|
|
Charakterizace nízkomolekulárních syntetických markerů izoelektrických bodů kapilární zónovou elektroforézou a kapilární izoelektrickou fokusací
Brandejsová, Martina ; Kašička, Václav (vedoucí práce) ; Kubíčková, Anna (oponent)
Vysokoúčinné elektromigrační separační metody, kapilární zónová elektroforéza (CZE) a kapilární izoelektrická fokusace (CIEF), byly použity pro fyzikálně-chemickou charakterizaci nově syntetizovaných nízkomolekulárních markerů izoelektrických bodů. Amfoterní sloučeniny na bázi aminomethylnitrofenolů, jejich derivátů a jiných strukturně příbuzných látek byly analyzovány metodou CZE v sérii základních elektrolytů v širokém rozmezí pH 1,86 - 11,18. Ze změřené závislosti efektivních elektroforetických pohyblivostí analytů na pH (předem korigovaných na referenční teplotu 25řC) byly odečteny jejich izoelektrické body (pI) a nelineární regresní analýzou byly u vybraných látek určeny acidobazické disociační konstanty jejich ionogenních skupin (pKa). Analyty s ostře definovanými izoelektrickými body byly následně analyzovány metodou CIEF, kterou byla prokázána použitelnost těchto analytů jako markerů izoelektrických bodů pro kalibraci pH gradientu v CIEF při určování pI amfoterních látek, zejména peptidů a bílkovin. Stanovené hodnoty pKa ionogenních skupin vybraných sloučenin budou využity při vývoji nových markerů izoelektrických bodů s požadovanými hodnotami pI.
|
|
|
Evaluation of the 33 synthesized nitrophenol-based markers of isoelectic point
Duša, Filip ; Moravcová, Dana ; Šlais, Karel
33 nitrophenol-based compounds, which absorb at ultraviolet as well as visible wavelengths, were selected as candidates for marking isoelectric points (pI) over the pH range from 3 to 10. The evaluation and selection of the candidate structures included structure-based calculations of acid-base properties. The selected compounds were further tested experimentally using capillary isoelectric focusing. The experimental analysis excluded two compounds due to producing double peaks during the analysis. Overall, 31 novel compounds were identified as suitable pI markers.
|
|
|
Charakterizace nízkomolekulárních syntetických markerů izoelektrických bodů kapilární zónovou elektroforézou a kapilární izoelektrickou fokusací
Brandejsová, Martina ; Kašička, Václav (vedoucí práce) ; Kubíčková, Anna (oponent)
Vysokoúčinné elektromigrační separační metody, kapilární zónová elektroforéza (CZE) a kapilární izoelektrická fokusace (CIEF), byly použity pro fyzikálně-chemickou charakterizaci nově syntetizovaných nízkomolekulárních markerů izoelektrických bodů. Amfoterní sloučeniny na bázi aminomethylnitrofenolů, jejich derivátů a jiných strukturně příbuzných látek byly analyzovány metodou CZE v sérii základních elektrolytů v širokém rozmezí pH 1,86 - 11,18. Ze změřené závislosti efektivních elektroforetických pohyblivostí analytů na pH (předem korigovaných na referenční teplotu 25řC) byly odečteny jejich izoelektrické body (pI) a nelineární regresní analýzou byly u vybraných látek určeny acidobazické disociační konstanty jejich ionogenních skupin (pKa). Analyty s ostře definovanými izoelektrickými body byly následně analyzovány metodou CIEF, kterou byla prokázána použitelnost těchto analytů jako markerů izoelektrických bodů pro kalibraci pH gradientu v CIEF při určování pI amfoterních látek, zejména peptidů a bílkovin. Stanovené hodnoty pKa ionogenních skupin vybraných sloučenin budou využity při vývoji nových markerů izoelektrických bodů s požadovanými hodnotami pI.
|
|
| |
|
|
Filtration microcartridge and capillary isoelectric focusing for the analysis low number of microorganisms in real samples
Kubesová, Anna ; Horká, Marie ; Šalplachta, Jiří ; Horký, J.
At present, detection and identification of microorganisms in real biological samples needs very sensitive methods for correct diagnosis and therapy in medical practice, biotechnology, agriculture, food safety and quality etc. Accordingly, it is essential to develop new cheap techniques for pathogen identification, particularly for pathogen in complex biological samples. Pre-concentration, separation, and sensitive detection of whole cells in one step are great potential and advantage for detection of pathogens in low concentration. Combination of filtration microcartridge and capillary isoelectric focusing was developed for pre-concentration and pre-separation of microorganisms from real suspensions and the possibility its application to real samples was verified.
|
|
|
Standards for capillary isoelectric focusing with laser induced fluorescence detection
Šlais, Karel ; Nováčková, J. ; Friedl, Z.
Proteins, peptides or BGE ampholytes labeled with suitable dyes were previously suggested as pI markers. However, both proteins and background ampholytes have many possible reactive sites for reactive dyes and this might result in formation of heterogeneously labeled product with respect to pI. By contrast, the low molecular pI markers can be prepared with heterogeneity and greater stability than proteins and could potentially be good pI markers as found in case of UV detection. To improve the laser induced fluorescence detection, new low molecular fluorescent compounds excitable around 490 nm with suitable acidobasic and electrophoretic properties were prepared and focused in capillary IEF with photometric or fluorometric detection. The experimental setup of IEF and properties of new laser induced fluorescent pI markers are given.
|
host ::
RSS.