|
| |
|
| |
|
|
Antioxidační účinky analogů složek nukleových kyselin.
Procházková, Eliška ; Mertlíková Kaiserová, Helena (vedoucí práce) ; Zusková, Iva (oponent)
Reaktivní formy kyslíku (ROS) se v určité míře přirozeně vyskytují v organismu a mají zde např. signalizační a antimikrobiální funkce. Vznikne-li nerovnováha mezi tvorbou a zánikem ROS, hovoříme o oxidačním stresu. Ten je převážně chápán jako nepříznivý stav způsobující oxidační poškození biomolekul (lipidy, proteiny, nukleové kyseliny). Oxidační stres provází řadu tzv. civilizačních chorob a může být navozen také v důsledku farmakoterapie (nežádoucí účinky některých léčiv). Možnosti ovlivnění oxidačního stresu pomocí antioxidantů jsou stále předmětem intenzivního výzkumu. Analogy složek nukleových kyselin představují strukturně bohatou skupinu látek s významným farmakologickým potenciálem. Zatímco jejich protivirové či cytostatické účinky jsou popsány velmi detailně, informace o jejich potenciálně antioxidačních vlastnostech se v literatuře objevují pouze sporadicky. Předmětem této práce bylo zkoumání antioxidační aktivity ve skupině 126 analogů nukleotidů, nukleosidů a nukleobazí s cílem popsat strukturní motivy, které jsou za ni zodpovědné. Bylo použito několika metodických přístupů: 1) stanovení schopnosti látek zhášet ABTS radikál in vitro (metoda TEAC), 2) vliv látek na proces lipidové peroxidace a 3) schopnost látek ovlivňovat hladinu ROS na buněčné úrovni pomocí fluorescenční sondy...
|
|
|
Studium mechanismu rozpoznávání DNA transkripčním faktorem FOXO4
Zusková, Iva ; Obšil, Tomáš (vedoucí práce) ; Bouřa, Evžen (oponent)
Forkhead transkripční faktor FOXO4 se podílí na kontrole řady buněčných dějů, jako jsou např. metabolismus, buněčný cyklus, apoptóza, oprava poškozené DNA či ochrana vůči oxidativnímu stresu. Krystalová struktura DNA-vazebné domény tohoto proteinu s navázanou DNA ukázala, že FOXO4 interaguje s DNA podobně jako jiné forkhead proteiny. DNA- vazebný povrch je tvořen zejména helixem H3, který se váže do velkého žlábku molekuly DNA, a dále N-koncovým segmentem a flexibilními ohyby na C-konci domény. Nicméně řada otázek, zejména ohledně mechanismu regulace specifičnosti při rozpoznávání DNA a úlohy jednotlivých částí domény v tomto procesu, zůstává stále nejasná. V rámci této diplomové práce byla studována interakce DNA-vazebné domény FOXO4 s DNA o různých sekvencích. Tento protein a řada jeho mutantů byla exprimována a purifikována a interakce s DNA byly studovány pomocí metod fluorescenční spektroskopie a resonance povrchového plasmonu. Výsledky těchto experimentů ukázaly, že nukleotidová sekvence na 5′ konci od hlavního vazebného motivu ovlivňuje stabilitu komplexu DNA-vazebné domény FOXO4:DNA. Dále se podařilo objasnit význam jednotlivých aminokyselin FOXO4, které se podílejí na vazbě na DNA, na stabilitě výsledného komplexu.
|
|
|
Ionic effects and online preconcentration techniques in separation systems
Boublík, Milan ; Zusková, Iva (vedoucí práce) ; Tůma, Petr (oponent) ; Vigh, Gyula (oponent)
Online prekoncentrační techniky v kapilární elektroforéze (CE) zvyšují citlivost detekce elektroforetických separací a jsou tak předmětem zájmu mnohých výzkumných skupin. Z tohoto důvodu je návrh nových prekoncentračních technik a jejich teoretický popis žádoucí pro jejich širší využití. Jedním z faktorů ovlivňujících separační podmínky je iontová síla separačních systémů. V rámci této disertační práce byly navrženy nové prekoncentrační techniky a popsány efekty iontové síly v separačních systémech CE a hydrofilní kapalinové interakční chromatografie (HILIC). Současně zde bylo představeno a popsáno 14 nových pI markerů pro isoelektrickou fokusaci (IEF). První část této disertační práce se zabývá návrhem nových prekoncentračních technik a jejich teoretickým popisem. Jsou zde prezentovány dvě prekoncentrační techniky. První z nich je založena na mechanismu sweepingu pomocí neutrálního komplexačního činidla, zatímco druhá využívá pH rozhraní, která jsou vytvořena systémovými zónami. Obě techniky jsou popsány jak teoreticky pomocí numerických simulací, tak experimentálně. Tyto techniky byly také aplikovány pro prekoncentraci účinné látky v komerčně dostupném léčivu a pro směs strukturně podobných analytů. Pro metodu využívající prekoncentraci pomocí systémových zón byl vytvořen diagram umožňující...
|
|
| |
|
| |
|
|
Komplexační rovnováhy beta-blokátorů v CZE
Kanizsová, Lívia ; Zusková, Iva (vedoucí práce) ; Jelínek, Ivan (oponent)
Látky využívané ve farmaceutickém průmyslu se často vyskytují ve formě směsi více isomerů s odlišnou biologickou aktivitou. V případě, že má některý isomer nežádoucí účinek, je důležité jej ze směsi oddělit a ověřit chirální čistotu léku. Kapilární zónová elektroforéza hraje důležitou roli v chirálních separacích. Pro rozdělení jednotlivých isomerů je zde využívána jejich rozdílná afinita ke komplexačním činidlům. Míru jejich interakce charakterizuje komplexační konstanta. Pro chirální separaci β-blokátorů se nejčastěji používají cyklodextriny, které mohou být neutrální nebo nabité. S β-blokátory interagují pravděpodobně prostřednictvím tvorby inkluzních komplexů. U všech studovaných β-blokátorů, kterými byly labetalol, pindolol, alprenolol a atenolol, byla úspěšně provedena enantioseparace na základní linii použitím základního elektrolytu s obsahem nabitých cyklodextrinů. Největší rozlišení píků bylo pozorováno při použití sulfatovaných cyklodextrinů.
|
|
|
Stanovení konstant stability beta-blokátorů kapilární zónovou elektroforézou
Kanizsová, Lívia ; Zusková, Iva (vedoucí práce) ; Šteflová, Jana (oponent)
Kapilární zónová elektroforéza identifikuje a stanovuje analyty na základě jejich rozdílných pohyblivostí v roztoku základního elektrolytu vystaveného působení vnějšího elektrického pole. Kromě toho je i vhodnou metodou pro stanovení disociačních a komplexačních konstant. V této práci byly jako analyty zvoleny některé adrenergní β-blokátory. β-blokátory mají ve své struktuře alespoň jedno chirální centrum a pomocí kapilární elektroforézy je možná separace jejich enantiomerů v přítomnosti vhodného chirálního selektoru. Pro enantioseparaci se nejčastěji do roztoku základního elektrolytu přidávají různě modifikované β-cyklodextriny. Mají-li enantiomery β-blokátorů různou afinitu k danému chirálnímu selektoru, budou vykazovat různou efektivní pohyblivost. Ze závislosti efektivní pohyblivosti analytu na koncentraci chirálního selektoru lze poté určit jejich konstanty stability. Klíčová slova: β-blokátory, cyklodextriny, konstanta stability, kapilární zónová elektroforéza
|
|
|
Přehled matematiky pro studium fyzikální chemie
Břížďala, Jan ; Zusková, Iva (vedoucí práce) ; Beneš, Martin (oponent)
Fyzikální chemie je disciplínou, která navazuje na poznatky z obecné chemie a pro jejíž studium je nezbytná znalost některých matematických operací. V bakalářské práci jsou prezentovány výsledky orientačního šetření, kterým byly u studentů zjišťovány znalosti vybraných témat z matematiky. Dále byl zjišťován stupeň studia, ve kterém se studenti s danými tematickými celky seznámili poprvé. Z výsledků tohoto šetření vyplynulo, že pro studenty jsou nejobtížnějšími kapitolami z matematiky právě ty, které jsou pro studium fyzikální chemie stěžejní. V další části bakalářské práce je uveden rozbor tištěných a elektronických zdrojů učiva matematiky. Nejdůležitější částí práce je samotný přehled matematických témat. Tento přehled je začleněn jak do struktury bakalářské práce, tak je rovněž přístupný přes web. A
|
host ::
RSS.