|
|
Deep learning-based noise reduction in X-ray images
Říhová, Barbora ; Jakubíček, Roman (oponent) ; Zemek, Marek (vedoucí práce)
X-ray imaging technology is the foundation for exploring the internal structure of a wide range of objects, however the results can be compromised by noise. This thesis is focused on the removal of noise in X-ray projections using deep learning, that has the capability to adapt to a specific task. The thesis contains a theoretical investigation focusing on the areas of X-ray production and detection, noise in X-ray images, and neural networks. A special chapter is devoted to the description of the chosen solution, which is performed by creating a dataset partially consisting of modeled X-ray projections with the subsequent incorporation of noise corresponding to noise model in real images and partly from X-ray projection series. The RIDNet convolutional neural network architecture was selected for implementation, since it shows good result for denoising task. Three models were trained using different parts of the dataset. The best performance was observed for models, that used real data for training. Their performance is comparable to traditional methods such as BM3D.
|
|
|
Kinematická analýza chůze u pacientů s koxartrózou
Říhová, Barbora ; Malá, Jitka (vedoucí práce) ; Stupková, Michaela (oponent)
Název: Kinematická analýza chůze u pacientů s koxartrózou Cíle: Cílem této diplomové práce bylo analyzovat stereotyp chůze u probandů s III. stupněm artrózy kyčelního kloubu, porovnat ho s literárními normami a potvrdit předem stanovené hypotézy. Metoda: Práce byla zpracována jako případová studie a její podstatou bylo sledovat změny rozsahu pohybů pánve a trupu při chůzi v důsledku výrazných degenerativních změn v kyčelním kloubu. Studie se zúčastnilo celkem 9 probandů (6 žen, 3 muži) s III. stupněm artrózy kyčelního kloubu. V rámci studie proběhlo kompletní fyzioterapeutické vyšetření. Ze základních parametrů chůze byla měřena rychlost chůze probanda a doba trvání stojné fáze. V rovině frontální se měřily tyto parametry: posun pánve a trupu na stranu stojné dolní končetiny (cm) a pokles pánve na stranu švihové končetiny (stupeň). Pro 3D analýzu pohybu a hodnocení kinematických parametrů byl použit přístroj Qualisys motion capture system se 6 infračervenými kamerami. Chůze byla měřena v různých rychlostech vždy během 10 sekund trvajícího časového úseku a výsledná data následně odečtena z minimálně 5 krokových cyklů. Pro porovnání naměřených dat byla vybrána nejpřirozenější rychlost chůze dle subjektivity pacienta. Naměřená data byla analyzována v programu Qualisys Track Manager a dále zpracována v...
|
|
|
Transformace lilku bramboru genem kódujícím proteázový inhibitor SPI-2
Říhová, Barbora ; Fischer, Lukáš (vedoucí práce) ; Vítámvás, Pavel (oponent)
Předmětem této diplomové práce byla genetická modifikace lilku bramboru za účelem zvýšení jeho rezistence vůči patogenům a škůdcům. Při vývoji rezistence rostlin se často využívá podobných typů molekul, které rostliny samy využívají při svých obranných reakcích. V této práci byl pro genetickou modifikaci použit gen kódující zástupce inhibitorů serinových proteáz SPI-2, pocházející ze zavíječe voskového (Galleria mellonella). Jelikož se v předchozích pokusech týmu protein SPI-2 nepodařilo v transformovaných rostlinách detekovat, byla základní forma genu upravena přidáním Kozakové sekvence do okolí iniciačního kodónu, čímž se měla zvýšit iniciace translace a tím hladina proteinu. Pro transformaci byly připraveny dva konstrukty, kódující proteiny SPI-2-T a SPI-2-Y, které se liší jednou aminokyselinou, a to mírně pozměňuje jejich inhibiční aktivitu. Konstrukt SPI-2-T byl nejprve pomocí infiltrace s Agrobacterium tumefaciens vnesen do listů tabáku Nicotiana benthamiana. Oba konstrukty SPI-2-T a SPI-2-Y byly poté použity pro stabilní transformaci lilku bramboru (Solanum tuberosum cv. Desireé). Přítomnost proteinu se však v rostlinách nepodařilo prokázat, přestože byl vnesený gen transkribován a jeho sekvence v rostlinách byla ověřena sekvenací. Je tedy pravděpodobné, že protein není v cytoplazmě...
|
|
|
Praktické využití geneticky modifikovaných rostlin
Říhová, Barbora ; Fischer, Lukáš (vedoucí práce) ; Cvrčková, Fatima (oponent)
Genetické inženýrství (GI) rostlin je téma velice aktuální, a stále více kontroverzní, neboť se stává neodmyslitelnou součástí života nás všech. GI má, kromě jiného, velký potenciál pomoci vyřešit aktuální otázku hladu a podvýživy v určitých částech světa. Tato práce má za cíl objasnit, co jsou geneticky modifikované (GM) rostliny, představit možnosti praktického využití GM rostlin, způsoby přípravy a zvážit jejich výhody a případná rizika. GM rostlinou rozumíme rostlinu, které byla cíleně změněna genetická informace vnesením či vyjmutím části genetické informace (úseku DNA, zpravidla genu). Nejvíce používané metody transformace jsou transformace pomocí Agrobacteria tumefaciens a balistickou metodou. GM rostliny se mohou využívat pro produkci potravin a krmiv v lepší kvalitě a větší kvantitě, díky navozené vyšší odolnosti, ať už vůči stresu biotickému (vůči napadení škůdcem, virem, bakterií..), tak vůči abiotickému (sucho, salinita, toxické látky v půdě,..). Zejména odolnost vůči abiotickému stresu je aktuální problém, neboť díky měnícím se klimatickým podmínkám některé regiony stále více trpí nedostatkem srážek a následným suchem. Některé GM rostliny pěstované pro produkci potravin také mají lepší nutriční vlastnosti, což může pomoci vyřešit problém s nedostatkem určitých složek potravy v zemích třetího...
|
|
| |
|
|
Kinematická analýza chůze u pacientů s koxartrózou
Říhová, Barbora ; Malá, Jitka (vedoucí práce) ; Stupková, Michaela (oponent)
Název: Kinematická analýza chůze u pacientů s koxartrózou Cíle: Cílem této diplomové práce bylo analyzovat stereotyp chůze u probandů s III. stupněm artrózy kyčelního kloubu, porovnat ho s literárními normami a potvrdit předem stanovené hypotézy. Metoda: Práce byla zpracována jako případová studie a její podstatou bylo sledovat změny rozsahu pohybů pánve a trupu při chůzi v důsledku výrazných degenerativních změn v kyčelním kloubu. Studie se zúčastnilo celkem 9 probandů (6 žen, 3 muži) s III. stupněm artrózy kyčelního kloubu. V rámci studie proběhlo kompletní fyzioterapeutické vyšetření. Ze základních parametrů chůze byla měřena rychlost chůze probanda a doba trvání stojné fáze. V rovině frontální se měřily tyto parametry: posun pánve a trupu na stranu stojné dolní končetiny (cm) a pokles pánve na stranu švihové končetiny (stupeň). Pro 3D analýzu pohybu a hodnocení kinematických parametrů byl použit přístroj Qualisys motion capture system se 6 infračervenými kamerami. Chůze byla měřena v různých rychlostech vždy během 10 sekund trvajícího časového úseku a výsledná data následně odečtena z minimálně 5 krokových cyklů. Pro porovnání naměřených dat byla vybrána nejpřirozenější rychlost chůze dle subjektivity pacienta. Naměřená data byla analyzována v programu Qualisys Track Manager a dále zpracována v...
|
|
|
Finanční vzdělávání a jeho místo ve školním vzdělávání
Říhová, Barbora ; Tichá, Milena (vedoucí práce) ; Jirásková, Věra (oponent)
Diplomová práce se zabývá finančním vzděláváním a jeho místem ve školním vzdělávání. Je rozdělena do čtyř hlavních částí. V první kapitole je vymezen pojem finanční gramotnosti, vývoj finančního vzdělávání v pedagogické reflexi a faktory ovlivňující jedince v procesu finanční vzdělávání. Druhá kapitola se věnuje místu finančního vzdělávání ve školním vzdělávání, přičemž je provedena analýza vybraných dokumentů vzdělávací politiky České republiky a činnosti aktérů podílejících se na rozvoji finanční gramotnosti obyvatel České republiky. Tématem třetí je kapitoly vymezení místa finančního vzdělávání v rámci mimoškolního vzdělávání v soukromém sektoru. Čtvrtá kapitola pojednává o roli pedagoga v procesu finančního vzdělávání a předkládá jistá doporučení.
|
|
|
Transformace lilku bramboru genem kódujícím proteázový inhibitor SPI-2
Říhová, Barbora ; Fischer, Lukáš (vedoucí práce) ; Vítámvás, Pavel (oponent)
Předmětem této diplomové práce byla genetická modifikace lilku bramboru za účelem zvýšení jeho rezistence vůči patogenům a škůdcům. Při vývoji rezistence rostlin se často využívá podobných typů molekul, které rostliny samy využívají při svých obranných reakcích. V této práci byl pro genetickou modifikaci použit gen kódující zástupce inhibitorů serinových proteáz SPI-2, pocházející ze zavíječe voskového (Galleria mellonella). Jelikož se v předchozích pokusech týmu protein SPI-2 nepodařilo v transformovaných rostlinách detekovat, byla základní forma genu upravena přidáním Kozakové sekvence do okolí iniciačního kodónu, čímž se měla zvýšit iniciace translace a tím hladina proteinu. Pro transformaci byly připraveny dva konstrukty, kódující proteiny SPI-2-T a SPI-2-Y, které se liší jednou aminokyselinou, a to mírně pozměňuje jejich inhibiční aktivitu. Konstrukt SPI-2-T byl nejprve pomocí infiltrace s Agrobacterium tumefaciens vnesen do listů tabáku Nicotiana benthamiana. Oba konstrukty SPI-2-T a SPI-2-Y byly poté použity pro stabilní transformaci lilku bramboru (Solanum tuberosum cv. Desireé). Přítomnost proteinu se však v rostlinách nepodařilo prokázat, přestože byl vnesený gen transkribován a jeho sekvence v rostlinách byla ověřena sekvenací. Je tedy pravděpodobné, že protein není v cytoplazmě...
|
|
|
Praktické využití geneticky modifikovaných rostlin
Říhová, Barbora ; Fischer, Lukáš (vedoucí práce) ; Cvrčková, Fatima (oponent)
Genetické inženýrství (GI) rostlin je téma velice aktuální, a stále více kontroverzní, neboť se stává neodmyslitelnou součástí života nás všech. GI má, kromě jiného, velký potenciál pomoci vyřešit aktuální otázku hladu a podvýživy v určitých částech světa. Tato práce má za cíl objasnit, co jsou geneticky modifikované (GM) rostliny, představit možnosti praktického využití GM rostlin, způsoby přípravy a zvážit jejich výhody a případná rizika. GM rostlinou rozumíme rostlinu, které byla cíleně změněna genetická informace vnesením či vyjmutím části genetické informace (úseku DNA, zpravidla genu). Nejvíce používané metody transformace jsou transformace pomocí Agrobacteria tumefaciens a balistickou metodou. GM rostliny se mohou využívat pro produkci potravin a krmiv v lepší kvalitě a větší kvantitě, díky navozené vyšší odolnosti, ať už vůči stresu biotickému (vůči napadení škůdcem, virem, bakterií..), tak vůči abiotickému (sucho, salinita, toxické látky v půdě,..). Zejména odolnost vůči abiotickému stresu je aktuální problém, neboť díky měnícím se klimatickým podmínkám některé regiony stále více trpí nedostatkem srážek a následným suchem. Některé GM rostliny pěstované pro produkci potravin také mají lepší nutriční vlastnosti, což může pomoci vyřešit problém s nedostatkem určitých složek potravy v zemích třetího...
|
|
| |
host ::
RSS.