Original title: Molekulární fylogeneze a evoluční trendy v rodě Hieracium (Asteraceae, Lactuceae)
Translated title: Molecular phylogeny and evolutionary trends in Hieracium (Asteraceae, Lactuceae)
Authors: Krak, Karol ; Fehrer, Judith (advisor) ; Zozomová, Judita (referee) ; Nieto Feliner, Gonzalo (referee)
Document type: Doctoral theses
Year: 2012
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
The hawkweed subgenus Hieracium s. str. is notoriously known for its extreme morphological variability and variation in ploidy levels that is associated with differences in modes of reproduction. Extensive past hybridization is supposed for the subgenus, but recent hybridization was evidenced only in few cases. The subgenus attracts the attention of botanists already for more than a century. Therefore the species diversity is largely examined and the taxonomy of the subgenus is well elaborated, although several contradictory taxonomic concepts exist. However the relationships among the species are unknown and haven't been studied yet. The investigation of these relationships from a phylogenetic perspective using molecular approaches was the main aim of the presented thesis. Basic species (both diploid and polyploid), representing morphologically unique taxa, that are supposed to be the basic evolutionary units of the subgenus were studied. The sequences of two intergenic spacers of the cpDNA (trnT-trnL and trnV-ndhC) and the external transcribed spacer of the nuclear ribosomal DNA (nrDNA ETS) were analyzed. Moreover, three new low-copy nuclear markers with higher variability than nrDNA and cpDNA markers were developed and their suitability for phylogenetic studies in Hieracium s. str. was... Pravé jestřábníky (Hieracium podrod Hieracium s. str.) se vyznačuje extrémní morfologickou variabilitou a různorodostí ploidních úrovní, která je spojená s různýma způsoby reprodukce. Předpokládá se, že v minulosti probíhala v rámci podrodu rozsáhlá hybridizace. V současné době je však hybridizace velice vzácná. Taxonomie podrodu je dost dobře propracována a diverzita na úrovni druhů je podrobně popsaná. Na druhé straně evoluční vztahy mezi jednotlivými druhy zatím nebyli studovány. Tato studie představuje první a zatím jedinou práci zaměřenou na objasnění těchto vztahů pomocí molekulárně biologických metod. Do analýz byly zahrnuty výlučně základní druhy (diploidní i polyploidní), které jsou morfologicky dobře odlišitelné a jsou chápány jako základní evoluční linie v rámci podrodu. Byli analyzovány sekvence dvou úseků chloroplastové DNA (trnT-trnL and trnV-ndhC) a mezerníkového úseku ETS, jádrové ribosomální DNA (nrDNA). V rámci studie byli vyvinuty tři nové low-copy jaderné markery, vhodné pro fylogenetické analýzy u Hieracium s. str., a každý z nich vykazoval vyšší variabilitu než nrDNA ETS. Jeden z nich, konkrétně část genu kódujícího enzym Squalen syntetázu (sqs), byl využit v rámci studie jako další jaderný úsek. Na základě analýzy sekvencí nrDNA ETS byly v podrodu Hieracium s. str....
Keywords: evolution; Hieracium; hybridization; molecular phylogenetics; evoluce; Hieracium; hybridizace; molekulární fylogeneze

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/45161

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-309451


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses