|
|
Segmentace kortikálních částí obratlů
Janštová, Michaela ; Kolář, Radim (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Práce se zabývá segmentací kortikálních částí obratlů z CT obrazových dat v programovém prostředí MATLAB. Popsána je problematika segmentačních technik, zejména metody „level-set” a její modifikace DRLSE. Tato metoda byla zvolena na základě informací získaných z článků publikovaných v odborných časopisech a také díky hojnému využití v praxi a uspokojivým výsledkům právě v oblasti segmentace kostních tkání. V závěru práce je navržená metoda testovaná na CT obrazových datech.
|
|
|
Rozšiřující modul platformy 3D Slicer pro segmentaci tomografických obrazů
Chalupa, Daniel ; Jakubíček, Roman (oponent) ; Mikulka, Jan (vedoucí práce)
Tato práce pojednává o využití strojového učení při úlohách klasifikace medicínských obrazů. Obsahuje literární rešerši pojednávající o klasických a moderních metodách segmentace obrazů. Hlavním cílem práce je navržení a vytvoření rozšíření pro platformu 3D Slicer. Rozšíření využívá strojové učení ke klasifikaci obrazů dle zadaných parametrů. Testování rozšíření probíhá na reálných tomografických obrazech z nukleární magnetické rezonance a sleduje přesnost klasifikace a využitelnost v praxi.
|
|
|
Detekce a identifikace typu obratle v CT datech onkologických pacientů
Věžníková, Romana ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Automaticka detekce a segmentace patere nebo obratlu z CT snimku je narocnym ukolem z nekolika duvodu. Jednim z duvodu jsou nejasne hranice obratlu ve snimcich a nezretelne hranice mezi jednotlivymi obratli, dale artefakty, vyskytujici se v obrazech, ale take anatomicka slozitost. Tato prace se zabyva navrhem a realizaci detekce a klasifikace typu obratle v CT snimcich onkologickych pacientu, coz pridava na slozitosti z duvodu pritomnosti deformaci nekterych obratlu. Pri samotne segmentaci obratlu je vyuzita Otsuova metoda. Detekce obratlu je zalozena na hledani hranic oddelujici jednotlive obratle vsagitalnich rezech. Pro identifikaci potom slouzi rozhodovaci stromy nebo zobecnena Houghova, pricemz jsou obratle hledany v rezech CT snimku na zaklade podobnosti tvaru s modely jednotlivych obratlu.
|
|
|
Rozpoznávání obrazů pro ovládání robotické ruky
Labudová, Kristýna ; Jakubíček, Roman (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá zpracováním snímků displeje embedded zařízení a jejich klasifikací. Je zde rozebrána problematika odstranění šumu moaré prostřednictvím filtrace ve spektru a normalizace obrazu pro další analýzu. Pro klasifikaci obrazů jsou využity detektory významných bodů a deskriptory. Hlavní důraz je kladen na detektory FAST a Harrisův detektor rohů a na deskriptory SURF, BRIEF a BRISK a jejich hodnocení z pohledu potenciálního přínosu pro tuto práci.
|
|
|
Automatická detekce osy páteře v 3D CT datech
Hříbková, Veronika ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Práce se zabývá tématem automatické detekce osy páteře v 3D CT datech. Teoretická část pojednává o základních principech zpracování obrazů a zaměřuje se na problematiku sběru a zpracování medicínských obrazových dat, obzvláště dat z rentgenové výpočetní tomografie. Celá kapitola je věnována principu tvorby CT 2D a 3D obrazů. Dále je zpracována rešerše anatomie osového skeletu se zaměřením na anatomii páteře. Druhá část práce je věnována návrhu a realizaci metody segmentace páteře s využitím prostého prahování a morfologických operací k nalezení iniciální pozice osy páteře s definicí počátku a konce osy pomocí vzájemné korelace s vytvořenými binárními maskami. Následné zpřesnění pozice páteře je provedeno segmentací páteřního kanálu pomocí metody narůstání oblastí, kde výchozí body, ležící uvnitř páteřního kanálu, jsou určeny nalezením těžiště obratle nebo Houghovou transformací.
|
|
|
Texturní analýza nádorových tkání v CT obrazových datech plic.
Šalplachta, Jakub ; Jan, Jiří (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Cílem této práce je odhalení možnosti využití metod texturní analýzy k detekci a segmentaci nádorové tkáně v CT datech plic a klasifikace viabilních oblastí nádorové tkáně. Hlavním předpokladem práce jsou rozdíly texturních vlastností (příznaků) mezi nádorem a okolními tkáněmi a změny těchto příznaků během vývoje a léčby nemoci. Práce obsahuje přehled jednotlivých metod texturní analýzy. Dále se zabývá vytvořením vlastní metody, která je tvořena vybranými metodami texturní analýzy, jejichž výstupy společně vytváří vektor příznaků (pro každý voxel obrazu získáme vektor příznaků). Ten je následně dále zpracováván pomocí metody shlukové analýzy. Obsahem práce je teoretická rešerše dané problematiky, popis návrhu vlastní metody a statistické vyhodnocení výsledků. Návrh metody je zpracován v programovacím prostředí Matlab®.
|
|
|
Segmentace medicínských obrazů s využitím grafové reprezentace
Kozlová, Dominika ; Jan, Jiří (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá grafovou metodou segmentace obrazu a jejím zdokonalením prostřednictvím znalosti tvaru objektu pro tvorbu architektury grafu (šablony). Popsány jsou základy teorie grafů, ze které grafové segmentační metody vychází. Navržený segmentační algoritmus byl realizován ve 2D provedení s grafickým uživatelským prostředím v MATLABu. Pro segmentaci objemových dat byla metoda rozšířena do 3D. Implementovaná metoda byla testována na simulovaných datech a na reálných CT a MRI snímcích obratlů a mozku. Získané výsledky byly zhodnoceny a porovnány s původní grafovou metodou bez využití šablony.
|
|
|
Adaptivní zostřování obrazu
Jakubíček, Roman ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Jan, Jiří (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce je rozborem problému a technickou zprávou k vytvořenému programu pro zvýraznění obrazů. Hlavním cílem celého procesu zpracování obrazu je adaptivní zostřování dosažené aplikací prostorově variantního lokálního konvolučního operátoru. Prostorová variantnost masky a tím stupeň ostření je určován místní směrodatnou odchylkou jasových hodnot v obraze. Rozhodnutí o ostření může být binární nebo spojité. V první části je uvedena stručná teorie k tématu. Ta je nezbytná pro další kapitoly této práce, které pojednávají o realizaci programu, popisují jednotlivé algoritmy, včetně blokových schémat a uživatelského prostředí a hodnotí dosažené výsledky včetně ukázek. V poslední kapitole se věnuji variantnosti obrázků a jejímu vlivu na kvalitu zostření a natavení parametrů procesu.
|
|
|
Aktivní kontury pro segmentaci ultrazvukových dat
Hesko, Branislav ; Jakubíček, Roman (oponent) ; Harabiš, Vratislav (vedoucí práce)
Táto diplomová práca má za úlohu implementovať metódu aktívnych kontúr pre užitie v~segmentácii ultrazvukových obrazov. Teoretická časť popisuje vlastnosti ultrazvukových obrazov, základné segmentačné prístupy a ozrejmuje princíp vybraných metód aktívnych kontúr. Existujú dve rôzne skupiny metód, metódy využívajúce gradient a metódy bez využitia gradientu. Pre porovnanie je implementovaná v praktickej časti jedna metóda z každej skupiny a následne je v časti vyhodnotenia porovnaná segmentačná účinnosť oboch metód ako aj ich vlastnosti.
|
|
|
Korekce pohybu v hrudních dynamických kontrastních CT datech
Jakubíček, Roman ; Malínský, Miloš (oponent) ; Walek, Petr (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá pružnou registrací obrazů pro korekci pohybů v 4D hrudních dynamických kontrastních CT datech. Disparitní analýzou založenou na přizpůsobené filtraci je inicializováno deformační pole určující lokální deformace, jehož hodnoty jsou poté zpřesněny optimalizačním algoritmem. Na základě charakteru pohybových zkreslení je aplikována FFD metoda s 3D geometrickou transformací B-splajn deformačním modelem. V první části je uvedena stručná teorie pro slícování obrazů. Ta je nezbytná pro porozumění dalším kapitolám této práce, které pojednávají o navržené metodě a její realizaci. Velká pozornost je věnována geometrické transformaci, která je velmi důležitou součástí procesu registrace. Popsán je zde i Nelder-Meadův algoritmus jako jedna z možných optimalizačních metod. Jsou zde uvedeny tři používané publikované algoritmy pro registraci 4D CT dat. V nadcházející kapitole jsou popsány jednotlivé dílčí části navržené pružné registrace, včetně možných problémů a jejich odstranění.
|
host ::
RSS.