|
| |
|
|
Genetic conflicts and speciation
Kropáčková, Lucie ; Munclinger, Pavel (referee) ; Reifová, Radka (advisor)
In this thesis I'll examine the role of genetic conflicts in the origin of new species. Genetic conflicts can lead to an origin of reproductive barrier between the emerging species, especially postzygotic reproductive isolation. An example of such conflict could be meiotic drive on sex chromosomes, which distort sex ratio and seems to act a role in a hybrid male sterility. Another example may be genomic imprinting causing an abnormal placenta and embryo development in interspecies hybrids. Coevolution between cytoplasmic and nuclear genes can cause sterility of pollen in hybrids from plants. Similarly, the intracellular bacterium Wolbachia induces cytoplasmic incompatibility in animals. Mobilization of transposons may also lead to hybrid dysgenesis.
|
|
| |
|
| |
|
|
Gentic structure of isolated populations of the Scarlet rosefinch (Caprodacus erythrinus)
Šašková, Lucie ; Munclinger, Pavel (advisor) ; Bryja, Josef (referee)
Diplomová práce se zabývá původem a demografickými charakteristikami geograficky izolovaných, nedávno vzniklých populací hýla rudého (Carpodacus erythrinus) na západním okraji areálu druhu. Práce je zalo.ena na nově získaných sekvencích dvou úseků mitochondriální DNA (410 páru bazí dlouhá sekvence kontrolní oblasti a 1029 dlouhá sekvence genu ND2) zji.těných u 82 jedinců ze 13 lokalit a jejich srovnáním s publikovanými sekvencemi z kontinuálního areálu. Zjistila jsem, .e geograficky izolované populace ze střední a severní Evropy nejsou významně geneticky izolované od populací kontinuálního areálu. Nově vzniklé populace také vykazují překvapivě vysokou diverzitu srovnatelnou s asijskými populacemi. Tato zji.tění nasvědčují intenzivnímu toku genů mezi populacemi zprostředkovanému pravděpodobně převá.ně disperzí mladých ptáků před prvním zahnízděním. Navzdory intenzivnímu toku genů mezi kontinuálním areálem a středo- a severoevropskými izolovanými populacemi hýli z Kavkazu, Bulharska a Turecka utvořili jasně oddělenou skupinu, která byla podpořena na základě několika typů analýz. Zdá se tedy, .e jedinci z těchto oblastí mohou mít vlastní oddělené zimovi.tě, komunikují jen minimálně se zbytkem areálu a díky tomu jsme zde zřejmě svědky počínající speciace. Klíčová slova: Hýl rudý (Carpodacus...
|
|
| |
|
| |
|
|
B2 insertions in mouse population genetics
Kubešová, Lenka ; Macholán, Miloš (referee) ; Munclinger, Pavel (advisor)
1. Prolog Nejvíce zkoumaným savcem (s výjimkou člověka) je drobný živočich, všemi velice dobře známý a provázející člověka odnepaměti. Je to domácí myš. Narozdíl od obrovského množství poznatků o inbredních kmenech myší kupodivu doposud stále víme poměrně málo o jejich blízkých příbuzných - volně žijících domácích myších. Zvláště chybí data o genetické struktuře populací na vyšší škále (na úrovni celých kontinentů). Na této škále se v současné době pro studium populační genetiky využívá převážně mitochondriální DNA (mtDNA) díky svým unikátním vlastnostem (jednoduše izolovatelná, nerekombinující, až na vzácné vyjímky uniparetálně děděná a u obratlovců rychle se vyvíjející). Pro zjevné limitace mtDNA jako markeru (jedná se jen o maličký kus genomu navíc vypovídající jen o mateřském původu) a nejednoznačným výsledkům vyvstává potřeba nalézt pro studium populační genetiky myší vhodné markery z jiných částí genomu. Nejvhodnější možností se jeví být markery založené na SINE elementech. SINE (short interspersed elements) jsou úseky DNA, které se nacházejí v genomech obratlovců (běžně se vyskytující u savců, zejména primátů, hlodavců a kopytníků) ve vysokém počtu navzájem si podobných kopií rozmístěných na různých místech genomu. SINE elementy mají jako markery pro populační genetiku několik výhod. Jejich hlavními...
|
|
|
Heterozygosity, genetic complementarity, and fitness in the Scarlet rosefinch (Carpodacus erythrinus)
Baudysová, Olga ; Munclinger, Pavel (advisor) ; Svobodová, Jana (referee)
4 Abstrakt V první části mé diplomové práce se zabývám vztahem heterozygotnosti a fitness hýlů rudých (Carpodacus erythrinus). Na zkoumání tohoto vztahu u mno- ha druhů se v minulých letech a hlavně nyní zaměřuje bezpočet prací. Toto téma však stále zůstává předmětem diskuzí. Testovala jsem hypotézu, zda heterozygotní jedinci v mikrosatelitových lokusech mají větší fitness než jedinci homozygotní. K dispozici jsem měla 118 je- dinců (z toho 65 samců a 53 samic) a 6 mikrosatelitových lokusů (EABL1 (CM001E); HOFI14 (CM014); HOFI5, HOFI7; LOX6; CE150). Heterozygotnost ur- čenou mírami Ho, IR, SH, standardizovaným mean d2 a HL jsem korelovala s fitness znaky a to s váhou, délkou tarsu, barvou (odstín, sytost, jas) a repro- dukčním úspěchem. Zjistila jsem, že míry heterozygotnosti spolu navzájem korelují (Ho, IR, SH, standardizované mean d2 , HL). S heterozygotností ale ani jeden fitness znak nekoreluje. Zkoušela jsem také korelovat heterozygotnost s váhou a délkou tarsu zvlášť u samic a samců, ale obojí vyšlo stejně - heterozygotnost a fitness spolu nekorelují. Dále jsem testovala hypotézy, zda fitness znaky nejsou ovlivněny jedním nebo několika mikrosatelitovými lokusy. Výsledky ukazují, že ani jeden lokus ze šesti mikrosatelitových lokusů není zodpovědný za fitness jedince (popřípadě není ve vazbě s fitness...
|
|
|
Positional cloning of the Hybrid sterility 1 gene: fine genetic mapping and evaluation of two candidate genes
Mihola, Ondřej ; Trachtulec, Zdeněk (advisor) ; Munclinger, Pavel (referee) ; Pravenec, Michal (referee)
Summaryofpublications 1. Positionalcloningof the Hybridsterility1 gene:finegenetic mappingand evaluationof twocandidategenes Hybridsteri|iýis one of the mechanismsof speciation.The Hybridsteriliý1 (HsÍí)genewasthefirstmappedmammaliangene.The geneaffectsfertiliýof male hybridsbetweencertainlaboratorystrains(suchas C57Bl/10)and Mus musculus musculusmiceby causinga breakdownof spermatogenesisat thestageof primary spermatocytes.|ntheprocessof positiona|c|oningoftheHsÍígene,Wegenerateda contigof bacterialartificialchromosomes(BACs)and subsequentlya lowcoverage sequenceof the candidateregionof the '12951/SvlmJstrain.New geneticmarkers narroweddown the HsÍíregionfrom 580 to 360 ki|obases.The productsof two genesfromthisregion,TATA-bindingprotein(Ibp)and proteasomesubunitbeta1 (Psmb1\,accumulateduringspermatogenesis.The proteinshave been described previouslyas having conservedC{erminal sequencesand species-specificN- termini.We eva|uatedthe candidacyof thesegenesfor Hsťíby a||e|icsequencing and by real-timereverse-transcriptionPCR of testicularmRNAs.The resultssuggest thatneitherthePsmÓí northe lbp genecausehybridsteri|ity.Thesing|enuc|eotide po|ymorphisms(SNPs)we havefound,was usedfor the hap|oýpeana|ysisof the HsÍíregion.
|
guest ::
