Název: GenEx Software library for object detection in genetical analysis evaluation: User manual
Autoři: Schier, Jan ; Kovář, Bohumil ; Kuneš, Michal
Typ dokumentu: Výzkumné zprávy
Rok: 2014
Jazyk: eng
Edice: Technical Report
Abstrakt: This technical report contains user manual for the GenEx library for evaluation of FISH microscopy images. The purpose of the library is to find and filter objects in images from fluorescence microscope and to detect fluorescence signals contained in these objects. The library has been designed to be used for diagnostics of the Turner syndrome chromosome aneuploidies in chromosome X, in other words, to find the (roughly round) interphase nuclei and to count the associated hybridization signals. It is characterized by the following features: - separate processing channels for DAPI and for the fluorescence signals. - no restrictions on the number of the signal channels - output in the form of a CSV-file.
Klíčová slova: Fluorescence microscopy; image processing; ImageJ; Particle analysis; Segmentation
Číslo projektu: TA01010931 (CEP)
Poskytovatel projektu: GA TA ČR

Instituce: Ústav teorie informace a automatizace AV ČR (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dokument je dostupný na externích webových stránkách.
Externí umístění souboru: http://library.utia.cas.cz/separaty/2014/ZOI/schier-0439671.pdf
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11104/0243118

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-180538


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Věda a výzkum > AV ČR > Ústav teorie informace a automatizace
Zprávy > Výzkumné zprávy