|
|
Přírodní látky v léčbě rakoviny a jejich cytotoxicita
Hájková, Tereza ; Raudenská, Martina (oponent) ; Provazník, Ivo (vedoucí práce)
Práce se zabývá problematikou přírodních látek v souvislosti s nádorovým onemocněním. Přírodní látky mají pozitivní vliv na lidský organismus a jsou schopné ovlivňovat životaschopnost a růst nádorových buněk. Hlavním mechanismem je ovlivnění mechanismů vedoucích k zahájení apoptózy nádorových buněk a zabránění další proliferace. V práci je dále rozebrána problematika využití nádorových buněčných linií ve výzkumu nádorového onemocnění. Dále jsou v práci uvedeny běžně dostupné metody pro stanovení cytotoxicity přírodních látek, přičemž pro experimentální část je vybrána metoda MTT test a systém xCELLigence pro monitorování v reálném čase. V experimentální části bude sledován mechanismus působení testované látky kapsaicin v aplikaci na prostatické buněčné linie, nádorovou PC3 a nenádorovou PNT1A.
|
|
|
Bioinformatika lidského genomu
Kupková, Karolína ; Provazník, Ivo (oponent) ; Maděránková, Denisa (vedoucí práce)
Bakalářská práce se zabývá úseky DNA obsahujícími pouze adenin a guanin. V teoretické části je popsána struktura a složení deoxyribonukleové kyseliny, chromosomů a genů. Jsou zde uvedeny základní informace o lidském a šimpanzím genomu a o konformacích řetězců obsahujících adenin s guaninem. Praktickou část tvoří program, který vyhledá požadované úseky v sekvencích, zobrazí je a uloží. Součástí práce je analýza genů společných pro člověka a šimpanze, které byly zkoumány pro stanovení náhodnosti, funkčnosti a konzervovanosti těchto úseků.
|
|
|
Neuroinformatika: metody kalibrace v multicentrické MR studii
Kovalčík, Tomáš ; Říha, Ivo (oponent) ; Provazník, Ivo (vedoucí práce)
Práce se zabývá metodami kalibrace multicentrických studii magnetické rezonance. Magnetická rezonance je jev, kdy se látce v magnetickém poli o indukci B0 dodá energie v podobě RF impulzu s Larmorovou frekvencí a tím se částice vybudí do vyšších energetických hladin. Kalibraci je možné provádět pomocí rozlišovacích a radiofrekvenčních homogenních fantomů. Dále můžeme kalibraci provádět pomocí registrace obrazů. Pro kalibraci pomocí registrace obrazů jsou v práci popsány klasické metody lineární(afinní) a nelineární. Dále jsou uvedeny simulátory, které jsou užitečné mimo jiné pro modelování různých artefaktů.
|
|
|
Security of Biometric Systems
Lodrová, Dana ; Busch, Christoph (oponent) ; Provazník, Ivo (oponent) ; Drahanský, Martin (vedoucí práce)
The main contributions of this thesis are two novel approaches for the increase of securing of biometric systems based on fingerprint recognition. The first approach is within the liveness detection and prevents the use of various fake fingers and other spoofing techniques during the capturing processes. This patented approach is based on a combination of change of papillary line color and width caused by pressing of a finger against glass plate. The resultant liveness detection unit can be integrated into an optical fingerprint sensor. The second approach is within standardization and it increases the security and interoperability of minutiae extraction and comparison process. For this purposes, I have created the methodology to determine semantic conformance rates of minutiae extractors. The minutiae extracted by the tested extractors are compared against Ground-Truth-Minutiae obtained by clustering of data provided by dactyloscopic/forensic experts. This proposed methodology is included in the ISO/IEC 29109-2 Amd. 2 WD4.
|
|
|
Binokulární vidění
Bršlicová, Tereza ; Provazník, Ivo (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se zabývá fyziologií binokulárního vidění pro získání prostorového vjemu z dvourozměrných obrázků. Práce obsahuje popis anatomie zrakového orgánu a fyziologie vidění. Dále se v práci pojednává o samotném binokulárním vidění a pojmech s ním spojených, o patologii, vyšetření a vývoji binokulárního vidění. Navazující kapitola pojednává o stereoskopii, technologii umožňující vnímat dvourozměrnou předlohu prostorově ve 3D, která je nedílnou součástí dané problematiky. Jsou zde také popsány jednotlivé technologie stereoskopické projekce, zvláště pasivní stereoskopická technologie, které je využito v praktické části práce. Praktická část práce se věnuje návrhu dynamické a statické scény pomocí dvojice identických videokamer k získání dat pro výrobu stereoskopického záznamu. Následuje popis realizace vhodných scén a popis promítání získaných scén skupině dobrovolníků metodou pasivní stereoskopické projekce. Z dotazníků je vyhodnocena kvalita prostorového vjemu.
|
|
|
Metody zpracování sekvenačních dat technologie Oxford Nanopore pro účely metagenomiky
Barilíková, Lujza ; Provazník, Ivo (oponent) ; Kupková, Kristýna (vedoucí práce)
Revolučná technológia sekvenovania od spoločnosti Oxford Nanopore Technologies – MinION, predstavuje veľkú nádej v oblasti metagenomiky. Nízka cena, produkovanie dlhých čítaní a prenosnosť, vďaka malým rozmerom, predstavuje len jednu z mnohých výhod tejto technológie. Napriek týmto benefitom je tu však nedostatok dostupných výpočtových nástrojov, ktoré by nám umožnili plne zaobchádzať s produkovanými dátami. V úvode tejto bakalárskej práce sú predstavené terajšie sekvenačné technológie so zameraním sa na technológie tretej generácie, predovšetkým na spomínané nanopórové sekvenovanie. V práci sú uvedené aj súčasné možnosti vizualizácie metagenomických dát. Hlavným cieľom tejto práce je vytvoriť algoritmus, ktorý za pomoci aplikácie metód redukcie dimenzionality priamo na surové dáta, produkované nanopórovým sekvenovaním, bude realizovať tzv. binning metagenomických vzoriek.
|
|
| |
|
| |
|
|
Detekce komplexů QRS s využitím vlnkové transformace
Kocian, Ondřej ; Provazník, Ivo (oponent) ; Kozumplík, Jiří (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá problematikou konstrukce detektoru QRS komplexů s využitím vlnkové transformace. Detekce QRS komplexů je velice významná, protože z ní lze automatizovaně získat tepovou frekvenci, popřípadě se využívá pro kompresi dat EKG signálu. Návrh detektoru lze provést mnoha způsoby, v tomto projektu byly zmíněny a následně odzkoušeny jen některé varianty. Princip navrženého detektoru počítá s rozložením signálu pomocí vlnkové transformace na jednotlivá pásma, tyto poté převádí do absolutní hodnoty, aby bylo možno účinně stanovit nadprahové výchylky signálu – předpokládané pozice QRS komplexů. Předpokládané pozice QRS ze všech pásem jsou následně mezi sebou porovnány a pokud se daná pozice vyskytne nejméně ve dvou sousedních pásmech, je uznána za právoplatný QRS komplex. K tomuto navrženému detektoru byly zmíněny ještě dvě modifikace, jejichž cíl byl zvýšit celkovou účinnost detekčního algoritmu. První z nich, využivající obálky signálu, neměla příliš pozitivní vliv na detekční účinnost. Druhá metoda, využívající kombinovaný signál ze tří pseudoortogonálních svodů, naopak vedla k navýšení detekční účinnosti. Samotný detektor a jeho případné modifikace byly nakonec odzkoušeny na signálech z knihovny CSE (na svodech II, V2 a V6).
|
|
|
Evaluation of the Wi-Fi technique for use in a navigated orthopedic surgery
Truhlář, Jindřich ; Sekora, Jiří (oponent) ; Provazník, Ivo (vedoucí práce)
Following text focuses on use of wireless technologies in OrthoPilot navigation system developed by B.Braun company. Description of OrthoPilot software is followed by overview of available wireless technologies highlighting their both advantages and disadvantages. Practical part consists of two main parts, mostly dealing with electronic circuits. First part describes development process of camera-wireless printed circuit board which substitutes currently used RS-422 cable connection between PC and stereo camera. Part of this chapter covers programming in C++ in order to make interface compatible with the rest of current OrthoPilot software. Second bigger part deals with remote controller development using prototyping board mikroMedia for XMEGA. Besides electrical circuits design, chapter describes also software part - microcontroller programming in C language. Thesis is concluded by discussing system limitations and ideas for future development.
|
host ::
RSS.