Název: Using actinomycete-specific PCR primers to characterize the bacterial communities of wormcasts
Překlad názvu: Použití specifických aktinomycetových PCR primerů k charakterizaci bakteriálních společenstev exkrementů žížal
Autoři: Hill, P. ; Krištůfek, Václav ; Feijoo, A. M. ; Gallego, G.
Typ dokumentu: Příspěvky z konference
Konference/Akce: Contributions to soil Zoology in Central Europe I. Central European Workshop on Soil Zoology /7./, České Budějovice (CZ), 2003-04-14 / 2003-04-16
Rok: 2005
Jazyk: eng
Abstrakt: [eng] [cze]
Tropical geophageous earthworms stimulate soil bacterial activity in soil that they ingest; it is uncertain if they affect the whole bacterial population or only subgroups. We sampled .i.Martiodrillus heterostichon, Polypheretima elongata./i. and bulk soil from a Bamboo plantation near Cali, Colombia. Pots of 1500 g of an adjacent tobacco field soil were brought to field capacity and two worms of each species placed in each pot. .i.Martiodrillus./i. gut contents and wormcasts from the soil surface and within tunnels were sampled after three months. The soil was maintained at field capacity for a further five months during which the worms continued to produce casts. Worm cast Amplified ribosomal DNA restriction analysis ARDRA (using Tag I) with actinomycete specific primers gave two strong bands at approximately 750 and 370 bp. ARDRA patterns from the three bamboo grove and four field soils had several additional bands notably at 140 and 126 bp. Studie se zabývala tropickými žížalami - .i.Martiodrillus heterostichon, Polypheretima elongata./i.. Tyto druhy žížal stimulují aktivitu bakterií v půdě, kterou požírají; není dosud známé, zda ovlivňují celou bakteriální populaci nebo pouze sub-skupiny. Technikami ARDRA, BLAST A DNAMAN byla zjištěna selekce skupiny aktinomycetů - .i.Nocardioides./i. - v průběhu trávení půdy sledovanými druhy geofágních žížal.
Klíčová slova: actinomycetes; Colombia; earthworms
Číslo projektu: CEZ:AV0Z6066911 (CEP), SL18 (CEP)
Poskytovatel projektu: CIAT
Zdrojový dokument: Contributions to Soil Zoology in Central Europe I. Proceedings of the 7th Central European Workshop on Soil Zoology, ISBN 80-86525-04-X

Instituce: Ústav půdní biologie AV ČR (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dokument je dostupný v příslušném ústavu Akademie věd ČR.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11104/0018088

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-20846


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Věda a výzkum > AV ČR > Ústav půdní biologie
Konferenční materiály > Příspěvky z konference