Original title: Použití metody analýzy mikrosatelitů pro charakterizaci odrůd cibule
Translated title: The use of microsatellite analysis for the characterisation of onion
Authors: Mitrová, Katarína ; Ovesná, Jaroslava
Document type: Methods
ISBN: 978-80-7427-196-0
Year: 2015
Language: cze
Publisher: Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.
Abstract: [cze] [eng]
Předmětem metodiky je postup charakterizace pravosti odrůd cibule pomocí analýzy mikrosatelitů (SSR- Single Sequence Repeats) laboratořemi v praxi. Tato metoda umožní identifikovat odrůdy cibule a charakterizovat genetické zdroje pomoci DNA markerů a určit jejich genetickou podobnost na základě délkové variability krátkých opakujících se sekvencí (mikrosatelitů) pro charakterizaci odrůd cibule Allium cepa L. Podstatou je amplifikace úseků genomu obsahující daný mikrosatelitní lokus pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) se specifickými primery a následná analýza délky produktů a ztotožnění profilu DNA s deklarovanou odrůdou. Metodika nově přináší soubor SSR markerů, postup jejich hodnocení a interpretace výsledků. The object of the methodology is the process characterizing the autenticity of varieties of onion put through microsatellite analysis (SSR- Single Sequence Repeats) for the characterization of varieties of garlic into the practice. This method allows to identify varieties of onion and characterize genetic resources using DNA markers and determine their genetic similarity based on the length variability of short repeating sequences (microsatellites) in the characterization of varieties of onion, Allium cepa L. The principle of the method is amplification of the genome containing the microsatelite locus by polymerase chain reaction (PCR) using specific primers and subsequent analysis of the lengtht of the products and the identification of the DNA profile to the declared variety.
Keywords: bulbous vegetables; genetic resources; genetic variability; SSR; cibulová zelenina; genetická variabilita; genetické zdroje; SSR
Project no.: QJ1210158 (CEP), RO0415 (CEP)
Funding provider: Ministerstvo zemědělství ČR, Ministerstvo zemědělství ČR
Rights: This work is protected under the Copyright Act No. 121/2000 Coll.

Institution: Crop Research Institute (web)
External URL: http://www.vurv.cz/sites/File/Publications/ISBN978-80-7427-196-0.pdf

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-316559


The record appears in these collections:
Research > Scientific research institutions > Crop Research Institute
Analytical and methodological materials > Methods