Original title: Vliv odběru vzorků a způsob jejich fixace na měření velikosti genomu
Translated title: Influence of sampling and fixation on measuring of genome size
Authors: Halačka, Karel ; Vetešník, Lukáš ; Fedorčák, J. ; Koščo, J.
Document type: Methods
Year: 2019
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Hodnota velikosti genomu je důležitý aspekt v mnoha moderních studiích ryb. Vzhledem k relativně snadnému získání a zpracování je pro tyto účely často používána krev. Ta se však u ryb snadno sráží, a proto se obvykle používá heparin jako antikoagulant. Ukazuje se však, že přidání heparinu má za následek i zvýšení měřených hodnot při měření pomocí průtokového cytometru. Zjištěné rozdíly byly vysoce významné a lze proto doporučit vyloučení heparinu nebo korekci získaných hodnot. Assessment of genome size is an important aspect of many modern studies on fish. Blood is the most common DNA source in fish studies due to its relative ease of sampling and processing. Fish blood, however, precipitates rapidly, leading to clotting. Consequently, anticoagulants (primarily heparin) are added at the time of sampling. Using of increasing heparin concentrations resulted in notable increases in fish erythrocyte genome size readings compared to a non-heparinised control. The differences observed were highly significant, suggesting that the results of previous comparative studies or those determining individual polyploidy may need reinterpretation.
Keywords: fixation; flow cytometry; genome size
Project no.: TG03010048 (CEP)
Funding provider: GA TA ČR

Institution: Institute of Vertebrate Biology AS ČR (web)
Document availability information: Fulltext is available at the institute of the Academy of Sciences.
Original record: http://hdl.handle.net/11104/0307892

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-432745


The record appears in these collections:
Research > Institutes ASCR > Institute of Vertebrate Biology
Analytical and methodological materials > Methods