|
|
Vliv odběru vzorků a způsob jejich fixace na měření velikosti genomu
Halačka, Karel ; Vetešník, Lukáš ; Fedorčák, J. ; Koščo, J.
Hodnota velikosti genomu je důležitý aspekt v mnoha moderních studiích ryb. Vzhledem k relativně snadnému získání a zpracování je pro tyto účely často používána krev. Ta se však u ryb snadno sráží, a proto se obvykle používá heparin jako antikoagulant. Ukazuje se však, že přidání heparinu má za následek i zvýšení měřených hodnot při měření pomocí průtokového cytometru. Zjištěné rozdíly byly vysoce významné a lze proto doporučit vyloučení heparinu nebo korekci získaných hodnot.
|
|
| |
|
|
omparison of PHP frameworks Symfony 2 and Zend Framework 2
Koščo, Ján ; Pavlíčková, Jarmila (vedoucí práce) ; Fesič, Tomáš (oponent)
Diplomová práce se zabývá srovnáním dvou webových aplikačních frameworků jazyka PHP. Cílem práce je poskytnout komplexní pohled na možnosti, rozdíly a výhody zvolených frameworků. Hlavním zdrojem pro srovnáni jsou ukázkové webové aplikace. Pro komplexní srovnáni byly zvoleny různá kritéria, které analyzují jejích vlastnosti. Tato kritéria jsou rozděleny do pěti celků. Podpora technologií, zkoumá kompatibilitu frameworku pro různé verze platformy. Nejdůležitější a nejrozsáhlejší kategorií je vývoj aplikací. Táto kategorie rozebírá nejčastější úlohy při tvorbě webových aplikací a způsoby jak k nim přistupují jednotlivé frameworky. Dalšími kategoriemi jsou návrh a architektura frameworku, testování a obecná podpora pro vývojáře. Poslední ze zmíněných kritérií analyzuje online i offline zdroje informací, které slouží k naučení se základům frameworku, ale také pokročilým technikám jeho využití. Výsledky srovnáni výše uvedených kritérií, by měly pomoci vývojářům při výběru moderního webového frameworku pro vývoj aplikací na platformě PHP.
|
|
|
Case study of web application using open source resources
Koščo, Ján ; Sklenák, Vilém (vedoucí práce) ; Šubrta, Václav (oponent)
Tato bakalářská práce se věnuje open source redakčnímu systému Drupal. Cílem práce je poukázat, že tento systém nabízí platformu pro tvorbu webových stránek a aplikací a tudíž umožní tvorbu široké škály aplikací. Teoretická část práce nabízí čtenáři základní informace týkající se redakčních systémů a poukazuje na výhody a nevýhody při jejich využití. Obsahuje srovnání tří nejznámějších redakčních systémů (Wordpress, Drupal a Joomla) a také poskytuje znalostní základy, které jsou potřebné při tvorbě aplikací pomocí systému Drupal. Prvním krokem praktické části práce bylo vytvoření funkčně identické aplikace pomocí redakčního systému Drupal a webového aplikačního frameworku CakePHP. Poznatky jednotlivých vývojových cyklů byly zpracovány do závěrečné kapitoly, která sestává ze stručného shrnutí jednotlivých cyklů a analýzy časové a znalostní náročnosti.
|
|
|
První nález Romanogobio vladykovi v povodí Nidy, Polsko
Nowak, M. ; Mendel, Jan ; Szczerbik, P. ; Koščo, J. ; Klaczak, A. ; Popek, W.
Hrouzek běloploutvý z Dunaje, Romanogobio vladykovi Fang, 1943 patří do skupiny druhů R. albipinnatus (Lukasch, 1933). Poprvé byl na území Polska zaznamenán ve středním úseku řeky Vistula v roce 1965. Od té doby byl pak nalezen na 20 lokalitách v povodí řek Vistula a Odra. V květnu a červenci 2009 byli odchyceni dva jedinci patřící do skupiny R. albipinnatus v hlavním toku řeky Nidy. Molekulární přístup založený na kombinaci mitochondriálního a jaderného markeru potvrdil výskyt R. vladykovi na polském území. Tento závěr mění informace o distribuci druhů hrouzka běloploutvého. Kottelat a Freyhof (2007) uváděli, že území Polska je obývané R. belingi, kdežto R. vladykovi je vyhrazený jen pro povodí Dunaje.
|
|
|
Nejnovější poznatky o druhové pestrosti hrouzka rodu Gobio a Romanogobio na území ČR a SR
Mendel, Jan ; Lusk, Stanislav ; Lusková, Věra ; Koščo, J. ; Vetešník, Lukáš ; Halačka, Karel
V posledních 15 letech taxonomie a systematika hrouzka doznala rozsáhlých změn. Mezi hrouzky se nachází mnoho taxonů, které jsou endemity v různých oblastech Evropy a Asie a v různých stupních ohrožení. K důležitým poznatkům pro ochranu ichtyofauny ČR a SR patří potvrzení rodové diferenciace původního rodu Gobio na rody Gobio a Romanogobio. Původně chápaná jednotná struktura druhu Gobio gobio se na základě genetických analýz průkazně rozdělila na struktury, kterým lze přisuzovat druhovou úroveň (G. gobio, G. obtusirostris, G. carpathicus a Gobio sp.). U druhů rodu Romanogobio dochází ke změnám jejich odborného označení: původní R. albipinnatus lze rozdělit na druhy R. vladykovi a R. belingi. Původní druh R. kesslerii lze rozčlenit na R. banaticus a patrně i Romanogobio sp. S ohledem na nově zjištěné poznatky je nutné revidovat systém efektivní ochrany zjištěné biodiverzity u uvedených taxonů. Byly vymezeny oblasti sympatrického výskytu a byla prokázána hybridizace v rámci obou rodů.
|
|
|
Molekulárně-biologické analýzy hrouzka Kesslerova ve vodách České republiky a Slovenska
Mendel, Jan ; Lusk, Stanislav ; Lusková, Věra ; Koščo, J. ; Papoušek, Ivo ; Halačka, Karel ; Vetešník, Lukáš
Hrouzek Kesslerův patří ke kriticky ohroženým druhům chraněným národní i evropskou legislativou. Uvádíme první poznatky o genetické diverzitě 5 populací R. kesslerii z českých a slovenských řek. Na základě sekvenčních analýz částí control regionu i prvního intronu S7 r-proteinu bylo analyzováno 30 jedinců. Bylo zjištěno celkem 9 haplotypů. Nejvyšší variabilitou se vyznačovala populace z Bečvy se 3 haplotypy, dva haplotypy vykazovaly populace z řek Morava, Topl’á, Ipel’ a jediný haplotyp se vyskytoval u všech jedinců z řeky Laborec. Vnitropopulační diverzita nepřevyšovala hodnotu 0,7%. Analýzy mtDNA poukázaly na existenci dvou skupin, lišící se o 6,2%. První skupinu tvořili jedinci z řeky Bečvy a Ipel’u a druhou tvořili jedinci z Topl’é, Laborce a Moravy. Mezipopulační diverzita uvnitř první skupiny činila 0,4% a uvnitř druhé skupiny 0,5 - 1,0%. Kombinace metod sekvenování úseků mtDNA a nDNA a alozymové analýzy odhalila výskyt hybridů G. gobio a R. kesslerii v řekách Morava a Ipel’.
|
|
|
Súčasný stav rozšírenia zástupcov čeľade Cobitidae v Slovenskom povodí Tisy
Koščo, J. ; Košuth, P. ; Lusková, Věra ; Lusk, Stanislav ; Košuthová, L. ; Halačka, Karel
Aktuální stav rozšíření druhů čeledi Cobitidae v slovenském povodí Tisy jsme porovnali s historickými údaji. Cobitis elongatoides je běžným druhem ve východní časti povodí Tisy, kde osídluje všechny typy biotopů. V západní části povodí Tisy je však méně častý. V porovnaní s minulostí nenastaly výrazné změny v rozšíření tohoto druhu. Misgurnus fossilis se vyskytuje především v nížinných oblastech povodí Tisy, zejména v jeho východní časti. Ichtyocenózy s výskytem M. fossilis jsou druhově chudší, obvykle se překrývají se společenstvy C. elongatoides, výrazně se však liší od společenstev s výskytem Sabanejewia balcanica. Po redukci vhodných původních biotopů v minulosti se M. fossilis celkem úspěšně adaptoval na umělé biotopy (zemníky, kanály). V západní časti povodí Tisy je výskyt tohoto druhu méně častý. S. balcanica má areál posunutý výše, směrem do podhorské oblasti, vyskytuje se výlučně v tekoucích vodách. V porovnaní s minulostí jsme nezaznamenali výrazné změny v jeho rozšíření.
|
|
| |
|
|
Vybrané biologické charakteristiky invazního druhu Perccottus glenii
Halačka, Karel ; Vetešník, Lukáš ; Koščo, J.
Pokožka se vyznačuje extremně silnou povrchovou vrstvou vykazující tendenci k rohovatění, značící jistě značnou mechanickou odolnost. Adaptací pro pobyt v mělkých vodách s možným negativním vlivem slunečního záření je pravděpodobně velké rozšíření melanoforů. Kromě všeobecně se vyskytujících melanoforů ve škáře se současně vyskytují i v pokožce. Melanofory jsou přítomny na povrchu gonád samců a také pronikají do nitra gonády. Invaze nepůvodních druhů může představovat pro dané území vážný ekologický problém vzhledem k ohrožení nebo i přímo zdecimování původních společenstev. Perccottus glenii je druhem, u něhož jsou předpoklady pro negativní ovlivnění původních společenstev značné. Má velkou odolnost vůči nízkým hodnotám kyslíku ve vodě a změnám teploty (snáší promrznutí toku) a široké potravní spektrum. Vysoká reprodukční výkonnost je podmíněna časnou pohlavní dospělostí, dávkovým výtěrem a péčí o vytřené jikry.
|
host ::
RSS.