|
|
Molecular mechanisms of sensitivity and resistance towards chemotherapeutics in most frequent solid cancers
Čumová, Andrea ; Vodička, Pavel (vedoucí práce) ; Černá, Marie (oponent) ; Hlaváč, Viktor (oponent)
Navzdory velkému úsilí je hlavní překážkou léčby rakoviny nízká odpověď na konvenční chemoterapeutika a/nebo rezistence. Chemorezistence způsobuje relaps rakoviny a tvorbu metastáz, což dramaticky ztěžuje prognózu pacientů. Odhaduje se, že přibližně 90 % úmrtí na rakovinu lze přímo či nepřímo přičíst chemorezistenci. Existuje několik vnitřních nebo získaných buněčných mechanismů chemorezistence nádorů, přičemž jedním z klíčových viníků ovlivňujících odpověď nádorových buněk na chemoterapeutika je oprava DNA. To vychází ze základního principu jejich působení, neboť většina chemoterapeutik je navržena tak, aby zvyšovala poškození DNA a inhibovala její opravu nebo odpověď na poškození DNA, což v konečném důsledku vyvolává smrt maligních buněk. Pochopení složitých mechanismů opravy DNA a její regulace je proto nezbytné pro cílenější a účinnější léčbu pacientů s rakovinou. V této disertační práci jsme se pokusili objasnit některé regulační mechanismy opravy DNA a jejich vliv na odpověď na konvenční chemoterapeutika. Potvrdili jsme, že jednonukleotidové polymorfismy ve vazebných místech mikroRNAv DNAreparačních genech mohou ovlivňovat přežití pacientů a jejich odpověď na protinádorovou léčbu. Zkoumali jsme roli miR-140 u kolorektálního karcinomu a zjistili jsme, že miR-140 zlepšuje odpověď na...
|
|
|
Role of Telomeres / DNA Repair in Solid Tumors
Tomášová, Kristýna ; Vodička, Pavel (vedoucí práce) ; Dušinská, Mária (oponent) ; Campa, Daniele (oponent)
Ztráta funkce telomer a neopravená poškození DNA přispívají k narušení integrity chromozomů a rozvoji genomové nestability, která může iniciovat maligní zvrat buněk. Tato disertační práce je zaměřena na studium telomer a mechanismů jejich údržby a regulace u sporadických nádorů tlustého střeva a konečníku, prsu a ovárií. U rakoviny tlustého střeva a konečníku (kolorektální karcinom; KRK) byl prostor věnován i výzkumu DNA glykosyláz zapojených do bázové excizní opravy. Výsledky této disertační práce jsou detailně rozvedeny v sedmi přiložených rukopisech. Stěžejní výsledky každého z článků jsou následující: I) Ke změnám počtu kopií mitochondriální DNA a zkracování telomerové délky (TL) dochází již u prekancerózních lézí KRK, avšak u časných karcinomů souvislost mezi obsahem jejich mitochondriální DNA a TL zaniká; II) TL leukocytů v periferní krvi u pacientů s KRK může být ovlivněna postoperační cytostatickou léčbou na bázi 5-fluorouracilu; III) Metastázy KRK v játrech si udržují stejnou TL jako primární nádory. Dále bylo zjištěno, že neoadjuvatní léčba (chemo)radioterapií nasazovaná pacientům s rakovinou rekta pravděpodobně primárnímu nádoru i okolním buňkám rekta způsobuje mimo poškození DNA i krácení telomer; IV) TL buněk karcinomů ovárií můžou ovlivňovat epigenetické regulace a exprese genů...
|
|
|
Systém pro kontrolu rozměrů transportního nosiče
Vodička, Petr ; Dostál, Zbyněk (oponent) ; Antoš, Martin (vedoucí práce)
V bakalářské práci je zpracována rešerše týkající se průmyslově používaných senzorů pro bezkontaktní měření vzdálenosti, základní fyzikální principy detekce polohy či tvaru a popsány systémy vhodné pro měření ocelových konstrukcí. Je popsána geometrie transportního nosiče a jsou klasifikovány způsoby jeho možné deformace. Je navrhnut měřicí systém pro zjištění míry deformace transportního nosiče s cílem posoudit vhodnost jeho dalšího použití. Pro realizaci systému je vybrán a ozkoušen vhodný senzor a vypracována výrobní dokumentace měřicí brány.
|
|
|
Návrh elektro-hydraulické soustavy pro ovládání příďového podvozku malého dopravního letounu
Vodička, Petr ; Janhuba, Luboš (oponent) ; Třetina, Karel (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá návrhem elektrohydraulické soustavy pro ovládání podvozku malého dopravního letadla. Teoretická část obsahuje stručnou rešerši týkající se malých dopravních letadel, jejich podvozků a požadavků předpisu CS 23 relevantních pro návrh elektrohydraulické soustavy. Praktická část zahrnuje návrh parametrů modelového letounu, kinematiku mechanizmů zatahování a řízení podvozku, odhad sil působících na hydraulickou soustavu, návrh této soustavy a určení konkrétních parametrů některých jejích prvků, dále pak simulaci okruhu řízení příďového kola a závěrečné zhodnocení návrhu.
|
|
|
PHYSICOCHEMICAL CHARACTERISTICS AND EVOLUTION OF AEROSOL FROM OPEN COMBUSTION OF BIOMASS DURING THE TRADITIONAL “BURNING OF THE WITCHES”
Mbengue, Saliou ; Vodička, Petr ; Komínková, Kateřina ; Schwarz, Jaroslav ; Zíková, Naděžda ; Vítková, Gabriela ; Windell, Laurence Christian ; Suchánková, Lenka ; Lhotka, Radek ; Julaha, Kajal ; Prokeš, Roman ; Šmejkalová Holubová, A. ; Ondráček, Jakub ; Ždímal, Vladimír ; Holoubek, Ivan
Open biomass burning (OBB) is a major source releasing large quantities of gaseous and particulate pollutants into the atmosphere, with global, regional and local impacts on air quality, public health and climate (Andreae, 2019, Chen et al., 2017). OBB aerosols mainly consist of carbonaceous matter, and a considerable amount of inorganic salts, which present distinctly different optical properties (Chen et al., 2017, Reid et al., 2005). In this study, we investigate the influence of OBB during the traditional Burning of the Witches (BoW), referred to in Czech as “Pálení čarodějnic”, on the physico-chemical properties of atmospheric aerosols collected at the National Atmospheric Observatory Košetice (NAOK). The BoW is a centuries-old pagan tradition very popular in the Czech Republic. Today, it is celebrated during the night from April 30 to May 1 by lighting bonfires made of woodpiles with fake witches.
|
|
|
VE VODĚ ROZPUSTNÉ SLOUČENINY PM2.5 NA TŘECH VENKOVSKÝCH POZAĎOVÝCH LOKALITÁCH VE STŘEDNÍ EVROPĚ V CHLADNÝCH A TEPLÝCH OBDOBÍCH
Schwarz, Jaroslav ; Vodička, Petr ; Lhotka, Radek ; Pokorná, Petra ; Zíková, Naděžda ; Ondráček, Jakub ; Aurora, S. ; Poulain, L. ; Herrmann, H. ; Ždímal, Vladimír
Iontová chromatografie (IC) byla použita k charakterizaci ve vodě rozpustných sloučenin v PM2,5 během zimní a letní kampaně na třech venkovských lokalitách ve střední Evropě v časovém rozlišení 12 hodin (den/noc). Koncentrace aerosolů ze spalování biomasy se v zimě od Melpitzu po Košetice zdvojnásobily, mořská sůl vykazovala opačné chování. V létě byly v Melpitzu zjištěny vyšší hodnoty síranů a kyseliny metansulfonové. Poměr denních a nočních koncentrací vykazoval vyšší denní koncentrace fosforečnanů a sloučenin spojených se spórami hub a bakterií, zatímco vyšší noční koncentrace byly spojeny se spalováním dřeva. Jako přibližné měřítko pro rozlišení místních a dálkově přenášených aerosolů byl použit ventilační index. Produkty spalování biomasy byly identifikovány jako většina místních aerosolů, zatímco mořská sůl jako dálkově přenášený aerosol.
Plný tet:  PDF
|
|
| |
|
|
SUBMIKRONOVÝ AEROSOL NA DVOU MĚSTSKÝCH STANICÍCH V PRAZE
Pokorná, Petra ; Zíková, Naděžda ; Vodička, Petr ; Lhotka, Radek ; Ondráček, Jakub ; Schwarz, Jaroslav ; Ždímal, Vladimír ; Hopke, P.
Cílem této práce bylo stanovit dynamiku submikronového aerosolu, jeho chemické složení a původ na dvou lokalitách v Praze na základě distribuce velikosti částic (PNSD) a chemického složení 2/12/24h vzorků atmosférického aerosolu (PM1) odebíraných paralelně po dobu půl roku/ve dvou ročních obdobích na dvou městských lokalitách (příměstské - Suchdol a dopravní - Vršovice). Byla provedena chemická analýza PM1 na uhlík (elementární, ekvivalentní černý - eBC a organický) termooptickou metodou a na anorganické ionty rozpustné ve vodě metodou IC. U většiny měsíců byl zjištěn jak početní, tak hmotnostní medián koncentrace založené na údajích SMPS lišily. Vyšší koncentrace eBC byly naměřeny ve Vršovicích, avšak koncentrace eBC vykazovaly dobrou korelaci (r=0,80, yintercept=0) na obou stanicích. Vyšší průměrné hodnoty PM1 na dopravní lokalitě v létě a na příměstské lokalitě v zimě a sezónní rozdíly v iontovém složení PM1 odrážely sezónnost místních zdrojů. Přesto nebyly mezi lokalitami zjištěny statisticky významné rozdíly v koncentraci PM1 a iontovém složení.
Plný tet: PDF
|
|
|
HIGHLY-TIME RESOLVED ELEMENTAL SOURCE APPORTIONMENT OF PM2.5 AT AN URBAN TRAFFIC SITE IN PRAGUE
Windell, Laurence Christian ; Pokorná, Petra ; Ondráček, Jakub ; Schwarz, Jaroslav ; Lhotka, Radek ; Vodička, Petr ; Zíková, Naděžda ; Hopke, P.K. ; Ždímal, Vladimír
This work aims to quantify metal emissions from traffic at an urban traffic site in Prague, Czech Republic, identify key tracers of emissions, and investigate exhaust and non-exhaust emissions observable in fine particulate matter (PM2.5). This project signifies the first high-time resolution elemental analysis of Prague aerosols.
Plný tet: PDF
|
|
|
The source of endogenous DNA damage in neurodegenerative disease
Havelková, Jarmila ; Hanzlíková, Hana (vedoucí práce) ; Vodička, Pavel (oponent)
Jednovláknové zlomy DNA (single-strand breaks, SSBs) patří mezi nejčastější DNA poškození vznikající v buňkách a mohou ohrozit genetickou integritu a přežití buněk, jak ukazuje zvýšená genetická delece, embryonální letalita a neurologické onemocnění vzniklé z důvodu narušení opravné dráhy těchto jednovláknových zlomů (single-strand break repair, SSBR). Jedním z proteinů důležitých pro rychlou opravu jednovláknových zlomů v DNA je XRCC1, molekulární scaffold protein, který v rámci oprav poškozené DNA interaguje s několika enzymy (např. PARP1, PNKP, POLβ, APTX, LIG3), a tak podporuje jejich stabilitu a/nebo funkci. Narušení opravných drah jednovláknových zlomů DNA bylo již v minulosti spojeno s dědičnou neurodegenerací u lidí, cerebelárními ataxiemi a záchvaty. V této práci se zaměřuji na geneticky podmíněné onemocnění autozomálně recesivní spinocerebelární ataxii (spinocerebellar ataxia autosomal recessive-26; SCAR26), u níž bylo prokázáno, že je spojena s mutacemi v. XRCC1 genu Zkoumám množství proteinu XRCC1 v XRCC1-defektivních buňkách, což odhaluje, že buňky pacientů s mutacemi v XRCC1 vykazují velmi nízké hladiny XRCC1 proteinu. Popisuji také, že snížené hladiny proteinu XRCC1 v buňkách korelují s rostoucím počtem endogenních jednovláknových zlomů DNA, měřitelným pomocí kvantifikace ADP-ribózy...
|
host ::
RSS.