|
|
Zpracování obrazových ultrazvukových dat
Pokorný, Vojtěch ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Ultrazvuk je důležitá zobrazovací modalita využívaná v lékařství. Tato bakalářská práce obsahuje zpracování teorie týkající se fyzikálních vlastností ultrazvukového vlnění, stručný přehled historického vývoje ultrazvuku jako zobrazovací modality v medicíně, dále popisuje biofyziku šíření a biologické účinky ultrazvukových vln na tkáně a typy zobrazení výsledných snímků. Další část práce se zabývá popisem diagnostického ultrazvukového přístroje včetně nejčastěji používaných typů ultrazvukových sond. Na tuto část navazuje popis animální ultrazvukového systému Vevo 2100, z něhož získaná data jsou dále zpracovávána. Zpracování zahrnuje jejich načtení, zobrazení a pro DICOM soubory i uložení. U různých formátů souborů standardu DICOM je provedeno jejich vzájemné srovnání. Poslední kapitola se zabývá filtrací pro ultrazvukové obrazy charakteristického šumu typu spekle.
|
|
|
Segmentace MRI dat s využitím metody narůstání oblastí
Pham, Minh Tuan ; Walek, Petr (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá segmentaci dat a jejich zpracování. Data jsou získány vyšetřením pacienta na magnetické rezonanci formou tzv. milimetrových řezů. Prohlížeč byl naprogramován v programovém vybavení Matlab pomocí jeho vývojového prostředí GUIDE. Poskytuje načtení a náhled medicínských obrazových 3D dat ve všech pohledech a umožňuje jejich segmentaci a grafickou úpravu.
|
|
|
Automatická detekce osy páteře v 3D CT datech
Hříbková, Veronika ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Práce se zabývá tématem automatické detekce osy páteře v 3D CT datech. Teoretická část pojednává o základních principech zpracování obrazů a zaměřuje se na problematiku sběru a zpracování medicínských obrazových dat, obzvláště dat z rentgenové výpočetní tomografie. Celá kapitola je věnována principu tvorby CT 2D a 3D obrazů. Dále je zpracována rešerše anatomie osového skeletu se zaměřením na anatomii páteře. Druhá část práce je věnována návrhu a realizaci metody segmentace páteře s využitím prostého prahování a morfologických operací k nalezení iniciální pozice osy páteře s definicí počátku a konce osy pomocí vzájemné korelace s vytvořenými binárními maskami. Následné zpřesnění pozice páteře je provedeno segmentací páteřního kanálu pomocí metody narůstání oblastí, kde výchozí body, ležící uvnitř páteřního kanálu, jsou určeny nalezením těžiště obratle nebo Houghovou transformací.
|
|
|
Analýza protokolu DICOM a jeho využití pro zpracování obrazových dat
Valouch, Lukáš ; Přinosil, Jiří (oponent) ; Šmirg, Ondřej (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce popisuje DICOM, jakožto souhrn standardů pro zpracování, ukládání a přenos medicínských obrazových dat. Standard je vyvíjen organizacemi ACR a NEMA, je značně rozsáhlý, jeho aktuální verze z roku 2008 se skládá z 18 dokumentů. Pro zpracování obrazových dat je důležitá část samotného formátu dat a souborů, tzv. off-line komunikace. Následuje popis aplikace implementované v jazycích C, C++ pomocí knihovny Imebra, která je k dispozici zdarma pod licencí GNU GPL. Výsledný program vychází tedy ze standardu DICOM, který je rozebrán výše. Zabývá se problémy zobrazování obrazů 16 bitové hloubky na běžných zobrazovacích jednotkách o 8 bitech, jako jsou např. monitory počítačů. Aplikací je možno zobrazovat DICOM obrazy pouze po „vrstvách“, jednotlivých separovaných bitech podle úrovně důležitosti.
|
|
|
Databázový archív obrazových medicínských dat
Sára, Vítězslav ; Chmelař, Petr (oponent) ; Kršek, Přemysl (vedoucí práce)
Práce se zabývá problematikou správy medicínských obrazových dat. Analyzuje problém extrakce metadat z medicínského formátu DICOM a jejich efektivního ukládání. Systém je navržen jako aplikace klient-server. Poskytuje rozhraní pro import dat ve formátu DICOM, rozhraní pro vyhledávání dat v databázi, úpravu dat a export. Systém úzce spolupracuje s kolaborativním systémem VCE. Implementace byla provedena v jazycích C++ a PHP s podporou databáze SQLite a MySQL.
|
|
|
Automatická detekce mikrokalcifikací v mamografických snímcích
Hývlová, Denisa ; Jakubíček, Roman (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá detekcí mikrokalcifikací v mamografických snímcích. V úvodu je rozebrána souvislost jejich přítomnosti se vznikem rakoviny prsu, princip mamografie a standard DICOM využívaný v radiologii. Následně jsou přiblíženy metody používané pro zvýraznění a segmentaci mikrokalcifikací. V prostředí MATLAB byl navržen algoritmus detekce založený na vlnkové transformaci, morfologickém uzavření a prahování. Pro zhodnocení výsledků detekce bylo vytvořeno grafické uživatelské rozhraní a algoritmus umožňující automatické vyhodnocení úspěšnosti detekce na databázi snímků s anotacemi.
|
|
|
Waveletová analýza a zvýrazňování MR tomografických a ultrazvukových obrazů
Matoušek, Luděk ; Bartušek, Karel (oponent) ; Smékal, Zdeněk (vedoucí práce)
Tomografické MR (Magnetic Resonance) a ultrazvukové zpracování biosignálů jsou důležité neinvazivní diagnostické metody v lékařství. Vstupní zesilovač tomografu a obvody ultrazvuku vnáší do zpracování šum, který dosti znehodnocuje diagnostiku daného orgánu. Obrazová data jsou ukládána ve standardizovaném lékařském formátu DICOM. V této práci byly navrženy metody využívající waveletové analýzy k potlačení šumu v obrazech a bylo provedeno jejich srovnání s klasickými metodami. K zpracování dat i jejich zápisu zpět do DICOM formátu bylo využito programu MATLAB.
|
|
|
Akcelerace zpracování 3D obrazových dat na GPU
Kozovský, Radoslav ; Klepárník, Petr (oponent) ; Španěl, Michal (vedoucí práce)
p { margin-bottom: 0.21cm; direction: ltr; color: rgb(0, 0, 0); line-height: 150%; }p.western { font-family: "Times New Roman",serif; font-size: 11pt; }p.cjk { font-family: "Times New Roman",serif; font-size: 11pt; }p.ctl { font-family: "Times New Roman",serif; font-size: 12pt; } Cílem této práce je akcelerace výpočtu zvolených 2D a 3D obrazových filtrů pomocí GPU s využitím OpenCL. Konkrétně se zabývá implementací a porovnáním různých variant Sobelova hranového detektoru a Gaussova filtru s využitím globální nebo lokální paměti. Podařilo se dosáhnout zrychlení na 3D variantách filtrů. Na 2D variantách filtrů byla režie pro přenos dat do a z GPU příliš vysoká.
|
|
|
Moderní metody zvýrazňování statických MR obrazů
Zbranek, Lukáš ; Přinosil, Jiří (oponent) ; Smékal, Zdeněk (vedoucí práce)
Cílem diplomové práce je navrhnout a implementovat vhodnou metodu pro zvýraznění MR tomografických obrazů a na základě identifikace hran stanovit hrubé dělení sledovaných oblastí. K tomu účelu je možné použít například waveletovou analýzu. Pro simulaci použiji prostředí MATLAB v němž uvedu srovnání pro různé typy potlačení šumu a taky pro různé mateřské vlnky. Tyto metody budou implementovány na různé MR obrazy čelistního kloubu.
|
|
| |
host ::
RSS.