sochorová, Michaela ; Vávrová, Kateřina (vedoucí práce) ; Zimčík, Petr (oponent) ; Salavec, Miloslav (oponent)
1 Abstrakt Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra organické a bioorganické chemie Kandidát: Mgr. Michaela Sochorová Školitel: prof. PharmDr. Kateřina Vávrová, Ph.D. Název disertační práce: Studium bariérových lipidů v kůži a kožních modelech Jako "bariérové" označujeme lipidy nacházející se v nejsvrchnější vrstvě epidermis - stratum corneum (SC). Jedná se o přibližně ekvimolární směs ceramidů (Cer), volných mastných kyselin (MK) a cholesterolu (Chol). Tato směs je jedinečná svým složením i strukturou a zajišťuje bariéru, která chrání organismus před negativními vlivy vnějšího prostředí a současně brání nadměrným ztrátám vody a reguluje tak homeostázu organismu. Narušení kožní bariéry, včetně pozměněného složení a organizace bariérových lipidů, bylo popsáno u řady onemocnění postihujících kůži, jako je atopická dermatitida, psoriáza či rakovinná onemocnění kůže. Studium a terapie těchto onemocnění jsou limitovány jejich komplexní patofyziologií a nedostatkem biologického materiálu (lidské tkáně). Kožní modely tak představují vhodnou alternativu a užitečný nástroj pro studium kožních onemocnění. Modely využívané ve studiu kožní bariéry se liší svojí jednoduchostí/složitostí, způsobem přípravy a tudíž i druhem informací, které mohou poskytnout. Jednoduchým modelem mezibuněčné...
|
host ::
RSS.