Hlavní stránka > Výsledky hledání: keywords:"Allostery"
Hledej:
Tipy pro vyhledávaní :: Rozšířené hledání
Hledej ve sbírkách:
Seřadit podle: Zobrazit výsledky: Výstupní formát:
Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 2 záznamů.  Hledání trvalo 0.00 vteřin. 
Investigation of HSP70 oligomerization by structural mass spectrometry
 Melikov, Aleksandr ; Novák, Petr (vedoucí práce) ; Jeřábek, Petr (oponent)
Příbuzný protein teplotního šoku (HSC70) je 71 kDa chaperon patřící ke všudypřítomné rodině proteinů teplotního šoku 70 (Hsp70). Zástupci této proteinové rodiny jsou považováni za molekulární stroje s ATPázovou aktivitou, které usnadňují správné sbalování prostorové struktury proteinů jak za normálních, tak i za stresových podmínek (hypoxie, tepelný šok, či kolísání pH). HSC70 navíc funguje jako enzym rozbalující vrstvu triskelionu na povrchu klatrinových váčků. Další rolí HSC70 je např. zamezení agregace proteinů, asistence při maturaci polypeptidového řetězce a usnadnění transportu proteinů do organel, jako jsou endoplazmatické retikulum a mitochondrie. HSC70 se účastní směrování proteinů určených k degradaci do lysosomů a v mnoha dalších kriticky důležitých buněčných procesech spojených s homeostází proteinů. Tudíž, regulace HSC70 a jiných proteinů HSP70 je považována za velmi důležitou, obzvlášť v kontextu buněčného stresu. Na základě experimentálních pozorování byl navržen mechanismus inaktivace za pomoci oligomerizace. Dimery a trimery proteinů Hsp70 byly identifikovány jak u prokaryotických, tak u eukaryotických homologů. Byla také diskutována role proteinového kofaktoru Hsp40 ve stimulaci oligomerizaci Hsp70 do vyšších oligomerů. Tento a jiné možné modely oligomerizace "divoké" varianty...
Úplný záznam
Action at a Distance in Arginine Repressor and the Store-operated Calcium Channel Orai: Molecular Modeling and Simulations
 PANDEY, Saurabh Kumar
In this thesis molecular modeling tools have been applied to investigate the phenomenon of allostery in two systems: Arginine repressor and human Orai channel. Arginine repressor protein binds to DNA in response to the intracellular concentration of L-arginine and controls the arginine metabolism in bacteria. Using molecular dynamics simulations sampling of the conformational space of arginine repressor and the allosteric effects of L- arginine binding on structure and dynamics of systems were studied. Orai channels are responsible for entry of calcium ion in the cell in response to Ca 2+ depletion in the endoplasmic reticulum. Homology modeling was applied to prepare a structural model of human Orai3. Molecular dynamics simulations of the earlier published Orai1 model and the Orai3 model described here were performed. Results pointed to differences in the structures and dynamics of the two Orai isoforms, Orai1 and Orai3 and consequent effects on the channel which are probably responsible for the different behavior of Orai isoforms. A putative cholesterol binding site was identified using in silico docking approach and possible effects of cholesterol binding on the Orai1 channel structure and function were reported. Allosteric effects of mutations on a distant cholesterol- binding pocket was investigated.
Úplný záznam

Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.
Digitální repozitář :: Hledej :: Nový záznam :: Personalizace :: Nápověda
Powered by Invenio v1.1.2
Spravuje admin.invenio@techlib.cz
Tato stránka je dostupná také v následujících jazycích:
Česky  English